ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 68

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016289	CT	7	1174	1186	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016289	TA	6	1509	1519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016289	CCTA	3	1807	1817	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016289	AT	8	1836	1851	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016289	AG	6	2072	2082	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016289	CTTT	3	2751	2762	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016289	CT	6	2958	2968	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016289	GCTTTT	3	3470	3486	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016289	GAA	4	3649	3659	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016289	TGGC	3	5235	5245	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016289	TA	6	5578	5589	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016289	CT	7	6077	6089	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016289	AGA	5	6624	6638	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016289	TGGC	3	7099	7109	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016289	AG	6	7701	7711	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016289	TC	7	8088	8100	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016289	CTTT	3	8896	8906	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016289	CT	6	9028	9038	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016289	TGC	4	9545	9555	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016289	AGT	4	9748	9759	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016289	AGTA	3	10345	10356	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016289	TGAA	3	10790	10800	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016289	GAG	4	11082	11092	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016289	GA	6	12058	12068	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016289	GA	6	12211	12221	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016289	GA	6	12531	12541	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016289	AGAGG	3	12902	12916	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016289	TGAA	3	13312	13322	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016289	GA	6	13449	13459	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016289	GAA	4	13901	13912	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016289	CTT	4	14456	14468	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016289	GAAA	3	15217	15227	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016289	AT	6	15979	15992	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016289	TCTT	3	17721	17732	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016289	AT	6	18089	18099	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016289	TAG	4	18976	18986	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016289	TTGA	3	19003	19015	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016289	GAA	4	19342	19353	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016289	CTCAT	3	19855	19869	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016289	ACTT	3	20158	20168	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016289	AAG	4	21365	21376	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016289	AGTC	3	21455	21466	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016289	CTG	4	22007	22019	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016289	TAG	5	22292	22307	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016289	TAT	4	22825	22835	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016289	CT	6	23470	23481	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016289	AAGG	3	23637	23648	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016289	GCT	4	23811	23821	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016289	CTT	4	24015	24025	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016289	CCTC	3	24648	24659	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016289	CTT	4	24680	24691	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016289	GGTT	3	25270	25280	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016289	TA	6	25449	25460	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016289	TC	6	26602	26613	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016289	ATTC	3	26980	26991	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016289	GAAA	3	27215	27225	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016289	CAC	4	27555	27566	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016289	GAAA	3	28644	28655	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016289	TCA	4	30135	30145	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016289	TTCC	3	30270	30280	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016289	AGAGT	3	31913	31927	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016289	CT	6	33172	33182	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016289	TA	6	35568	35578	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016289	TTGA	3	35744	35754	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016289	TA	6	36982	36993	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016289	CTT	4	37914	37925	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016289	TA	7	38435	38448	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016289	CTA	6	38511	38528	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016289	AGA	4	38919	38930	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016289	TA	6	39238	39249	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016289	CT	6	41433	41444	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016289	TCT	4	41529	41540	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016289	AAAG	3	42659	42669	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016289	AG	7	45059	45073	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016289	GCAAA	3	45654	45667	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016289	GA	8	46112	46126	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016289	TTGC	3	46372	46382	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016289	GA	6	47222	47232	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016289	TTCCTT	3	47329	47346	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016289	GAG	4	47411	47422	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016289	AAG	4	48237	48247	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016289	AAAG	3	48254	48264	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016289	AGG	4	48336	48348	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016289	AAAGAA	3	48431	48448	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016289	GA	6	48549	48559	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016289	GA	6	49566	49576	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016289	CT	6	50379	50390	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016289	AT	6	51193	51203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016289	AAGA	3	51237	51248	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016289	AG	6	51832	51842	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016289	AT	6	52265	52276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016289	GAG	4	52837	52848	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016289	TCTT	3	53202	53213	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016289	TC	6	53694	53704	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016289	CG	6	53783	53794	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016289	TCTT	3	53897	53909	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016289	AGC	4	53927	53938	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016289	AG	6	54093	54103	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016289	GA	7	54282	54294	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016289	GAAA	3	54927	54937	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016289	TAAAG	3	54940	54953	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016289	CTT	4	55188	55198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016289	TTAG	3	55306	55318	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016289	CTTT	4	55599	55614	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016289	AG	6	56660	56670	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016289	CTTT	3	56709	56719	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016289	GAAA	3	56759	56769	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016289	CTT	4	56858	56868	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016289	TCT	4	57143	57155	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016289	GAG	4	57259	57270	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016289	TTA	4	57321	57331	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016289	AAAGG	3	57588	57601	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016289	CTT	4	57924	57934	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016289	TCTTTT	3	58296	58314	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
115	NC_016289	CG	6	58465	58476	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016289	TC	6	59485	59495	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016289	AAG	4	59982	59993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016289	TCT	4	60155	60166	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016289	CTTT	3	60269	60280	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016289	TTTGCT	3	62840	62858	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
121	NC_016289	GCCA	3	62939	62950	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016289	CCT	4	64603	64613	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016289	CAAA	3	65184	65194	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016289	AGA	4	65714	65724	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016289	CTT	4	65895	65906	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016289	AT	8	66127	66142	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016289	CTT	4	66363	66375	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016289	AAAGAA	5	68292	68322	31	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016289	AGAA	3	69696	69706	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016289	CTTG	3	70174	70185	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016289	GA	6	70607	70617	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016289	CAG	4	70985	70996	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016289	TCA	5	71320	71334	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016289	GA	6	71597	71607	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016289	TGAA	3	71678	71688	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016289	ACAG	3	72602	72613	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016289	AT	6	74305	74316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016289	GGAA	3	74937	74948	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016289	GAG	4	75635	75645	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016289	CTG	4	75787	75798	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016289	CTCA	3	76339	76350	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016289	CAAA	3	76489	76499	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016289	GGT	4	77511	77523	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016289	CT	6	78097	78107	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016289	TTTC	3	78582	78593	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016289	AGC	4	78666	78677	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016289	TTC	4	78804	78818	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 68