ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 99

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016305	AAG	4	226	237	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016305	TAC	5	634	648	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016305	GTTT	3	771	781	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016305	CTTT	3	996	1007	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016305	TA	6	1078	1091	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016305	TTCT	3	1815	1826	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016305	AGT	4	1918	1929	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016305	TA	6	2728	2739	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016305	AG	6	2795	2805	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016305	CTTT	3	4188	4200	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016305	CTT	4	4335	4346	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016305	CTTTA	3	5273	5286	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016305	GTT	4	5424	5434	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016305	AT	7	5477	5489	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016305	TAA	4	5872	5882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016305	CTA	6	6175	6191	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016305	TCT	4	6275	6286	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016305	TTA	4	6665	6675	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016305	CTA	5	6984	6997	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016305	AGA	4	8275	8286	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016305	TCTA	3	9239	9249	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016305	TAG	5	9432	9445	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016305	TA	6	9857	9868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016305	TAGA	3	10104	10115	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016305	TCCT	3	10218	10229	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016305	AGCA	3	10378	10389	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016305	T	12	10613	10624	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016305	TA	7	12211	12223	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016305	TAG	4	12605	12617	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016305	TAG	4	13390	13400	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016305	AAGAG	3	13807	13820	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016305	AAAG	4	14329	14343	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016305	TG	6	14975	14986	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016305	CTT	4	15195	15205	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016305	CT	6	16793	16803	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016305	CTTC	3	17215	17226	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016305	TTTC	3	17851	17861	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016305	CTT	4	18539	18550	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016305	CTTAT	3	18646	18661	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016305	G	12	18838	18849	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016305	AGC	4	19896	19906	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016305	TA	7	20684	20697	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016305	CAG	4	21368	21379	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016305	CGCT	3	21734	21744	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016305	TTCCT	3	21981	21995	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016305	AAGA	3	22052	22063	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016305	TCT	4	22073	22085	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016305	TAC	4	22964	22974	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016305	TCTT	3	23921	23932	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016305	AGT	5	24648	24661	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016305	TAC	4	25628	25638	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016305	TA	7	27678	27690	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016305	CTTT	3	28266	28277	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016305	GA	6	28541	28552	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016305	TA	6	29109	29120	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016305	ATG	4	31459	31470	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016305	CCA	4	31521	31532	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016305	TAT	4	31870	31880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016305	CGTTT	3	32648	32661	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016305	CCTA	3	34105	34116	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016305	CTT	4	34226	34236	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016305	GCG	4	35001	35012	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016305	AGAA	5	35424	35444	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016305	G	13	36136	36148	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016305	CTTT	3	36477	36488	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016305	AG	7	36555	36568	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016305	AGGG	3	37132	37142	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016305	CTTT	3	37422	37434	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016305	CT	6	38179	38190	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016305	AT	8	38922	38936	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016305	TAG	5	39361	39375	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016305	AGGG	3	40044	40054	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016305	TA	6	40634	40644	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016305	TA	8	40945	40961	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_016305	GTCC	3	42620	42630	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016305	AT	6	42642	42653	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016305	TCT	4	45850	45862	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016305	AATA	3	45916	45926	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016305	CCAA	3	46440	46450	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016305	TCT	4	47498	47508	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016305	GCT	4	47851	47862	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016305	TA	7	48165	48178	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016305	CT	6	48476	48487	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	35796726
84	NC_016305	AAG	4	49111	49123	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35796726
85	NC_016305	AAAG	3	49445	49456	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35796726
86	NC_016305	AAAG	3	49640	49651	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	35796726
87	NC_016305	TC	6	49732	49742	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35796726
88	NC_016305	AAAG	3	50981	50992	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35796726
89	NC_016305	ATG	4	51471	51481	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35796726
90	NC_016305	AAG	5	52103	52116	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35796726
91	NC_016305	CCCT	3	52142	52153	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	35796726
92	NC_016305	GAAA	3	52203	52214	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35796726
93	NC_016305	AAG	4	52610	52620	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35796726
94	NC_016305	GAA	4	52807	52817	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35796726
95	NC_016305	AAAG	5	53410	53430	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016305	AAAG	3	53449	53460	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016305	GAA	4	53491	53501	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016305	GGGA	3	53857	53868	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016305	GA	6	53892	53903	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016305	TGAA	3	54280	54290	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016305	GGA	4	54593	54604	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016305	AAGGAG	3	54788	54804	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016305	CTT	4	55129	55139	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016305	GA	6	55747	55757	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016305	CATA	4	55991	56006	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016305	GA	8	56668	56682	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016305	CTT	4	59092	59104	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016305	AT	6	59105	59116	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016305	TCT	5	59501	59516	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016305	AGA	4	59674	59685	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016305	GAA	5	59726	59740	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016305	CT	6	60162	60172	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016305	AAT	4	60494	60505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016305	GAA	4	60770	60780	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016305	CATTC	4	60958	60976	19	20 %	40 %	0 %	40 %	10 %	Non-Coding
116	NC_016305	CT	6	61260	61270	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016305	TC	6	62266	62276	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016305	CCT	4	63240	63250	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016305	AAAAGA	3	63373	63390	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
120	NC_016305	AGA	4	63513	63523	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016305	CTT	4	64325	64335	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016305	TCT	4	64510	64521	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016305	CTTT	3	64670	64681	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016305	TA	6	65083	65094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016305	AGG	4	65418	65429	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 99