ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016296	AG	7	118	130	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016296	TTC	4	570	581	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016296	CAAAG	3	876	889	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016296	CTTT	3	1159	1169	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016296	AGAGGA	3	1338	1355	18	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016296	CTTT	3	1899	1909	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016296	TTC	4	2696	2707	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016296	CTA	4	2768	2779	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016296	TAC	4	3249	3259	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016296	TTA	4	3297	3308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016296	CA	6	3415	3426	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016296	CATA	3	4367	4378	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016296	AGGT	3	5335	5346	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016296	TA	6	5804	5815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016296	GCCTC	3	6310	6323	14	0 %	20 %	20 %	60 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016296	CT	6	6721	6731	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016296	CTAA	3	6963	6974	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016296	AGAA	3	7097	7108	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016296	TAC	4	7287	7297	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016296	TA	6	7443	7453	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016296	CGT	4	7922	7933	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016296	GA	6	8295	8305	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016296	AGA	4	8364	8375	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016296	AG	7	8475	8487	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016296	AGA	5	8588	8601	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016296	TAAG	3	10653	10663	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016296	GCG	4	10710	10721	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016296	TCTT	3	11479	11490	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016296	CT	6	12255	12265	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016296	CA	6	14064	14075	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016296	CGTT	3	14337	14348	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016296	CTC	4	14672	14682	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016296	CAAA	3	16069	16080	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016296	CTA	5	16210	16223	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016296	CT	6	16351	16361	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016296	AGT	4	17035	17046	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016296	AAG	4	17590	17601	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016296	CTA	4	18047	18057	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016296	AAGAA	3	18537	18551	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016296	CTTT	3	19207	19218	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016296	AAGT	3	19481	19491	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016296	TAAC	3	19767	19777	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016296	GTA	4	21125	21136	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016296	TC	6	21778	21788	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016296	CGTT	3	22128	22138	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016296	TTTAC	3	25109	25123	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016296	TTGT	3	25730	25741	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016296	TA	6	25918	25929	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016296	TTTC	3	25937	25947	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016296	TC	6	26101	26111	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016296	CTT	4	26539	26551	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016296	TTAT	3	26980	26991	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016296	GA	6	27101	27111	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016296	GA	7	27482	27494	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016296	AGAAGG	3	27707	27723	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016296	AG	6	28524	28534	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016296	T	14	28710	28723	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016296	AT	6	29486	29497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016296	TC	6	30590	30600	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016296	TC	7	30651	30663	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016296	TCT	4	31787	31797	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016296	TCTT	3	32171	32182	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016296	AGAAA	3	32368	32381	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016296	TC	6	33817	33827	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016296	TACT	3	34516	34527	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016296	ATCT	3	34617	34628	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016296	GAA	5	35089	35104	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016296	AAAC	3	35295	35306	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016296	GAAG	3	35464	35475	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016296	AGAA	3	35896	35907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016296	CTTTT	3	36571	36584	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016296	GCAA	3	38438	38449	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016296	AAGG	3	39013	39024	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016296	TA	6	39765	39776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016296	CTT	4	39970	39980	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016296	AGAA	3	40168	40179	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016296	GA	6	40783	40793	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016296	AG	6	41941	41953	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016296	CTT	4	41993	42004	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016296	CTT	4	42080	42090	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016296	GA	6	42222	42232	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016296	TA	10	42749	42770	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016296	TGAA	3	43271	43281	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016296	AAGGAG	3	44278	44294	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016296	TGAA	3	44370	44380	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016296	TA	6	44849	44860	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016296	CTTT	3	44909	44919	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016296	GA	6	45027	45037	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016296	GAG	4	45597	45608	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016296	GA	6	45644	45654	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016296	CTT	4	45970	45981	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016296	TTA	4	47657	47668	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016296	CTT	4	47674	47685	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016296	CCTT	3	48039	48050	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016296	CCAAGT	3	49067	49083	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016296	CTT	5	50303	50316	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016296	AAGTGA	3	50639	50655	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016296	GA	6	51037	51047	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016296	TTCA	3	51209	51220	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016296	AGA	4	51341	51352	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016296	TGAA	3	51916	51926	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016296	GA	6	52535	52545	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016296	AT	7	52756	52768	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016296	CTTT	3	53252	53263	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016296	GA	6	54086	54096	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016296	TGAA	3	54644	54654	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

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