ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016286	GAA	4	1516	1527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016286	CCT	4	1953	1963	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016286	CT	7	2611	2623	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016286	CCTT	3	3793	3803	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016286	AGAA	4	3859	3874	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016286	AG	6	3977	3987	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016286	AGA	4	5639	5651	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016286	AGA	4	6806	6817	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016286	AGAGTA	3	7195	7213	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_016286	TTCG	3	8165	8175	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016286	AG	6	8759	8770	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016286	AAGG	3	8808	8820	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016286	CTTCC	3	9019	9032	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016286	TA	6	9317	9327	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016286	TA	6	11208	11218	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016286	GA	6	11272	11282	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016286	CTA	4	11703	11714	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016286	CTT	4	12141	12152	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016286	CTG	4	12193	12204	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016286	TCAA	3	12251	12262	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016286	AGA	4	13275	13285	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016286	TA	6	13298	13310	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016286	GCTT	3	14656	14668	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016286	AT	6	14976	14986	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016286	AGA	4	15054	15065	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016286	AC	8	15140	15154	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016286	AACA	3	15201	15212	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016286	TTGC	3	15868	15879	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016286	AAG	4	16158	16169	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016286	AT	7	17518	17531	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016286	TTAC	3	18291	18301	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016286	CTA	7	18363	18384	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016286	CTTT	3	19404	19415	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016286	TA	7	19435	19447	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016286	CTTT	3	19712	19724	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016286	CCCT	3	19863	19874	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016286	AAG	4	19970	19982	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016286	AGTT	3	20244	20255	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016286	ATTC	3	22121	22132	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016286	AGA	4	22477	22488	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016286	CCTT	3	22910	22920	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016286	AT	6	24281	24292	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016286	CATT	3	24326	24337	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016286	GA	6	25199	25211	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016286	AG	6	25846	25856	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016286	ATC	4	26033	26045	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016286	GAA	4	26137	26147	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016286	CTTA	3	26170	26180	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016286	AAC	4	26600	26611	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016286	CT	6	26642	26652	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016286	GT	6	26874	26885	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016286	GCT	4	27607	27618	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016286	ATCT	3	27621	27632	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016286	TTTC	3	27868	27879	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016286	AGA	4	28810	28820	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016286	AAG	4	29501	29512	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016286	TA	6	30292	30302	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016286	TTCTAA	3	30400	30418	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
59	NC_016286	AAG	4	30622	30633	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016286	CAGC	3	32960	32972	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016286	CTT	4	33231	33242	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016286	AGG	4	33880	33891	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016286	CCT	4	35686	35696	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016286	TA	6	36376	36386	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016286	TTCTA	3	36761	36775	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016286	TAAG	3	37290	37300	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016286	CTTT	3	38088	38098	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016286	AAG	4	38408	38420	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016286	GAA	4	39100	39111	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016286	TTC	4	39431	39442	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016286	AGA	4	39799	39810	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016286	TTCT	3	40222	40233	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016286	CTT	6	40371	40389	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
74	NC_016286	CTCTT	3	40676	40690	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016286	CTT	4	41846	41856	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016286	AGAGGA	3	42105	42121	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_016286	TTTG	3	43017	43028	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016286	TTC	4	43096	43107	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016286	CTT	4	43906	43917	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016286	GAG	4	44647	44658	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016286	TC	6	44820	44830	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016286	GT	6	44985	44996	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016286	AAAG	3	45335	45346	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016286	ATTC	3	46965	46976	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016286	A	12	47159	47170	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016286	AGGG	3	47573	47583	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016286	CCG	4	48582	48593	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016286	AAGC	3	49082	49092	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016286	CTTT	3	49665	49675	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016286	AAAC	3	49894	49904	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016286	CCTT	3	50272	50283	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016286	TCT	4	50364	50376	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016286	AT	6	51244	51254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016286	AAAG	3	52266	52276	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016286	TAGA	3	54371	54381	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016286	CTTT	3	54515	54525	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016286	TA	6	55079	55089	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016286	AAAG	3	55573	55583	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016286	ACTTT	3	55746	55760	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016286	TTCC	3	55957	55968	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016286	AAGTA	3	57000	57013	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016286	GGCT	3	57450	57461	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016286	CCTG	3	57906	57918	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016286	AGTCT	3	58433	58447	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016286	AT	6	59939	59950	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016286	AG	6	61193	61203	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016286	AT	7	61275	61288	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016286	ATTT	3	62675	62686	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016286	CTTT	3	64513	64523	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 103