ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 69

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016287	CTT	4	39	50	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016287	GAG	4	780	791	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016287	TC	6	953	963	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016287	GT	6	1118	1129	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016287	AAAG	3	1468	1479	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016287	GAAAA	4	2983	3003	21	80 %	0 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
7	NC_016287	ATTC	3	3100	3111	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016287	TC	7	3282	3294	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016287	TTC	4	3538	3549	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016287	TGAA	3	3770	3780	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016287	TGAA	3	4009	4019	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016287	GAG	4	6653	6664	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016287	CT	6	7132	7142	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016287	AAG	4	7373	7383	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016287	TA	7	7736	7749	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016287	ACGA	3	7878	7889	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016287	GA	6	9383	9393	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016287	TGAA	3	9432	9442	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016287	AAGA	3	9632	9643	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016287	GGA	4	9964	9974	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016287	TATCT	4	10232	10251	20	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
22	NC_016287	TTCTCC	3	10948	10964	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
23	NC_016287	TGAA	3	11432	11442	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016287	AAGGAG	3	11620	11636	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_016287	GAG	4	11669	11681	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016287	CTT	4	12063	12075	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016287	TGAA	3	12672	12682	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016287	TCT	4	13091	13101	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016287	CATT	3	13157	13167	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016287	AAGGAG	3	13257	13273	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_016287	CG	6	13713	13724	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016287	GA	6	14609	14619	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016287	TA	7	15956	15969	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016287	GA	7	16559	16571	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016287	CTT	4	17769	17781	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016287	TA	6	17939	17950	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016287	GA	8	18244	18258	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016287	AAAG	3	18372	18382	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016287	TA	6	18463	18474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016287	CCTT	3	19053	19063	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016287	ATAA	3	19174	19185	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016287	GA	6	20308	20318	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016287	TTTC	3	20624	20635	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016287	AT	6	20702	20713	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016287	AAGGAG	3	21360	21376	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_016287	AAAG	3	21927	21938	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016287	TC	6	22049	22059	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016287	CCT	4	22348	22358	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016287	CTT	4	22955	22967	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016287	AAGA	3	23101	23112	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016287	TC	6	23927	23937	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016287	AAG	4	24305	24315	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016287	TGAA	3	24378	24388	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016287	GAAAG	3	24942	24956	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016287	GA	6	26145	26155	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016287	ACTT	3	26853	26863	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016287	TC	6	27184	27194	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016287	CT	10	27495	27513	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
59	NC_016287	AGAA	3	27915	27926	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016287	TC	6	28043	28053	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016287	CCT	5	28134	28148	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016287	TC	6	28178	28188	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016287	CTTTT	3	29007	29021	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016287	GAAA	3	29222	29233	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016287	CTC	4	29250	29260	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016287	AAG	4	30347	30358	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016287	CT	11	30501	30520	20	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
68	NC_016287	CTTT	3	30608	30619	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016287	TC	6	30952	30963	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016287	CTTC	3	31007	31018	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016287	GAAA	3	31237	31247	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016287	TA	6	31454	31464	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016287	AGA	4	31645	31655	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016287	TTC	4	32364	32376	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016287	CTTT	3	32528	32539	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016287	TCTT	3	32888	32899	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016287	AGAA	3	33213	33224	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016287	AAG	5	33369	33383	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016287	GAA	4	33422	33433	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016287	GA	6	33941	33952	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016287	GAAAA	3	34062	34077	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016287	TCCTTG	5	34991	35020	30	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
83	NC_016287	GAA	4	35448	35459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016287	GAA	4	35606	35616	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016287	AGA	4	35626	35637	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016287	GAA	4	36258	36269	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016287	CTC	4	36511	36522	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016287	AAGA	3	36771	36781	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016287	AAG	4	38534	38545	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016287	GAA	4	38625	38637	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016287	AGAA	3	39351	39362	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016287	TTTTC	3	39542	39556	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016287	TTCT	3	39679	39690	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016287	TTCT	3	39717	39727	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016287	CTT	4	39760	39771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016287	CTT	4	39846	39858	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016287	AT	6	39859	39870	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016287	TC	6	40367	40377	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016287	AAG	7	40606	40626	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016287	CCT	4	41541	41552	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016287	TGAA	3	42371	42381	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016287	AT	6	42654	42665	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016287	GAA	4	42865	42876	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016287	AAG	4	43168	43179	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016287	AAGA	3	44077	44088	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016287	GTCA	3	44647	44659	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016287	AT	6	44789	44800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016287	CT	6	45045	45056	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016287	CTTT	3	45228	45238	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016287	AAG	4	45340	45351	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016287	CT	6	45752	45762	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016287	CAA	4	45910	45921	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016287	AAG	4	46185	46196	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016287	AT	6	46962	46973	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016287	GAA	4	47322	47332	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016287	AAG	4	47374	47385	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016287	TCA	4	47679	47690	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016287	TA	7	47692	47705	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016287	CTC	5	48160	48174	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016287	TA	6	48718	48729	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016287	AG	7	50245	50257	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016287	TA	7	52641	52653	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016287	AAG	4	52781	52792	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016287	GAA	4	53349	53359	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016287	AGA	4	53463	53474	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016287	CT	7	54001	54013	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016287	CCTTG	3	54423	54436	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016287	TCT	4	54687	54697	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016287	TC	7	55292	55304	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016287	CATTC	4	55987	56005	19	20 %	40 %	0 %	40 %	10 %	Non-Coding
131	NC_016287	TC	7	56100	56112	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016287	CCT	4	56561	56571	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016287	AT	6	57447	57458	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016287	AGC	4	58099	58110	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016287	GAATAA	5	58274	58303	30	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016287	AGA	5	59120	59134	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016287	GAA	4	59861	59872	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016287	AAG	4	60813	60824	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016287	TTTTC	3	61325	61338	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016287	TC	6	61471	61481	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016287	GAA	5	61714	61728	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016287	TA	6	61816	61827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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176	NC_016287	CTT	4	77347	77357	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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178	NC_016287	TTTG	3	78518	78529	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
179	NC_016287	TTC	4	78597	78608	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 69