ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 92

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016301	TTTC	3	11	22	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016301	GAG	4	481	492	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016301	TGAA	3	508	518	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016301	CTTT	3	1117	1128	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016301	GAA	4	1194	1204	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016301	TTCC	3	2400	2411	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016301	TGAA	3	2796	2806	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016301	AG	6	2905	2916	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016301	AAG	4	2927	2937	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016301	TTCT	3	3450	3460	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016301	CTTTCT	3	5216	5233	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016301	TAGT	3	6623	6634	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016301	CTT	4	8056	8067	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016301	TA	8	8422	8437	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016301	AGA	4	9955	9966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016301	GAAGGA	4	10293	10315	23	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016301	GAA	4	12783	12794	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016301	CT	6	13728	13738	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016301	GAT	4	14266	14277	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016301	TC	6	15075	15085	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016301	GAA	4	16854	16864	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016301	AAG	4	16887	16898	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016301	ACTCTG	3	18027	18045	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
24	NC_016301	TCT	4	18175	18185	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016301	AGG	4	23741	23751	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016301	AGTT	4	23822	23836	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016301	CTT	4	24404	24415	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016301	TCCT	3	24497	24508	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016301	TCT	4	24560	24571	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016301	CTT	4	24606	24617	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016301	TA	8	24669	24684	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016301	GTCA	3	26389	26400	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016301	TC	7	26722	26734	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016301	CCTT	3	27063	27074	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016301	GAA	4	27485	27496	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016301	AAAGAA	3	27545	27562	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016301	TCT	4	28160	28170	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016301	CTT	4	28371	28382	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016301	CTT	4	28401	28412	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016301	TGT	4	28414	28425	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016301	CATA	3	29652	29663	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016301	TAT	4	29963	29974	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016301	AG	6	30157	30167	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016301	TTCA	3	30411	30421	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016301	TTC	4	30981	30991	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016301	TTAT	3	30993	31004	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016301	GA	6	31150	31161	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016301	AGA	4	31177	31187	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016301	TGAA	3	31386	31396	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016301	GA	6	31426	31436	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016301	GCT	4	31513	31524	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016301	TCCT	3	31596	31608	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016301	TTTC	3	31798	31808	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016301	CTT	4	32050	32060	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016301	TA	6	32408	32419	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016301	AGA	4	32441	32452	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016301	AGA	4	32970	32981	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016301	GAA	4	33155	33166	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016301	CTT	4	34614	34625	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016301	TCT	4	35037	35048	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016301	TTC	4	35445	35456	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016301	CTT	4	36309	36319	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016301	GAGGA	3	36529	36544	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016301	GAGG	3	37172	37183	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016301	AG	6	37425	37435	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016301	CTT	4	37998	38010	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016301	AAAG	3	38923	38933	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016301	AAAG	4	40508	40523	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016301	AAAG	3	40529	40541	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016301	CAAA	3	41846	41857	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016301	TA	6	42101	42111	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016301	GCT	4	42329	42339	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016301	AG	6	42950	42960	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016301	AGT	4	43291	43302	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016301	AT	6	45658	45669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016301	GTA	4	46802	46812	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016301	TA	6	46923	46933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016301	AAG	4	47031	47041	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016301	TA	6	47330	47340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016301	AT	8	47860	47874	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016301	TAGG	3	48259	48269	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016301	ACTT	3	48558	48569	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016301	TCA	4	49626	49636	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016301	CTTT	5	49939	49958	20	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016301	CT	6	50435	50447	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016301	GCTT	3	50807	50818	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016301	GCT	4	52063	52074	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016301	TA	6	52344	52355	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016301	CT	6	53161	53171	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016301	TTCA	3	53349	53360	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016301	TCG	4	53595	53606	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016301	TTTC	3	54337	54349	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016301	TTCTT	3	54678	54692	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016301	GAA	4	55283	55293	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016301	AG	6	55357	55368	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016301	GA	6	55975	55985	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016301	AGAA	3	56269	56280	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016301	TA	6	56639	56650	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016301	AAG	4	56729	56740	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016301	AAG	5	56777	56791	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016301	TAGC	3	56955	56965	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016301	CGCT	3	57199	57209	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016301	TC	6	57270	57280	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016301	AAAGA	4	58921	58940	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
105	NC_016301	AGAAA	3	59178	59191	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016301	AT	6	59413	59424	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016301	TCTT	3	61449	61460	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016301	GAG	4	61631	61642	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016301	TA	6	61881	61892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016301	GAA	4	61970	61982	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016301	CTTT	3	62075	62085	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016301	TC	7	63029	63041	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016301	CTTT	3	63218	63230	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016301	CTTT	3	63559	63570	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016301	AGAGG	3	64080	64094	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016301	CT	6	64317	64328	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016301	CTTT	3	64506	64518	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016301	AT	6	64653	64664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016301	TC	6	65058	65068	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016301	TTC	4	65291	65301	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016301	CTTT	3	65558	65570	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016301	GAA	4	66504	66516	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016301	CG	6	66821	66832	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016301	TC	6	66854	66866	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016301	TTA	4	66934	66944	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016301	TC	6	67239	67249	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016301	TC	6	67654	67664	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

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