ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016310	AAAG	3	94	105	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016310	GAAA	3	131	141	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016310	GAA	4	605	615	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016310	GA	8	647	661	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016310	GA	7	910	922	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016310	AGGG	3	1304	1315	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016310	ATAG	3	1573	1583	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016310	GAG	4	2019	2030	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016310	GAG	4	2079	2090	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016310	GA	7	3263	3275	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016310	GCA	4	3394	3404	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016310	TA	6	3881	3892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016310	GAA	4	4051	4061	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016310	CTTT	3	4370	4381	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016310	TCT	5	4805	4818	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016310	GGAG	3	4919	4930	12	25 %	0 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016310	TGAA	3	5169	5179	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016310	TGAA	3	5388	5398	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016310	GA	6	5650	5660	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016310	TAGA	3	6178	6188	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016310	GAG	4	6787	6798	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016310	TGAA	3	7043	7053	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016310	AG	7	7581	7595	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016310	CCT	4	8226	8236	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016310	AAAG	3	8852	8863	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016310	AGAA	4	9419	9434	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016310	AT	6	9658	9668	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016310	AGAA	3	9724	9735	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016310	AT	6	9828	9839	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016310	CTT	4	10029	10041	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016310	CT	6	10119	10129	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016310	TGAA	3	10408	10418	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016310	GAG	4	10422	10433	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016310	TGAA	3	10508	10518	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016310	TC	7	11121	11133	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016310	AG	6	12115	12125	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016310	AAGA	3	12186	12197	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016310	TC	7	12280	12292	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016310	AGA	4	12407	12418	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016310	GA	6	12564	12575	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016310	CAAA	3	12605	12617	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016310	CTT	4	12812	12824	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016310	CAAA	3	13368	13379	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016310	AAAG	3	13473	13483	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016310	AAGA	3	13558	13570	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016310	AGAA	3	14193	14203	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016310	GTC	4	14275	14287	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016310	GTC	4	14542	14553	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016310	GATC	3	14991	15002	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016310	CAAAG	3	16564	16578	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016310	TA	6	17886	17896	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016310	ACT	4	18181	18193	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016310	AAG	4	19408	19420	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016310	CACT	3	20320	20330	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016310	CTAG	3	20338	20348	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016310	TTC	4	20442	20452	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016310	TTA	4	20658	20669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016310	CTT	4	20765	20775	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016310	TAGA	3	21428	21438	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016310	AG	7	22806	22819	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016310	CT	6	23877	23887	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016310	AG	6	24781	24791	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016310	AAGG	3	24884	24895	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016310	CTT	4	25436	25447	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016310	TAGA	3	25697	25707	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016310	TGA	4	25757	25768	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016310	T	12	26785	26796	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016310	AACT	3	26863	26873	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016310	AAGA	3	27384	27396	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016310	GAC	4	27432	27442	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016310	GAAA	3	28066	28076	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016310	AT	8	28279	28294	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016310	CAAG	3	29975	29985	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016310	AGA	4	30169	30180	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016310	TA	6	30833	30844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016310	GA	6	31880	31891	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016310	CT	6	32985	32995	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016310	TCCC	3	34008	34019	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016310	AAAG	3	34475	34485	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016310	GA	7	35077	35089	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016310	CTT	4	36024	36034	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016310	AG	7	36431	36443	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016310	TCT	4	36877	36888	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016310	AAG	4	37839	37850	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016310	GA	6	38045	38055	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016310	AGGT	3	38361	38371	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016310	GA	6	38552	38562	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016310	CTT	4	39223	39234	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016310	CTT	4	39371	39381	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016310	TTTTC	3	40853	40868	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016310	AG	6	41322	41333	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016310	GAGAT	3	41832	41845	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016310	GAAA	3	42153	42164	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016310	TA	6	42276	42287	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016310	CTT	4	42553	42563	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016310	TTC	4	42716	42726	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016310	AAAG	3	44267	44277	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016310	AAGC	3	44296	44306	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016310	AAGG	3	45624	45635	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016310	AAG	4	46181	46192	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016310	GAAG	3	46296	46306	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016310	GA	6	46309	46319	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016310	CGAA	3	46867	46877	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016310	AGG	4	47151	47162	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016310	GA	6	47173	47184	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016310	TGAA	3	47252	47262	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016310	CTTT	3	47635	47645	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016310	CTTT	3	47767	47777	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016310	TTTC	3	48485	48496	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016310	TTC	4	49421	49431	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016310	AGG	4	49712	49723	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016310	CG	6	49731	49742	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016310	GCTT	3	50026	50038	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016310	CTT	4	50367	50377	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016310	TTG	4	50658	50669	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016310	GA	7	51164	51176	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016310	AGA	4	51253	51263	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016310	CAAG	3	51400	51412	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016310	AT	6	51584	51595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016310	CTT	4	51729	51740	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016310	GCT	4	51749	51760	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016310	CAAA	3	52099	52110	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016310	GA	6	53193	53204	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016310	AGAAA	6	53400	53428	29	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
125	NC_016310	GA	7	54266	54278	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016310	TCT	4	54835	54845	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016310	CATAA	3	54880	54894	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016310	GCT	4	56179	56189	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016310	AG	6	56569	56580	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016310	AAG	4	58155	58166	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016310	AAAG	3	58593	58604	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016310	TGAA	3	59046	59056	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016310	AAGGA	3	59727	59742	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016310	CGAGGA	3	60117	60133	17	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016310	TTC	4	60334	60345	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016310	CTGG	3	60637	60649	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016310	CT	7	61007	61021	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding

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