ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 71

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016291	TCTCTT	3	247	264	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016291	TATC	3	850	862	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016291	AAG	4	1485	1495	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016291	TTCT	3	1626	1636	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016291	AAG	4	1921	1931	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016291	AAAG	3	1938	1948	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016291	AGG	4	2020	2032	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016291	AAAGAA	3	2115	2132	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016291	GA	6	2233	2243	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016291	GA	6	3250	3260	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016291	CT	6	4063	4074	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016291	AT	6	4877	4887	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016291	AAGA	3	4921	4932	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016291	AG	6	5516	5526	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016291	GA	6	6204	6214	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016291	TCT	4	6837	6848	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016291	TC	6	7818	7828	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016291	TCCT	3	8024	8035	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016291	AG	6	8803	8813	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016291	GCTG	3	10120	10131	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016291	TCT	4	10777	10788	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016291	TAG	4	11742	11752	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016291	TC	6	11819	11830	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016291	AT	6	14171	14181	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016291	CTTT	3	14692	14702	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016291	ACAG	3	14836	14846	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016291	AGC	4	15900	15911	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016291	TC	6	16677	16687	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016291	TC	8	17775	17789	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016291	GAAGG	4	19074	19092	19	40 %	0 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_016291	TAT	4	19587	19597	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016291	TCT	6	20019	20037	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016291	TCT	5	20935	20949	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016291	ACCC	3	22739	22749	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016291	TA	6	23779	23790	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016291	AAAG	3	26685	26695	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016291	CTT	4	26957	26969	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016291	AAGC	3	27319	27330	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016291	GAA	4	27648	27660	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016291	CTT	5	27818	27831	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016291	TA	8	28221	28236	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016291	TCT	6	29462	29479	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
43	NC_016291	CTT	4	29539	29549	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016291	CTTT	3	29951	29962	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016291	CTT	4	30098	30108	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016291	CT	6	30400	30410	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016291	TAAG	3	30828	30839	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016291	TTACC	3	31138	31151	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016291	TTGTC	3	31796	31809	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016291	TCGA	3	31905	31916	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016291	AAG	5	32608	32623	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016291	TTGT	3	33079	33090	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016291	GAA	4	34295	34307	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016291	CTT	4	34602	34613	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016291	TTGA	3	34866	34877	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016291	AG	7	34916	34928	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016291	TTTC	3	35054	35065	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016291	AAGG	3	35475	35486	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016291	CCTT	3	36921	36933	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016291	CACAA	3	37540	37554	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016291	CTG	4	38294	38304	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016291	TAC	4	38490	38501	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016291	TACT	3	39314	39325	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016291	AAGA	3	39810	39822	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016291	AAAC	3	40327	40337	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016291	ATCT	3	41048	41060	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016291	GA	8	42058	42072	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016291	TC	6	42327	42337	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016291	TTC	4	43457	43468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016291	CTA	4	43802	43812	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016291	TCT	4	44407	44417	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016291	AGCC	3	45201	45211	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016291	AAGG	3	45275	45286	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016291	GA	6	47072	47082	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016291	AAG	4	48266	48277	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016291	CTT	4	48878	48889	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016291	TC	7	49213	49225	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016291	AGAA	5	49297	49315	19	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016291	CTTGC	3	49599	49614	16	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016291	TC	6	49664	49674	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016291	TC	6	50642	50652	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016291	CTT	4	50730	50742	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016291	CTT	4	50890	50901	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016291	CTT	4	51989	52000	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016291	TTCTTT	3	52254	52272	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
86	NC_016291	GAA	4	52782	52793	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016291	TAAG	3	52897	52908	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016291	CCTCT	4	53950	53968	19	0 %	40 %	0 %	60 %	10 %	Non-Coding
89	NC_016291	TC	6	54385	54395	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016291	GGAA	3	54405	54416	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016291	GGAA	4	54753	54768	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016291	GAA	4	55039	55049	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016291	AAAG	3	55051	55061	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016291	AGAA	3	55139	55150	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016291	TG	6	55272	55283	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016291	GAAA	5	55562	55580	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
97	NC_016291	TC	6	55745	55755	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016291	CT	6	56322	56332	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016291	TGGC	3	56407	56418	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016291	CCT	4	57263	57274	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016291	AGAAA	3	57352	57366	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016291	TC	6	58120	58130	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016291	GAAA	3	58279	58291	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016291	TC	6	58409	58420	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016291	CT	6	59232	59243	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016291	AGC	4	59644	59655	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016291	TCT	4	60380	60391	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016291	TA	6	60415	60427	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016291	CTTT	3	60488	60500	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016291	TA	6	61722	61732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016291	AAAG	3	62766	62777	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016291	AAAG	3	62865	62875	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016291	TTCCT	3	63692	63705	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016291	CTGT	3	64412	64422	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016291	TAC	4	66303	66314	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016291	AAGAA	3	66541	66554	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016291	CTAG	3	67651	67661	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016291	TA	6	67977	67987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016291	GAAA	3	68000	68011	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016291	ACGG	3	68167	68179	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016291	GAA	4	68243	68255	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016291	ATTCTC	3	68412	68430	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
123	NC_016291	TA	8	68712	68727	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016291	GAA	4	69066	69076	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016291	AAG	5	70366	70379	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016291	AGA	4	70852	70863	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016291	GAA	4	71216	71226	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016291	CTT	4	72340	72352	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016291	AAG	4	72416	72427	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016291	AAAAG	3	73080	73093	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016291	AGA	4	73178	73189	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016291	AAG	4	73356	73367	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016291	CTTT	3	73829	73840	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016291	GA	6	74044	74054	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016291	TA	6	74760	74770	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016291	AT	6	74865	74875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016291	TA	6	75872	75883	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016291	AT	6	76129	76140	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016291	TA	6	76671	76682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016291	CG	6	76935	76945	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016291	TC	8	76975	76989	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016291	TCTT	6	77664	77687	24	0 %	75 %	0 %	25 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 71