ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 90

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016313	TA	6	1307	1317	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016313	TA	8	1340	1354	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016313	CTAT	3	1858	1869	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016313	CAAA	3	1986	1996	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016313	TA	6	2255	2265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016313	AAGCA	3	3148	3161	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016313	CT	6	3668	3679	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016313	CA	6	4552	4563	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016313	CCCG	3	4660	4671	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016313	CTTA	3	4976	4987	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016313	CT	6	5047	5058	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016313	GA	6	5502	5513	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016313	CTT	4	5863	5874	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016313	TCCT	3	5968	5978	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016313	AGA	5	6093	6106	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016313	TA	9	6175	6192	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016313	AAG	4	6982	6992	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016313	ATC	4	7082	7093	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016313	AAAG	3	7340	7351	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016313	TTCA	3	8314	8324	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016313	CTT	4	9320	9330	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016313	CT	6	10868	10879	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016313	TAG	5	11061	11074	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016313	AAAG	3	11446	11457	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016313	TCC	4	11860	11871	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016313	AC	6	11927	11937	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016313	TA	6	12953	12963	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016313	TA	7	13463	13475	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016313	TGGC	3	13705	13715	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016313	AAAG	3	14428	14438	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016313	AAGG	3	15570	15581	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016313	TATG	3	15608	15619	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016313	GAGG	3	17284	17295	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016313	TA	7	17758	17770	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016313	ACAG	3	18792	18802	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016313	TACC	3	20172	20183	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016313	TA	8	20639	20653	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016313	AG	6	21353	21363	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016313	AGT	4	22474	22485	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016313	TC	7	23117	23130	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016313	GA	6	23207	23217	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016313	AG	6	23297	23307	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016313	CCTTTT	3	24129	24146	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016313	AGA	4	24155	24165	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016313	TTC	4	24864	24875	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016313	GGA	4	25697	25707	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016313	GGA	4	26292	26303	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016313	TTA	4	26393	26403	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016313	TA	6	26805	26815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016313	TA	6	27457	27467	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016313	ACT	4	28380	28390	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016313	GA	6	30222	30232	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016313	AGA	4	30692	30704	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016313	CTT	4	31217	31227	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016313	ATCTC	3	31549	31563	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016313	ACT	4	32550	32561	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016313	TCTT	3	32902	32914	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016313	GAT	4	32927	32937	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016313	CTTT	3	33237	33247	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016313	CTTT	3	33751	33761	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016313	AAGA	3	34092	34103	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016313	AT	7	35040	35053	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016313	AG	7	35914	35926	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016313	GAG	4	36429	36440	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016313	AG	6	36455	36465	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016313	CTT	4	38443	38455	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016313	AT	6	39611	39621	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016313	AAGG	3	41024	41034	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016313	AGAA	3	41374	41384	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016313	GAA	4	41448	41459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016313	AGA	4	41701	41712	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016313	TC	6	42092	42102	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016313	ATCT	3	42706	42716	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016313	GGA	4	44765	44776	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016313	GAAG	3	44992	45002	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016313	CTT	5	45293	45306	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016313	TCT	4	45636	45646	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016313	GA	6	45833	45843	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016313	GTAAT	4	46369	46387	19	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
80	NC_016313	AGA	4	46524	46536	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016313	GTA	4	46864	46874	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016313	AGAA	3	47476	47487	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016313	TCTTTT	3	47698	47715	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016313	TAG	4	47800	47810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016313	CT	6	48180	48190	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016313	AAGC	3	48785	48796	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016313	CTT	4	49152	49163	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016313	CTT	5	49386	49400	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016313	TTC	4	49477	49487	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016313	GGAGA	3	49691	49705	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016313	CTT	4	49913	49924	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016313	CTT	4	50048	50058	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016313	AGA	4	50133	50145	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016313	ATC	4	51081	51092	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016313	CTT	4	52518	52529	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016313	TTTTC	3	52712	52726	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016313	CTTT	3	53711	53721	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016313	CTT	4	54277	54287	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016313	GTTA	3	54675	54685	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016313	CT	6	55305	55316	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016313	TTCT	3	55317	55328	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016313	AG	6	55534	55544	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016313	TTTAC	3	55817	55830	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016313	TCTT	3	55867	55878	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016313	TCT	4	56331	56342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016313	GGA	4	58489	58500	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016313	TGAA	3	58529	58539	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016313	TCT	4	58777	58787	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016313	AGA	4	59043	59054	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016313	GGA	4	59224	59235	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016313	AGA	4	59249	59260	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016313	GA	7	60414	60426	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016313	GCT	4	60529	60539	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016313	CT	7	60712	60725	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016313	CTTT	5	60730	60749	20	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
116	NC_016313	AG	6	61353	61363	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016313	CTTT	3	61698	61709	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016313	AAG	4	61754	61764	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016313	GAA	4	61771	61781	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016313	TA	7	62581	62594	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016313	TTCT	3	63363	63374	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016313	TAGGC	3	65754	65768	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016313	CTTT	3	65829	65840	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016313	CAA	4	66103	66114	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016313	AAAAGA	3	67335	67352	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_016313	TTC	4	67676	67687	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016313	AAAG	3	67725	67735	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016313	AG	7	68051	68064	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016313	GCA	4	68626	68637	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016313	TTG	4	69413	69424	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

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