ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 17

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016308	CTT	4	647	657	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016308	TG	6	708	718	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016308	TCCT	3	3204	3214	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016308	AGA	4	4067	4078	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016308	AG	6	5230	5241	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016308	AT	6	5327	5338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016308	AT	7	5448	5461	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016308	GCAA	3	5579	5589	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016308	TAC	4	5974	5984	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016308	TA	7	7008	7020	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016308	TCTT	3	7042	7053	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016308	GAG	4	7247	7258	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016308	ATG	4	8006	8018	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016308	GGTA	3	8270	8280	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016308	TA	6	8697	8707	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016308	CTTT	3	8800	8811	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016308	TAG	5	9869	9882	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016308	TTCA	3	10793	10803	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016308	AAAG	3	11728	11739	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016308	TCCTT	3	12914	12927	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016308	CA	6	13117	13128	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016308	GT	6	13551	13561	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016308	GCTAT	3	14010	14023	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016308	GTCT	3	14768	14780	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016308	GA	6	15760	15771	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016308	AG	6	15876	15886	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016308	GTA	4	17748	17759	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016308	TTTC	3	18975	18986	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016308	ATTT	3	19080	19092	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016308	AGTG	3	19477	19487	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016308	AAG	4	21643	21654	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016308	TCTT	3	21789	21799	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016308	AGA	4	22339	22349	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016308	TC	7	23021	23033	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016308	GTTTAA	3	23395	23411	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016308	GT	6	23448	23458	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016308	CAAT	3	25166	25176	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016308	AG	6	25225	25235	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016308	CTT	4	26023	26035	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016308	AAAG	4	26227	26241	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016308	CT	6	26559	26569	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016308	TC	6	26659	26670	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016308	TC	11	26765	26784	20	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
44	NC_016308	GAA	4	26907	26918	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016308	AAAT	3	27237	27248	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016308	TAGAAA	3	28195	28213	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016308	CG	6	28564	28575	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016308	AGGG	3	28618	28629	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016308	GTGGG	3	29518	29532	15	0 %	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016308	TTC	4	29694	29705	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016308	TTATA	3	30186	30199	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016308	CTT	4	32218	32230	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016308	GGGA	3	32811	32822	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016308	TA	8	33566	33580	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016308	ATAC	3	33988	33999	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016308	CTTT	3	34961	34972	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016308	AGCA	3	35555	35566	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016308	TAATA	4	35747	35766	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_016308	GA	6	35778	35788	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016308	TTTTC	3	35904	35917	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016308	T	12	36261	36272	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016308	CCT	4	37214	37224	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016308	CTTT	3	37561	37571	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016308	AAAG	3	37726	37736	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016308	CT	6	38324	38334	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016308	CTTT	3	38397	38407	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016308	GA	7	38706	38718	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016308	CAAG	3	40126	40137	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016308	CTTT	3	40192	40203	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016308	TCTT	3	40287	40298	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016308	CTT	4	40545	40555	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016308	GGTA	3	40592	40603	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016308	AAAG	3	41309	41319	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016308	TC	6	41339	41349	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016308	TC	6	41456	41466	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016308	AAAG	3	41975	41987	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016308	ATTT	3	42182	42194	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016308	AGAA	3	42384	42398	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016308	CTC	4	42550	42560	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016308	CTT	4	43592	43602	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016308	GCC	4	44168	44178	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016308	TC	6	44294	44305	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016308	TTCT	3	44532	44542	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016308	CTT	4	44665	44678	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016308	TC	6	45140	45150	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016308	GA	6	45693	45703	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016308	GAG	4	45785	45796	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016308	AT	6	46603	46614	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016308	TGAA	3	47058	47068	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016308	TTC	4	47593	47603	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016308	TGAA	3	47735	47745	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016308	AGAA	3	48595	48606	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016308	ACAG	3	49192	49203	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016308	TA	6	49299	49310	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016308	GAAA	3	49357	49367	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016308	AG	6	49369	49380	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016308	ATA	4	49446	49457	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016308	GAG	4	50596	50607	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016308	GA	8	50777	50791	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016308	TCTT	5	50967	50985	19	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
101	NC_016308	CTTTT	3	51004	51018	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016308	AGA	4	52357	52368	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016308	TCTT	4	53038	53053	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016308	CT	6	54343	54353	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016308	AAG	4	54829	54840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016308	AGA	7	55764	55784	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016308	TTTTCT	4	56597	56620	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016308	TGAA	3	57834	57844	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016308	AT	6	58801	58812	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016308	TTTTCT	3	59791	59809	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
111	NC_016308	TCT	7	59860	59879	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
112	NC_016308	TCTTT	3	60044	60058	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016308	GGTA	3	60412	60423	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016308	AG	6	60633	60643	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016308	CTTT	3	60704	60714	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016308	CTT	4	60742	60752	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016308	AGAA	3	61166	61176	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016308	GA	6	61209	61219	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016308	TTTC	3	61944	61954	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016308	GAG	4	62275	62285	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016308	GAA	4	62607	62618	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016308	GAA	5	63438	63452	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016308	TC	7	63804	63818	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016308	CTTT	3	64005	64015	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016308	AAG	4	64158	64169	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016308	ATG	4	64559	64569	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016308	CTT	4	65178	65190	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016308	TATG	3	65225	65237	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016308	TC	6	65520	65530	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016308	CCCG	3	65684	65694	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016308	CTT	4	66005	66015	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016308	TA	7	66110	66123	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016308	CCTTT	4	66447	66465	19	0 %	60 %	0 %	40 %	10 %	Non-Coding
134	NC_016308	AAAGA	4	66837	66856	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016308	GAAAAA	3	66935	66952	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
136	NC_016308	GAA	5	67040	67054	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016308	AAAGGA	3	67961	67978	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_016308	AGA	4	68087	68098	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016308	TA	7	68642	68655	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016308	AAG	4	68867	68878	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016308	TC	7	69046	69058	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016308	CTT	4	69706	69717	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016308	CCT	4	69764	69774	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
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161	NC_016308	TA	9	77716	77733	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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177	NC_016308	CTAA	3	85107	85117	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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214	NC_016308	AGCC	3	115549	115560	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 17