ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 45

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016311	ACT	4	1266	1276	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016311	AAG	4	1281	1292	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016311	TTC	6	2170	2188	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
4	NC_016311	TCT	4	2301	2311	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016311	CAAAC	3	2329	2343	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016311	AAAGA	3	2851	2864	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016311	CG	6	2883	2894	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016311	TA	7	2898	2911	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016311	GA	6	2991	3001	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016311	TCT	4	3310	3322	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016311	ATGC	3	3356	3366	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016311	TAG	4	3684	3695	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016311	AG	6	3725	3736	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016311	TTCT	3	4185	4196	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016311	ACTT	3	4826	4836	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016311	GCTTT	3	5185	5198	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016311	TCT	4	5285	5296	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016311	GAA	4	5544	5554	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016311	CCCT	3	5801	5812	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016311	CTT	4	6260	6271	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016311	AT	6	6477	6488	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016311	GAA	4	7490	7500	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016311	ATG	4	8006	8018	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016311	AAAG	3	8179	8189	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016311	GACT	3	8569	8581	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016311	CCTT	3	9030	9041	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016311	TCT	4	9125	9135	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016311	AAAGG	3	9207	9221	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016311	CATCA	3	9495	9508	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016311	ATAA	3	10017	10028	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016311	AGA	5	12093	12106	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016311	CTT	4	12672	12683	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016311	CTTT	3	12888	12899	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016311	TGCC	3	13299	13310	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016311	TATG	4	14511	14526	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016311	GCG	4	15825	15835	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016311	ATA	4	17631	17642	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016311	CTT	4	18241	18252	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016311	AAG	4	19185	19196	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016311	AGT	4	20128	20139	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016311	ACT	4	20930	20941	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016311	AAG	4	21098	21108	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016311	AGT	4	21870	21880	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016311	TATT	3	22865	22876	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016311	CCT	4	22896	22906	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016311	TA	6	23342	23353	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016311	AAG	4	23637	23647	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016311	TA	6	24145	24156	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016311	ATG	4	24291	24301	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016311	ACT	4	26786	26797	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016311	AT	6	27604	27614	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016311	TA	7	28002	28014	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016311	CT	6	28809	28820	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016311	CCTT	3	32149	32161	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016311	TC	6	34996	35007	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016311	CTTT	3	35649	35660	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016311	TAAC	3	36225	36235	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016311	AGAAAG	3	36236	36253	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_016311	CT	6	36445	36455	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016311	AACC	3	36912	36922	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016311	GAA	4	37213	37223	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016311	AAAG	3	37225	37235	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016311	AGAA	3	37313	37324	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016311	TG	6	37446	37457	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016311	GAAA	5	37737	37755	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
66	NC_016311	TC	6	37920	37930	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016311	GTAAA	3	38486	38499	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016311	AGGC	3	38531	38541	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016311	TC	6	38785	38796	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016311	CT	6	38928	38938	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016311	TCTT	3	39159	39170	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016311	TC	6	40033	40043	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016311	CCT	4	40706	40716	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016311	TTAA	3	40879	40890	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016311	CT	6	40974	40985	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016311	CTTT	4	41115	41130	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016311	TC	6	41638	41648	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016311	TC	6	41909	41919	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016311	CTTTCT	3	42164	42180	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016311	CCTTG	3	42309	42322	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016311	TTTTC	3	42586	42600	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016311	TGAA	3	42719	42729	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016311	AG	6	42862	42872	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016311	CTT	4	43007	43017	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016311	CTTT	3	43394	43405	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016311	CTT	4	43417	43427	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016311	GGA	4	43572	43583	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016311	AGA	4	43597	43608	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016311	ATAG	3	43849	43859	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016311	GAA	4	44508	44520	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016311	GA	6	45213	45224	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016311	ACTT	3	47676	47686	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016311	AAAC	3	48131	48142	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016311	TA	6	48638	48648	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016311	AAAAC	3	49185	49200	16	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016311	TCT	4	49297	49307	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016311	CAGA	3	49542	49553	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016311	TAC	4	52963	52974	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016311	TA	6	53228	53238	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016311	CTA	4	53729	53740	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016311	TA	7	54237	54250	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016311	AAG	4	54446	54458	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016311	CTT	4	54683	54694	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016311	AGA	4	55143	55154	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016311	TA	6	55430	55440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016311	TTCA	3	55523	55534	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016311	TA	6	56182	56193	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016311	TCTA	3	57059	57069	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016311	CTTT	3	57145	57155	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016311	GA	6	57626	57638	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016311	GA	6	57838	57848	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016311	AAGAA	3	58776	58789	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016311	AGA	4	59068	59079	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016311	ATTCC	3	59500	59513	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016311	AT	6	60144	60155	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016311	AAAG	3	60338	60349	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016311	AAAG	3	62186	62197	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016311	CTTT	3	62907	62918	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016311	TA	6	64775	64785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016311	TAGA	3	65138	65150	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016311	CGTT	3	65632	65642	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016311	AGA	4	66043	66053	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016311	CT	7	66923	66935	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016311	CT	7	67800	67812	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016311	CTAC	3	67966	67976	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016311	GTTT	3	68543	68553	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016311	CAT	4	68562	68573	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016311	CTTT	4	69065	69080	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016311	CCTTT	3	69193	69206	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016311	AACC	3	69529	69539	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016311	TTTC	3	70598	70609	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016311	AAAG	3	71946	71957	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016311	CTAT	3	72474	72485	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016311	AAG	4	72595	72607	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016311	AGCG	3	73080	73090	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016311	GA	6	73485	73495	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016311	GAGGA	3	73536	73551	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016311	CAT	4	73726	73737	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016311	CTT	4	73916	73927	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016311	TGC	4	73947	73958	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016311	AG	6	74080	74090	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016311	GA	7	74607	74619	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016311	AT	6	75213	75223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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147	NC_016311	CTT	4	76527	76538	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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151	NC_016311	AAAG	3	79421	79431	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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161	NC_016311	TC	6	85586	85598	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
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181	NC_016311	TGAA	3	93080	93090	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
182	NC_016311	GAAA	3	93357	93368	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
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187	NC_016311	TTC	4	94544	94556	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
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191	NC_016311	CT	6	95177	95187	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
192	NC_016311	TC	7	95265	95277	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
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194	NC_016311	CTTT	3	95917	95928	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_016311	TCTT	3	96098	96110	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
196	NC_016311	GAT	4	96201	96211	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
197	NC_016311	CCT	4	96415	96426	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 45