ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 88

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016282	CTTT	3	1099	1111	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016282	CTA	4	4029	4040	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016282	TTAT	3	4236	4247	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016282	ATCC	3	4985	4995	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016282	GACCG	3	5234	5247	14	20 %	0 %	40 %	40 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016282	CTTT	3	5290	5300	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016282	CT	6	5403	5414	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016282	AGA	4	6144	6155	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016282	CAAA	3	6567	6578	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016282	TCCA	3	6976	6986	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016282	AGC	4	7145	7155	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016282	GTCT	3	8029	8040	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016282	CT	7	9497	9509	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016282	CGG	4	9542	9552	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016282	ATGA	3	9802	9813	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016282	AGAAA	3	9862	9875	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016282	CTT	4	10099	10110	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016282	AG	6	10683	10694	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016282	TTTC	3	11334	11345	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016282	AGGAAA	3	12051	12069	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_016282	AAAG	4	13069	13083	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016282	GAG	4	14962	14972	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016282	GAG	4	14995	15005	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016282	GAG	4	15028	15038	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016282	AT	7	15125	15137	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016282	TA	6	15575	15585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016282	GAAA	3	16724	16735	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016282	TAC	4	16792	16803	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016282	GAAA	3	16881	16891	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016282	TCT	4	17016	17027	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016282	TCT	4	18451	18463	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016282	AGCG	3	18472	18482	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016282	TATGA	3	20503	20516	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016282	AC	6	20833	20844	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016282	TTA	4	22083	22093	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016282	CCTC	3	22683	22694	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016282	CT	7	22709	22722	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016282	CTT	4	22799	22810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016282	GT	6	22968	22978	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016282	CTT	4	23385	23397	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016282	TC	6	23624	23635	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016282	CTTT	3	23729	23739	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016282	AAAG	3	24978	24989	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016282	AAAG	3	25386	25398	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016282	TTTG	3	25439	25450	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016282	TC	6	25491	25502	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016282	AAGA	3	27628	27639	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016282	GA	6	27756	27766	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016282	AAAG	3	28633	28643	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016282	TGACT	3	28867	28880	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016282	TA	6	29531	29542	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016282	GCA	4	30098	30109	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016282	CTTT	3	30701	30711	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016282	TGCT	3	30828	30838	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016282	AGAA	3	31304	31315	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016282	TAT	4	31575	31585	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016282	AG	7	32423	32435	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016282	GAA	4	33337	33347	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016282	TCTT	3	34585	34596	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016282	CTT	4	35002	35014	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016282	TAG	4	35162	35172	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016282	TGAA	3	35270	35280	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016282	AG	6	38088	38098	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016282	AGAA	4	39337	39351	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016282	GAAA	3	39752	39762	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016282	GT	9	40336	40352	17	0 %	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_016282	AGC	4	40753	40763	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016282	GAAA	4	42176	42190	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016282	CTTT	3	42766	42776	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016282	AT	8	42916	42930	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016282	AAAG	3	42970	42981	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016282	CAG	4	44051	44062	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016282	CTTT	4	44539	44555	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016282	GCTT	3	44704	44714	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016282	TA	6	47333	47344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016282	GAAA	3	48295	48306	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016282	AAAG	3	48362	48374	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016282	TTAT	3	49126	49137	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016282	AG	6	49302	49314	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016282	GATA	3	49704	49715	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016282	ATGT	3	50023	50033	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016282	GTA	4	51158	51169	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016282	TTGA	3	51607	51617	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016282	AGCA	3	53044	53055	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016282	TA	6	53609	53619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016282	AGA	4	54661	54672	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016282	CAAG	3	55016	55026	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016282	CT	6	55093	55103	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016282	TCCC	3	55110	55121	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016282	AT	6	55331	55341	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016282	TTC	4	55843	55854	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016282	CTTTT	3	56177	56190	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016282	AGA	4	56915	56927	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016282	TA	6	57449	57459	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016282	CT	6	57694	57704	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016282	AAG	4	58226	58236	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016282	CT	6	58831	58842	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016282	TAAGG	3	59237	59251	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016282	CTATG	3	60086	60099	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016282	AGA	4	61659	61670	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016282	AAG	4	62940	62952	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016282	TTCT	3	63186	63198	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016282	AAAG	3	63418	63428	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016282	TA	8	63501	63515	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016282	AG	6	63688	63698	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016282	TA	6	64716	64726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016282	AG	6	65518	65529	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016282	GGC	4	65688	65698	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016282	AGCC	3	65869	65879	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016282	ATG	4	67383	67393	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016282	TGAC	3	67603	67614	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016282	AT	8	69783	69797	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 88