ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 33

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016303	CTT	4	1420	1431	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016303	CTT	4	1498	1509	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016303	GA	6	2084	2095	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016303	TGAA	3	2889	2899	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016303	GA	6	3120	3130	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016303	TTTC	3	3360	3371	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016303	TTC	4	3840	3851	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016303	CTT	4	4511	4522	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016303	TCT	4	4771	4781	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016303	TA	6	5407	5418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016303	CTT	4	5798	5809	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016303	CTT	4	6289	6300	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016303	CTT	4	6388	6398	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016303	CAA	4	6514	6524	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016303	CT	6	6711	6721	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016303	GA	6	6786	6796	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016303	CTT	4	7566	7576	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016303	TTC	5	7783	7797	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016303	CTT	5	7827	7840	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016303	CCTT	3	7881	7892	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016303	AAAG	3	8206	8217	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016303	CTT	4	8417	8428	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016303	GCTT	3	8724	8734	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016303	TGAA	3	9218	9228	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016303	CTTT	3	10205	10215	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016303	GA	7	10854	10866	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016303	TCT	4	11240	11250	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016303	TCT	4	11670	11681	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016303	GA	7	11885	11897	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016303	CT	6	12419	12430	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016303	CT	6	12465	12475	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016303	TCT	4	12728	12739	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016303	TTCT	3	13072	13083	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016303	CTT	4	13251	13261	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016303	G	16	13427	13442	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016303	GA	6	13518	13528	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016303	AGTC	3	13629	13640	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016303	GCT	4	14083	14094	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016303	CTT	4	14143	14154	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016303	CTT	4	14176	14187	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016303	TTG	4	15331	15342	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016303	AAG	4	17359	17370	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016303	TC	6	17654	17664	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016303	AAG	4	17875	17886	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016303	CTT	4	19166	19177	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016303	CTT	4	19358	19368	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016303	TA	6	19623	19633	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016303	AAAG	3	19684	19695	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016303	GA	6	19871	19881	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016303	AAAGA	3	19959	19973	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016303	GA	7	20791	20806	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016303	TCG	4	21850	21861	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016303	TTC	4	21864	21875	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016303	GA	6	21955	21965	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016303	TTC	4	22513	22524	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016303	CTT	4	23072	23085	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016303	TCT	4	23541	23552	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016303	TCT	4	23772	23783	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016303	CTT	6	23858	23874	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
60	NC_016303	TTC	4	23958	23969	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016303	CCAAGT	3	24018	24034	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016303	GAA	4	24383	24395	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016303	AAAG	3	24793	24803	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016303	TCT	4	26446	26457	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016303	TTC	4	26690	26701	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016303	CTT	4	26795	26805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016303	ATTT	3	27554	27565	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016303	AGTA	3	27817	27828	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016303	CTT	5	28365	28379	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016303	TC	7	29518	29530	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016303	TGAA	3	30008	30018	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016303	AGA	4	30480	30491	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016303	ATTT	3	30798	30809	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016303	GA	6	31590	31600	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016303	GAATG	3	32124	32137	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016303	CTT	4	32281	32291	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016303	CT	6	32782	32793	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016303	GAA	4	32982	32993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016303	CTT	4	33221	33232	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016303	AGA	4	33506	33517	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016303	CTT	4	33793	33803	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016303	TCCGA	3	34780	34793	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016303	AGAA	3	35127	35137	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016303	GATA	3	35153	35164	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016303	AG	7	35215	35229	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016303	GAG	4	35297	35308	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016303	TCT	4	35721	35732	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016303	AG	6	36080	36090	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016303	GAG	4	37273	37285	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016303	CTT	4	37635	37646	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016303	CTT	4	37701	37711	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016303	GCT	4	37727	37738	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016303	AAAG	3	37841	37852	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016303	TCTGCT	3	37893	37910	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
95	NC_016303	CTT	4	38189	38200	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016303	TTTTC	3	38208	38222	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016303	CTT	4	38381	38392	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016303	TCT	4	38395	38407	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016303	CTT	4	38439	38449	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016303	CAG	4	38795	38806	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016303	TCC	4	39743	39754	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016303	AGA	4	40291	40301	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016303	TA	6	41260	41271	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016303	AAG	4	41623	41634	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016303	GAA	4	41787	41797	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016303	TTC	4	43123	43133	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016303	GTCT	3	44342	44353	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016303	CCTCT	4	44813	44831	19	0 %	40 %	0 %	60 %	10 %	Non-Coding
109	NC_016303	ATA	4	45306	45317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016303	TC	8	46377	46391	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016303	CCT	4	47219	47229	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016303	CTT	5	47912	47925	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016303	AAGC	3	48120	48131	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016303	GAA	4	49101	49112	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016303	GAAA	3	50112	50122	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016303	AGG	4	50168	50179	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016303	AGAA	3	50236	50247	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016303	TAA	4	50563	50574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016303	AT	6	50998	51009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016303	GATC	3	51126	51137	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016303	AGAA	3	51479	51490	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016303	CCT	4	52359	52370	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016303	CCTA	3	52856	52866	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016303	TACT	3	52987	52998	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016303	AGA	5	53007	53022	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016303	GAAC	3	53855	53865	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016303	TA	8	54003	54017	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016303	TAA	4	54397	54408	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016303	AAAGA	3	54991	55004	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016303	TAG	4	55088	55099	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016303	TTCT	4	55306	55320	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016303	TA	6	56409	56421	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016303	TA	7	58237	58249	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016303	TTTTC	3	58580	58593	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016303	AGA	7	59016	59036	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016303	AGG	4	59537	59548	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016303	GA	6	60316	60326	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016303	TTA	4	60531	60542	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016303	TA	9	60976	60992	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016303	GCA	4	61188	61198	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016303	GTAA	3	61546	61557	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016303	CA	6	61657	61667	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016303	GA	6	62196	62206	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016303	TC	6	62499	62509	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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147	NC_016303	GA	6	64241	64251	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016303	AGAA	3	65287	65297	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016303	TA	8	66155	66169	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_016303	GAAA	3	66456	66467	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016303	TCT	4	66611	66621	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016303	TGCC	3	66804	66814	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016303	GCC	4	67537	67547	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016303	TGAA	3	68706	68716	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016303	GA	6	68774	68784	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016303	AAGC	3	69287	69298	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_016303	TA	6	70558	70569	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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162	NC_016303	AG	8	72950	72964	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
163	NC_016303	AAAGAA	3	72977	72995	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
164	NC_016303	TA	6	76185	76195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
165	NC_016303	TA	6	76237	76247	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_016303	GAAA	3	76248	76258	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_016303	CCTT	3	77829	77839	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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172	NC_016303	CCT	4	81696	81707	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
173	NC_016303	CAAC	4	81837	81852	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
174	NC_016303	AT	6	82518	82529	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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176	NC_016303	AAAG	3	83855	83865	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
177	NC_016303	AG	6	84935	84946	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
178	NC_016303	TA	6	85429	85440	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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182	NC_016303	TA	6	87639	87650	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
183	NC_016303	ATTT	3	88373	88384	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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185	NC_016303	TTCTT	3	89310	89323	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
186	NC_016303	TA	6	90084	90095	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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195	NC_016303	AT	6	97575	97586	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
196	NC_016303	GA	6	99434	99444	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
197	NC_016303	AT	6	100489	100500	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
198	NC_016303	GAG	4	100714	100725	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
199	NC_016303	TCTT	3	100966	100977	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_016303	GA	8	101439	101453	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
201	NC_016303	TGAA	3	101862	101872	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 33