ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 62

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016300	TA	6	86	97	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016300	AGGT	3	514	524	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016300	TAG	4	564	574	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016300	TA	7	996	1009	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016300	TA	6	1931	1941	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016300	GAAA	3	2094	2105	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016300	AG	6	2676	2686	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016300	TTC	4	2804	2815	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016300	CACC	3	3019	3030	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016300	AAGC	3	3173	3184	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016300	CAC	4	3419	3430	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016300	GTA	4	3437	3448	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016300	CTGT	3	4202	4212	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016300	TC	6	4336	4347	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016300	TA	6	6797	6807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016300	TA	6	7091	7101	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016300	TCAA	3	7532	7544	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016300	AGTT	3	7711	7721	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016300	CT	6	8184	8194	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016300	CTTG	3	8728	8738	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016300	ATCT	3	9182	9192	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016300	AAG	4	9449	9459	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016300	AGG	4	11079	11089	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016300	AGTT	4	11160	11174	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016300	CTT	4	11742	11753	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016300	TCCT	3	11835	11846	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016300	TCT	4	11898	11909	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016300	CTT	4	11944	11955	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016300	TA	8	12007	12022	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016300	GTCA	3	13727	13738	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016300	TC	7	14060	14072	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016300	CCTT	3	14401	14412	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016300	GAA	4	14823	14834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016300	AAAGAA	3	14883	14900	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016300	GA	6	16194	16204	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016300	GA	7	16577	16589	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016300	CG	6	16611	16622	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016300	TTC	4	16927	16939	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016300	AAAG	3	17872	17884	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016300	GAA	4	18141	18151	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016300	GA	6	18374	18384	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016300	GGA	4	18600	18610	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016300	AT	6	18778	18789	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016300	CCTCT	3	19348	19362	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016300	GAAA	3	19871	19882	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016300	AG	6	20403	20414	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016300	GGA	4	20553	20564	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016300	TGAA	3	20675	20685	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016300	AAGA	3	21330	21340	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016300	AAAG	3	21357	21367	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016300	CAAG	3	21981	21992	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016300	TCT	4	22699	22711	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016300	TTC	4	24498	24508	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016300	GA	8	26165	26179	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016300	AGGA	3	26194	26205	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016300	CTT	4	26597	26608	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016300	CTT	5	26651	26665	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016300	TA	6	26792	26803	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016300	CT	6	27459	27469	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016300	TTTC	3	27989	27999	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016300	TC	7	28075	28087	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016300	ACG	4	29835	29846	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016300	TGAA	3	30082	30093	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016300	AGC	4	31368	31379	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016300	TAGCT	3	32296	32309	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016300	AAGC	3	32624	32635	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016300	AG	7	32995	33007	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016300	GAAA	5	33483	33502	20	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016300	TGA	4	33808	33818	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016300	CCTA	3	35173	35183	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016300	TA	6	35570	35583	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016300	CTT	5	35608	35621	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016300	CTT	4	36401	36411	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016300	TA	6	36509	36519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016300	CTA	4	36631	36642	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016300	ACT	4	37364	37375	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016300	CAAG	3	37839	37849	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016300	GTA	4	38991	39002	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016300	AGTC	3	39075	39085	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016300	CTTT	3	39875	39887	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016300	CTT	5	40413	40427	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016300	TCGC	3	41795	41805	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016300	TAGA	3	42452	42463	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016300	CT	6	42579	42589	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016300	CTT	4	42638	42648	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016300	TA	7	42706	42718	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016300	GAA	4	42716	42727	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016300	AGA	4	43649	43660	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016300	AGG	4	44171	44182	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016300	TA	7	44510	44525	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016300	AAAGT	4	45669	45687	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
92	NC_016300	GA	6	45923	45933	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016300	AT	7	45974	45987	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016300	AGT	5	46085	46098	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016300	CTAT	3	46225	46236	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016300	AAGC	3	46318	46328	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016300	CAGT	3	46912	46922	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016300	TA	6	47176	47186	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016300	TA	8	48149	48165	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016300	AAAAG	3	48977	48990	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016300	TC	6	49444	49454	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016300	CTT	4	49890	49902	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016300	AAGG	3	50128	50139	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016300	ATCT	3	50279	50289	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016300	CT	6	50381	50392	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016300	GAAG	3	50668	50679	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016300	CCCT	3	51661	51671	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016300	AGAA	6	54074	54097	24	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016300	ACCTT	3	55325	55338	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016300	CTTT	3	56169	56179	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016300	CTTT	3	56826	56836	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016300	TCT	4	57153	57163	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016300	AG	6	57496	57506	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016300	CTG	4	57819	57829	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016300	CT	8	58420	58434	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016300	AG	6	59010	59020	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016300	CCT	4	59930	59941	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016300	TCTT	3	60254	60264	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016300	TGGC	3	60383	60394	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016300	TC	6	61732	61743	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016300	AC	6	61754	61765	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016300	TA	6	61962	61973	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016300	AGTC	3	63672	63682	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016300	GTAA	3	64578	64589	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016300	CTTAC	3	64614	64627	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016300	AAGA	4	64966	64981	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016300	TAG	5	65919	65933	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016300	CTT	4	67319	67330	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016300	GAAA	3	69328	69338	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016300	AG	6	69341	69352	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016300	TCT	5	69609	69622	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016300	CTCTTT	3	69888	69904	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
133	NC_016300	AG	6	70333	70343	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016300	AAAG	3	70428	70439	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016300	AG	6	70722	70732	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016300	CTT	4	71914	71925	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016300	TCTT	3	72542	72553	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016300	ACCT	3	72593	72604	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016300	TTTA	3	72704	72715	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016300	TCT	4	73072	73084	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016300	GCAA	3	74838	74849	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016300	TA	7	75538	75552	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016300	TTC	5	75566	75579	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016300	TA	6	77745	77755	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016300	TCCGT	3	77842	77856	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
146	NC_016300	AAG	4	77935	77946	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016300	CA	6	78781	78791	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016300	TA	7	78872	78885	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016300	TC	6	79322	79332	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016300	AAAG	3	79725	79736	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016300	GTAA	3	79749	79759	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016300	TA	6	80411	80421	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016300	TC	7	81584	81596	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
154	NC_016300	ACCT	3	82275	82287	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 62