ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016310	GAA	4	605	615	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016310	GAG	4	2019	2030	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016310	GAG	4	2079	2090	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016310	GCA	4	3394	3404	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016310	GAA	4	4051	4061	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016310	TCT	5	4805	4818	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016310	GAG	4	6787	6798	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016310	CCT	4	8226	8236	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016310	CTT	4	10029	10041	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016310	GAG	4	10422	10433	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016310	AGA	4	12407	12418	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016310	CTT	4	12812	12824	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016310	GTC	4	14275	14287	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016310	GTC	4	14542	14553	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016310	ACT	4	18181	18193	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016310	AAG	4	19408	19420	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016310	TTC	4	20442	20452	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016310	TTA	4	20658	20669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016310	CTT	4	20765	20775	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016310	CTT	4	25436	25447	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016310	TGA	4	25757	25768	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016310	GAC	4	27432	27442	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016310	AGA	4	30169	30180	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016310	CTT	4	36024	36034	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016310	TCT	4	36877	36888	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016310	AAG	4	37839	37850	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016310	CTT	4	39223	39234	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016310	CTT	4	39371	39381	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016310	CTT	4	42553	42563	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016310	TTC	4	42716	42726	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016310	AAG	4	46181	46192	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016310	AGG	4	47151	47162	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016310	TTC	4	49421	49431	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016310	AGG	4	49712	49723	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016310	CTT	4	50367	50377	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016310	TTG	4	50658	50669	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016310	AGA	4	51253	51263	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016310	CTT	4	51729	51740	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016310	GCT	4	51749	51760	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016310	TCT	4	54835	54845	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016310	GCT	4	56179	56189	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016310	AAG	4	58155	58166	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016310	TTC	4	60334	60345	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 108