ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 104

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016290	CTCCTT	3	549	565	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016290	TCTCC	3	1257	1271	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016290	CT	6	1325	1335	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016290	TTCC	3	1356	1367	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016290	CT	6	1539	1549	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016290	GA	6	1926	1936	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016290	AT	6	2574	2585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016290	TTTC	3	3235	3246	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016290	TCT	4	5097	5107	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016290	TCT	4	5144	5155	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016290	CAAG	3	5767	5778	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016290	AG	6	6244	6254	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016290	GA	6	6267	6277	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016290	GA	7	6309	6321	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016290	TCTGCT	3	6696	6712	17	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
16	NC_016290	TA	6	6722	6733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016290	AGAT	3	7076	7087	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016290	AT	6	8401	8411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016290	AT	7	10075	10088	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016290	CTT	4	10543	10555	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016290	TTTC	3	10788	10799	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016290	TA	6	10813	10824	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016290	GTA	4	12485	12496	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016290	CTT	4	14584	14595	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016290	AGGAA	3	15094	15107	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016290	CTTT	3	15924	15934	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016290	CTTT	3	16022	16033	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016290	ACTT	3	16508	16519	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016290	CTT	4	17642	17652	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016290	AT	6	18374	18385	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016290	GCT	4	19144	19155	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016290	TAA	4	19544	19554	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016290	AG	6	19556	19567	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016290	TCG	4	19617	19627	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016290	GA	7	20717	20729	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016290	AAG	4	22336	22348	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016290	AGA	4	23232	23243	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016290	CATAA	3	24312	24326	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016290	CTTT	3	24507	24517	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016290	AGA	4	24541	24551	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016290	TTAT	3	25675	25686	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016290	CTT	4	26423	26433	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016290	TTA	4	28019	28030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016290	CTA	4	28120	28131	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016290	CTTT	3	29153	29163	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016290	CTT	4	30143	30154	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016290	GAA	4	30208	30219	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016290	TTGG	3	30533	30543	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016290	AGT	4	30652	30664	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016290	GAA	4	30763	30774	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016290	AT	6	33283	33293	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016290	CCG	4	33493	33503	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016290	TTAAG	3	34765	34778	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016290	GTT	4	34865	34875	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016290	TCTTA	3	35310	35324	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016290	ACAG	3	36283	36294	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016290	GCT	4	36396	36407	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016290	AG	6	36620	36630	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016290	AT	6	36651	36664	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016290	AGA	4	38126	38138	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016290	CAGGG	3	38604	38617	14	20 %	0 %	60 %	20 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016290	GTT	4	39219	39231	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016290	CTA	4	40254	40264	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016290	CT	7	40722	40734	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016290	AAG	4	41154	41165	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016290	AAAG	3	42023	42034	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016290	AGA	4	43447	43458	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016290	AAG	4	44865	44877	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016290	TGG	4	45435	45447	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016290	TCTT	3	45494	45504	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016290	CTT	4	46600	46611	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016290	TA	6	46814	46824	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016290	GGTT	3	46832	46842	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016290	TA	6	48477	48487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016290	AG	7	48813	48826	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016290	CTAC	3	48874	48885	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016290	AGA	4	49228	49238	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016290	AACA	3	51812	51822	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016290	ACAAA	3	52265	52279	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016290	AT	7	53293	53306	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016290	TA	8	53925	53939	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016290	AAG	4	53976	53988	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016290	TCT	4	54344	54355	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016290	CTTT	3	54639	54649	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016290	AGA	4	55880	55890	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016290	TAAA	3	56829	56839	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016290	AAGC	3	56847	56858	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016290	CTTT	3	57117	57127	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016290	TA	9	57550	57567	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016290	AT	7	57857	57871	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016290	TTC	4	58012	58023	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016290	TCTA	3	59044	59054	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016290	CTTT	3	59220	59231	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016290	AGAA	3	59438	59449	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016290	CTA	4	60089	60099	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016290	AGC	4	60647	60657	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016290	TTTC	3	60677	60687	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016290	AT	8	61467	61481	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016290	TAG	4	61634	61646	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016290	AG	6	63116	63126	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016290	TCTTTG	3	63426	63443	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
102	NC_016290	CTTT	3	63479	63489	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016290	CCT	4	63823	63833	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 104