ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 43

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016298CTT4967977110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
2NC_016298ACTT3102410351225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
3NC_016298TA6106410751250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016298CTT416491660120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
5NC_016298TCTTAT3177117881816.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
6NC_016298AGAA3213121421275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
7NC_016298ATTT3220022111225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_016298CTG527002714150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
9NC_016298TTC427912802120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
10NC_016298AAG4302530351166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016298CTT530953108140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
12NC_016298A133215322713100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_016298CTT435643574110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
14NC_016298TCTT336523663120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
15NC_016298TCT438773888120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_016298CTT440014011110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
17NC_016298CTT444764486110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_016298CTT448554866120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_016298CTTTT349724986150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
20NC_016298TCTTG450405058190 %60 %20 %20 %10 %Non-Coding
21NC_016298AT6512851391250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016298AAG4601060201166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
23NC_016298AGA4620962191166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_016298TTTA3681768281225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016298TTAAA3686468781560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_016298GGATG3822582381420 %20 %60 %0 %7 %Non-Coding
27NC_016298GA6841884281150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
28NC_016298CGAG3851885301325 %0 %50 %25 %7 %Non-Coding
29NC_016298TGAA3855485641150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
30NC_016298AT7862686381350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_016298GA6866086701150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
32NC_016298G1593079321150 %0 %100 %0 %6 %Non-Coding
33NC_016298TGCC396379648120 %25 %25 %50 %0 %Non-Coding
34NC_016298AT6971797281250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_016298TA6986198721250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_016298AG6991699271250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016298GA610374103841150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
38NC_016298GA810554105681550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
39NC_016298TCT41145111462120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
40NC_016298GA611774117841150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
41NC_016298TAT411981119911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_016298CGAA312346123571250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
43NC_016298TA612538125481150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
44NC_016298CTC41316213173120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
45NC_016298CTT51318213195140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
46NC_016298AT613505135161250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016298TTCT31361113622120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
48NC_016298TA613857138671150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
49NC_016298TTTTC31414214156150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
50NC_016298TTC41461614627120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
51NC_016298CTT41645716468120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
52NC_016298TA616602166131250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016298AAAG316633166441275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016298AG617146171561150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016298CTT51930219316150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
56NC_016298AG619531195411150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
57NC_016298ATAG419720197341550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
58NC_016298AGC420186201971233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
59NC_016298TTTTCT32034620363180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
60NC_016298TGCTT32054820562150 %60 %20 %20 %6 %Non-Coding
61NC_016298CTCTTT32106621082170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
62NC_016298TAT421954219641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_016298TTCT32211022120110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_016298AAAG322240222511275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016298AGA422317223281266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
66NC_016298TA622826228361150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_016298TCT42298122992120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
68NC_016298GAA423258232691266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016298AAG424624246351266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016298AAAGAA324774247911883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
71NC_016298GAA425384253941166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
72NC_016298TC102701327031190 %50 %0 %50 %10 %Non-Coding
73NC_016298CTTT32742227433120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
74NC_016298TCT42798627997120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
75NC_016298TAA428402284131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016298TTCG32957129581110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
77NC_016298TA630159301701250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_016298TCTT33033230343120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
79NC_016298TC73126431276130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
80NC_016298CT63129131301110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
81NC_016298AGA431552315631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016298AT631682316931250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_016298AAGA332058320691275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
84NC_016298CTTC33237832389120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
85NC_016298AAG433256332671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
86NC_016298TC63379433804110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
87NC_016298TTAAA334398344121560 %40 %0 %0 %0 %Non-Coding
88NC_016298ACT434543345531133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
89NC_016298TC73459234604130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
90NC_016298GAA435079350901266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
91NC_016298AT635291353021250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_016298AGA435454354651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
93NC_016298CT83642136435150 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
94NC_016298AAAG337994380041175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
95NC_016298CT64021540225110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
96NC_016298CCTC34033540346120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
97NC_016298GTCT34061640628130 %50 %25 %25 %7 %Non-Coding
98NC_016298CTTT34075740767110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
99NC_016298GA841052410661550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
100NC_016298AG641076410861150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
101NC_016298TTTC34171941730120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
102NC_016298TA943799438161850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
103NC_016298CTT44475644766110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
104NC_016298CTT44675346763110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
105NC_016298TA746800468131450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_016298TAAGT347256472711640 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
107NC_016298CT64853648547120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
108NC_016298GA749701497131350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
109NC_016298GAA450362503741366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
110NC_016298TTTC35060950619110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
111NC_016298TCA450708507191233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
112NC_016298AT651086510961150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_016298AGGA351338513491250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
114NC_016298GCTA351470514811225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
115NC_016298ATA452990530001166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_016298CCT45339653406110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
117NC_016298AAGG353867538771150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
118NC_016298CTTT35410154112120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
119NC_016298GATT355157551681225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
120NC_016298TA656267562781250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
121NC_016298TAG557003570161433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
122NC_016298TA658030580401150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
123NC_016298CTTA358521585311125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
124NC_016298AG659097591111550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
125NC_016298TG65943559445110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
126NC_016298AGAT359542595521150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
127NC_016298CTC46048060491120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
128NC_016298CCT46071860729120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
129NC_016298CCTCT36082560839150 %40 %0 %60 %6 %Non-Coding
130NC_016298TCCT36093260944130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
131NC_016298GAAA361167611771175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
132NC_016298TCT46204062052130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
133NC_016298AGAA362278622891275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
134NC_016298ACT562649626621433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
135NC_016298CTT46280162812120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
136NC_016298TA762889629011350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
137NC_016298AT764310643231450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
138NC_016298TTTA364411644211125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
139NC_016298TTTC36465964669110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
140NC_016298TA664758647681150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
141NC_016298TA865089651041650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
142NC_016298ACT465437654471133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
143NC_016298AG765854658661350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
144NC_016298TA667349673611350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
145NC_016298GA667573675831150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
146NC_016298CATG367616676261125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
147NC_016298AGAAA368770687831480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
148NC_016298CAAG369500695111250 %0 %25 %25 %0 %Non-Coding
149NC_016298AGC470024700351233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
150NC_016298GAAT370428704391250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
151NC_016298CAAA370619706301275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
152NC_016298TAG570654706671433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
153NC_016298CA670807708171150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
154NC_016298TC77161771629130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
155NC_016298GAAA372817728271175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
156NC_016298TA673113731231150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
157NC_016298TAG473801738121233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
158NC_016298CT67398773998120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
159NC_016298AAGA375034750451275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
160NC_016298TG67537975390120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
161NC_016298CTT47688676896110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
162NC_016298GTTTT37696676980150 %80 %20 %0 %6 %Non-Coding
163NC_016298AAGA377131771421275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
164NC_016298CTT47728577296120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
165NC_016298TA777603776151350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
166NC_016298AG677771777811150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
167NC_016298GAAA378317783271175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
168NC_016298TTAGAG378522785381733.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
169NC_016298TCT47860978619110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
170NC_016298TTGA379111791221225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
171NC_016298TA679581795911150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
172NC_016298TGAA382941829511150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
173NC_016298AGA483011830231366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
174NC_016298TTCT38443584447130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
175NC_016298TA684466844771250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
176NC_016298GAAAAG384890849061766.67 %0 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
177NC_016298AGAA485214852281575 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
178NC_016298TTTCTC38766987685170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
179NC_016298TCC48776887779120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
180NC_016298CTT48822588235110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
181NC_016298CT68842888438110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
182NC_016298CT68874888758110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
183NC_016298AACAAA388879888971983.33 %0 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
184NC_016298GAAAA389249892621480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
185NC_016298TA789565895781450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
186NC_016298CTT49049690507120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
187NC_016298TA690614906251250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
188NC_016298ATAA391010910201175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
189NC_016298TA691389914001250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
190NC_016298TTC49148391494120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
191NC_016298GA791702917141350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
192NC_016298CTT49192391934120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
193NC_016298TTC49378093791120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
194NC_016298TCT49392593936120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
195NC_016298CTT49439494405120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
196NC_016298GCTT39450594516120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
197NC_016298AAAG394962949741375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
198NC_016298TGC49679396804120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
199NC_016298CGAG397040970521325 %0 %50 %25 %7 %Non-Coding
200NC_016298CTG49718697197120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding