ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 85

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016281	A	13	76	88	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016281	TC	6	289	299	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016281	AT	6	591	602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016281	AG	6	633	643	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016281	AT	6	838	849	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016281	AAAG	4	876	891	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016281	AAG	4	1477	1487	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016281	TC	7	2300	2312	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016281	TGTT	4	2626	2640	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016281	TCTTG	3	2727	2741	15	0 %	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016281	TA	13	3130	3153	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016281	TC	6	3360	3371	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016281	CAGC	3	3376	3387	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016281	GAC	4	3490	3500	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016281	TTC	4	4327	4337	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016281	CTAT	3	4923	4934	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016281	TGA	4	5083	5093	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016281	CT	6	5576	5586	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016281	CTTT	3	5871	5882	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016281	TA	6	5969	5979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016281	CTGG	3	6393	6403	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016281	GGTA	3	7223	7234	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016281	CCTTT	3	7607	7621	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016281	TTTC	3	7670	7682	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016281	CCCT	3	8709	8719	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016281	ATA	4	8835	8845	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016281	AG	6	8897	8908	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016281	CTTT	4	10487	10501	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016281	ACT	4	10756	10767	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016281	AG	6	11340	11350	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016281	CTT	4	11565	11575	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016281	TA	9	11842	11859	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016281	CA	8	12573	12588	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016281	TTC	4	13022	13032	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016281	GA	6	13183	13193	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016281	TGCA	3	13229	13239	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016281	ACTTT	3	16971	16985	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016281	ATCAT	3	17719	17733	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016281	AG	6	17928	17939	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016281	TGC	4	18017	18028	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016281	AAG	4	18800	18811	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016281	TTCG	3	20763	20773	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016281	AGA	4	22374	22385	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016281	TTTC	3	22459	22469	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016281	TACC	3	23394	23404	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016281	CTT	4	23601	23613	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016281	CT	6	25286	25296	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016281	GAAA	3	25630	25641	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016281	CT	6	27139	27149	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016281	TTC	4	27411	27421	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016281	AT	6	27998	28009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016281	TTG	4	28723	28735	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016281	TTGC	3	28994	29004	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016281	TCCT	3	29252	29263	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016281	TCTG	4	29575	29589	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016281	AT	6	30854	30865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016281	AGA	4	31143	31153	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016281	CT	6	32130	32140	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016281	GAA	4	32448	32459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016281	AGAAAG	3	33015	33031	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_016281	AT	7	35503	35516	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016281	CTTT	3	35579	35591	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016281	GA	7	36463	36475	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016281	CT	7	37706	37718	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016281	GCA	4	37923	37934	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016281	TTTA	3	38092	38103	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016281	CTTT	3	39114	39126	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016281	GCT	4	40908	40918	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016281	CTT	4	41201	41211	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016281	GAAAAA	3	41483	41500	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_016281	TTTC	3	41760	41771	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016281	CTTT	3	42217	42227	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016281	TAAG	3	43620	43630	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016281	TAAG	3	43812	43822	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016281	AGAA	3	44811	44821	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016281	AT	6	44914	44927	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016281	AGA	4	45073	45085	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016281	TCTT	3	46049	46060	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016281	ATT	4	46269	46279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016281	GAG	4	46695	46705	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016281	AGAAA	3	47607	47621	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016281	TTCT	3	47746	47756	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016281	CT	6	48051	48061	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016281	GA	6	49347	49357	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016281	TA	8	49488	49502	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016281	AGA	5	49705	49719	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016281	CTTT	3	50211	50222	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016281	TTTC	3	50248	50258	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016281	AGAA	4	50290	50304	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016281	AGG	4	50399	50410	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016281	TCT	4	50594	50604	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016281	CT	6	52465	52478	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016281	CTTT	4	52577	52592	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016281	CT	6	52776	52787	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016281	TA	6	52828	52839	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016281	AAAG	3	53202	53213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016281	CTT	4	54431	54442	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016281	CTCTT	3	55270	55283	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016281	GA	8	55486	55500	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016281	AGAGG	3	55751	55765	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016281	TGAA	3	55946	55956	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016281	AAG	4	56589	56600	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016281	GA	7	56883	56895	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016281	GA	6	57544	57554	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016281	GAAAA	3	57587	57600	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016281	AAGA	3	58358	58370	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016281	TC	7	58509	58521	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016281	AGA	4	58888	58900	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016281	AT	6	59284	59295	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016281	GA	6	59558	59568	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016281	GAGAAA	3	61003	61019	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016281	CAG	4	61819	61830	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016281	TG	6	61945	61956	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016281	GA	6	62813	62823	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016281	TA	6	62941	62952	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016281	TA	6	63148	63159	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016281	TGAA	3	63785	63795	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016281	TGAA	3	63894	63904	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016281	GAG	4	63996	64007	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016281	AG	6	64879	64889	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016281	TGAA	3	65116	65126	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016281	TTTG	3	65460	65471	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016281	AG	7	65883	65895	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016281	CTTT	3	66030	66041	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016281	AG	6	66434	66444	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016281	TTAT	3	66638	66649	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016281	AAAGG	3	67259	67272	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016281	TATC	3	67405	67416	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016281	TTTC	3	67474	67486	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016281	AAGAAT	3	67688	67704	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_016281	GA	6	68449	68459	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016281	GA	6	68492	68502	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016281	AAG	4	68700	68711	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016281	AAG	4	68814	68825	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016281	GAA	4	68859	68869	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016281	GAA	4	68873	68884	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016281	GAG	4	69628	69640	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016281	AT	6	69860	69871	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016281	TC	7	69989	70001	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016281	AAGA	4	72017	72031	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_016281	CTTT	4	72489	72504	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016281	TCCT	3	73339	73350	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016281	TTCTCC	3	73434	73450	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
144	NC_016281	TC	6	73532	73542	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 85