ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 51

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016312	AAAG	3	225	236	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016312	CCTC	3	784	795	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016312	TC	6	861	871	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016312	CTT	4	1351	1363	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016312	TAGA	3	3269	3280	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016312	TA	6	4076	4087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016312	AGT	4	4655	4666	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016312	TAG	4	5429	5440	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016312	TA	6	5469	5480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016312	CT	7	6723	6735	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016312	CT	6	6877	6888	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016312	CT	6	7020	7030	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016312	CTTT	3	7366	7376	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016312	CT	6	9091	9101	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016312	AGA	4	10546	10557	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016312	AAG	4	10639	10649	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016312	GA	6	10874	10885	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016312	TA	7	10973	10986	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016312	CCT	4	11111	11121	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016312	CAAGA	4	11549	11567	19	60 %	0 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
21	NC_016312	AGA	4	11823	11834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016312	GA	6	13910	13921	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016312	AAGA	3	13936	13947	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016312	CTT	4	14029	14041	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016312	CAAAGA	3	14928	14945	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
26	NC_016312	CTT	4	15891	15902	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016312	AG	6	16345	16355	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016312	GT	6	16386	16397	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016312	AGTA	3	16451	16462	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016312	AT	6	16889	16899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016312	TA	11	17376	17396	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016312	TCT	4	17722	17732	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016312	AAGA	3	17742	17752	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016312	CAAC	3	17865	17877	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016312	TCT	4	18573	18584	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016312	TA	6	18839	18850	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016312	AAG	5	18938	18951	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016312	CTTG	4	19067	19081	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016312	CTT	4	19433	19447	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016312	CTT	4	19546	19556	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016312	GCCTA	3	21077	21091	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016312	TGAG	3	21498	21509	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016312	AGG	4	22735	22745	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016312	AT	6	24254	24265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016312	CAAA	3	24934	24945	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016312	TGTA	3	26117	26128	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016312	ATCC	3	26150	26160	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016312	TA	7	27678	27690	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016312	TA	7	28668	28680	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016312	TA	6	29071	29082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016312	GCT	4	29161	29171	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016312	GCT	4	29390	29401	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016312	TCT	4	29911	29923	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016312	CATT	3	30295	30305	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016312	GAAAGA	3	31712	31730	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
56	NC_016312	TTCT	3	32378	32389	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016312	TACC	3	32830	32842	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016312	TTTG	3	33438	33448	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016312	TGAAA	3	34780	34793	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016312	GA	6	34946	34956	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016312	CTTA	4	35466	35481	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016312	CTA	4	35906	35916	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016312	TA	6	36347	36357	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016312	AGA	4	36448	36458	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016312	TA	6	37878	37889	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016312	TTCAA	3	37910	37924	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016312	AGA	4	37940	37951	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016312	TA	7	38746	38758	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016312	TTCC	3	39580	39590	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016312	TA	6	40109	40119	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016312	CTAGT	3	40261	40274	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016312	CGTC	3	41024	41036	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016312	GTGA	3	41405	41416	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016312	AAGG	3	43154	43165	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016312	TA	7	43742	43754	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016312	TA	7	43990	44002	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016312	CTT	4	45612	45622	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016312	GA	6	45890	45900	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016312	GAG	4	45929	45940	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016312	CTA	4	46622	46632	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016312	AGGA	3	48312	48323	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016312	GA	6	48417	48427	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016312	GA	7	49076	49088	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016312	TTTTC	3	49433	49447	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016312	GAA	4	50739	50750	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016312	GAAA	3	52270	52280	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016312	CTT	4	52431	52442	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016312	AT	7	52823	52835	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016312	TTCTA	3	53267	53282	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016312	TTC	4	53555	53566	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016312	TCT	4	53716	53726	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016312	TG	6	53806	53817	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016312	AAGG	3	53842	53852	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016312	CT	6	54067	54077	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016312	CTC	4	54726	54738	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016312	AAAG	3	57171	57182	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016312	TCTCCT	3	57560	57576	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016312	ATCTC	3	59508	59521	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016312	CCTC	3	59575	59586	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016312	CCT	4	59804	59815	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016312	GAA	4	61241	61252	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016312	CTT	4	61503	61515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016312	AG	6	61686	61697	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016312	CTCCTT	3	62221	62237	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
105	NC_016312	GAG	4	62997	63007	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016312	GA	7	63212	63224	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016312	AGAGAA	3	63942	63958	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016312	GA	7	65424	65436	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016312	TAT	4	65687	65698	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016312	GA	7	67365	67377	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016312	AGA	5	67449	67463	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016312	CAAA	3	67808	67818	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016312	CAAG	3	68137	68148	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016312	AAAG	3	68214	68225	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016312	TC	6	68318	68328	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016312	GGAG	3	68791	68801	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016312	TA	6	69723	69733	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016312	CTT	4	70390	70400	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016312	AG	6	70708	70718	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016312	GA	6	70857	70867	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016312	AGA	4	71296	71308	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016312	GAGG	3	71663	71674	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016312	GA	8	71814	71828	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016312	GAG	4	71929	71940	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016312	GA	6	72987	72997	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016312	TGAA	3	73105	73115	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016312	GAG	4	73405	73416	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016312	GA	6	74249	74259	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016312	GA	7	74440	74452	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016312	GA	8	74797	74811	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016312	GA	7	75169	75181	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016312	CAG	4	75488	75498	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016312	AG	6	75791	75801	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016312	CTT	4	75834	75844	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016312	CTTTT	3	76284	76298	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016312	GA	6	76772	76782	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016312	AAAG	3	76855	76866	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016312	GA	6	76940	76950	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016312	TGAA	3	77060	77070	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016312	GA	6	77379	77389	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016312	AGAGGA	3	77820	77838	19	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_016312	GA	7	79054	79066	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016312	AG	6	79873	79883	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016312	ACTT	3	80313	80323	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016312	AT	6	81026	81037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016312	TA	6	81148	81159	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016312	AAGAG	3	81957	81971	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016312	AAGG	3	83381	83392	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016312	TA	6	83971	83982	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016312	TCCT	3	84992	85004	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016312	TC	6	86128	86138	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016312	CCT	4	86495	86505	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016312	CT	8	86664	86678	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
154	NC_016312	CTT	4	87455	87466	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
155	NC_016312	GA	6	87567	87578	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_016312	AG	6	87716	87726	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016312	CCT	4	88570	88581	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
158	NC_016312	TGAA	3	89791	89801	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_016312	TCAT	3	90258	90268	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
160	NC_016312	TA	6	91133	91144	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 51