ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016309	TCTT	3	123	134	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016309	CCTT	3	392	402	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016309	CCAAGT	3	532	548	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016309	CTT	4	664	674	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016309	TTTC	3	1166	1176	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016309	TCTT	3	1303	1314	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016309	AAG	4	1560	1571	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016309	GAA	4	1638	1648	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016309	GA	6	2913	2924	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016309	AGGG	3	3049	3061	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016309	CTT	4	3420	3430	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016309	AT	6	3622	3633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016309	CTT	4	3922	3933	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016309	ACGA	3	3989	4000	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016309	TA	7	4089	4102	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016309	CGTCT	3	4271	4284	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016309	CT	6	4355	4365	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016309	CTT	4	4908	4918	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016309	GACAA	3	5132	5145	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016309	CT	14	5207	5232	26	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016309	ACCT	3	5313	5323	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016309	GCAC	3	5946	5957	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016309	AT	6	6472	6483	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016309	AG	6	6758	6768	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016309	GA	6	8493	8503	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016309	GGTT	3	8656	8667	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016309	AACTG	3	9386	9399	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016309	TA	6	9573	9584	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016309	TA	6	9677	9688	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016309	AAG	4	10062	10072	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016309	AT	6	10274	10285	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016309	CTT	4	10373	10383	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016309	GAA	4	12599	12609	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016309	CCTCT	3	12862	12876	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016309	GCTT	3	13130	13141	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016309	TC	6	13542	13552	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016309	ATTG	3	14184	14196	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016309	GCCC	3	14801	14811	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016309	CTT	4	15245	15256	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016309	AT	6	15321	15332	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016309	TC	6	16147	16157	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016309	GCCTC	3	17530	17544	15	0 %	20 %	20 %	60 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016309	CTTT	3	17879	17889	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016309	AAAG	4	18071	18086	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016309	CTTA	3	19903	19913	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016309	TC	6	20523	20533	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016309	AT	6	21692	21703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016309	TTTC	3	21965	21977	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016309	TCTT	3	21984	21995	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016309	AT	6	22191	22202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016309	AGG	4	22476	22487	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016309	GTCTG	3	22743	22756	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016309	TC	6	23781	23791	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016309	AT	7	23843	23856	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016309	TCTT	3	24091	24102	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016309	AC	6	24865	24876	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016309	TCTT	3	25020	25031	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016309	TTCA	3	26934	26945	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016309	TCC	4	27694	27705	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016309	CT	6	27724	27734	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016309	TTAC	3	28182	28192	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016309	CG	6	28336	28346	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016309	CTTA	4	28983	28998	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016309	TCT	4	29852	29864	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016309	AG	7	30234	30246	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016309	TC	7	30850	30862	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016309	ACCT	3	30863	30874	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016309	TAAGAT	3	32718	32735	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016309	GCTT	4	33324	33339	16	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016309	GA	6	33377	33387	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016309	TTTC	3	34004	34014	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016309	CCTTG	3	34592	34605	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016309	AGA	4	34655	34666	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016309	GA	7	34730	34742	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016309	GAA	4	34843	34853	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016309	GAA	4	35175	35186	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016309	AGA	4	35375	35385	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016309	TA	6	35453	35464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016309	TAAA	3	35791	35802	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016309	TTTC	3	35904	35916	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016309	TCT	4	35998	36008	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016309	GGAAA	3	38013	38027	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016309	TTCG	3	38508	38518	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016309	AAGAG	3	38625	38638	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016309	CTT	4	38994	39006	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016309	AAGT	3	39660	39671	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016309	AGA	4	40531	40541	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016309	TA	6	40952	40962	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016309	TCT	4	41026	41037	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016309	CAT	4	42090	42101	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016309	ATTC	3	42113	42123	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016309	TA	6	43625	43635	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016309	GAATT	3	46394	46407	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016309	TAT	4	46452	46463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016309	AAAG	4	48629	48643	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016309	CTT	4	48687	48698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016309	CTT	4	48790	48800	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016309	AAAG	4	48866	48881	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016309	TGAA	3	48895	48905	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016309	AG	6	49137	49147	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016309	GAA	4	49634	49644	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016309	TTC	4	50176	50187	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016309	TA	6	50525	50536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016309	TGAA	3	51706	51716	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016309	GGA	4	52022	52033	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016309	AAG	4	53042	53054	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016309	TCT	4	53248	53259	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016309	AGTC	3	53405	53416	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016309	TTTC	3	53678	53689	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016309	TCTT	3	54930	54941	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 120