ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016295	CAT	4	249	259	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016295	CTT	4	363	374	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016295	TCG	4	437	448	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016295	GCT	4	1466	1477	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016295	CTT	4	1488	1498	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016295	CTG	4	1924	1935	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016295	CTT	4	2479	2489	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016295	TA	6	3432	3443	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016295	AG	6	4187	4197	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016295	AG	6	4381	4391	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016295	TA	6	4399	4409	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016295	AT	6	4940	4951	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016295	AAAAG	3	4989	5003	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016295	TA	6	6466	6477	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016295	GAAGGA	3	7336	7352	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_016295	GGA	4	7368	7379	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016295	TCT	4	7471	7482	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016295	CTT	4	8092	8103	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016295	TCT	4	8280	8291	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016295	AG	7	8352	8364	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016295	TTCT	3	8617	8627	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016295	AAAG	3	8743	8754	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016295	AT	6	9427	9438	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016295	TCTT	4	9690	9705	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016295	TGAA	3	11123	11133	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016295	GCT	4	13115	13125	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016295	CTA	4	13508	13518	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016295	AGA	4	13545	13555	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016295	CT	6	14450	14460	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016295	TA	7	14773	14785	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016295	AT	6	14787	14798	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016295	CTT	4	15046	15057	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016295	AAG	4	15311	15321	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016295	GA	6	17306	17316	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016295	CTTA	3	17326	17337	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016295	AT	6	18183	18196	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016295	CT	6	19300	19310	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016295	AAG	4	20348	20360	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016295	GAA	4	20397	20409	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016295	TA	6	20878	20888	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016295	TCTT	3	21388	21398	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016295	TA	6	21406	21416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016295	ACAA	3	22106	22117	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016295	AG	6	23360	23371	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016295	CA	8	23726	23740	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016295	CTTT	4	24019	24033	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016295	AGGG	3	24139	24151	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016295	CTTTT	3	25860	25875	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016295	ACAAG	3	27561	27575	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016295	GA	6	27594	27604	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016295	CCTTT	3	27676	27690	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016295	AGAA	3	28015	28026	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016295	CTTT	3	29489	29500	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016295	CCTCTC	3	29647	29665	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10 %	Non-Coding
55	NC_016295	TC	6	30723	30733	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016295	TACTT	3	30910	30923	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016295	TCT	4	33013	33024	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016295	GAAA	3	33361	33371	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016295	CTT	4	34643	34654	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016295	AG	6	34757	34768	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016295	TAAC	3	35075	35085	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016295	CT	7	35132	35144	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016295	TC	6	36409	36419	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016295	ACCT	3	36426	36436	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016295	AGAA	3	36938	36949	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016295	GA	6	37005	37015	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016295	CCT	4	37180	37191	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016295	CTT	4	37816	37828	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016295	TC	7	38177	38189	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016295	CTT	4	38827	38839	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016295	CT	6	38980	38990	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016295	TCT	4	39225	39237	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016295	TCC	4	39676	39687	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016295	TTCT	3	40105	40116	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016295	TA	7	40950	40962	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016295	AGAT	3	42338	42349	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016295	CTT	4	43456	43466	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016295	ATCT	3	43537	43547	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016295	GTC	4	44361	44373	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016295	CTC	4	44840	44850	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016295	GA	7	45770	45782	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016295	TGC	4	45908	45918	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016295	CTT	4	45971	45981	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016295	TGT	4	46005	46016	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016295	AG	6	46319	46329	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016295	GA	6	46424	46434	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016295	TA	6	46495	46506	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016295	CTT	5	47371	47384	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016295	TGTCA	3	48609	48622	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016295	AAGC	3	49219	49229	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016295	ACCT	3	53759	53769	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016295	TA	6	53868	53879	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016295	CTT	4	54351	54361	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016295	CTT	4	55681	55691	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016295	TA	6	56041	56051	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016295	CAGT	3	56349	56359	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016295	GTCAA	3	56360	56373	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016295	TA	7	56555	56568	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016295	CTT	4	57262	57272	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016295	AGAGGA	3	57521	57537	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
101	NC_016295	TTTG	3	58433	58444	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016295	TTC	4	58512	58523	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016295	CTT	4	59322	59333	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016295	GAG	4	60060	60071	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding

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