ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 98

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016280	TTTAA	3	1959	1972	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016280	TCTT	3	3067	3078	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016280	AGT	5	3279	3292	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016280	AAGT	4	3488	3503	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016280	CTG	4	4871	4881	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016280	CT	6	6821	6831	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016280	CTTA	3	6894	6906	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016280	AAAG	3	6917	6929	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016280	TA	6	7758	7768	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016280	GTT	5	8143	8157	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016280	CAT	4	8762	8773	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016280	AAAG	3	8845	8857	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016280	TGGGA	3	9175	9190	16	20 %	20 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016280	GCA	4	10261	10271	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016280	TTTTG	3	10288	10303	16	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016280	TC	6	10428	10439	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016280	CTTT	3	10782	10792	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016280	TA	7	11802	11814	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016280	AT	7	12134	12146	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016280	AG	6	13726	13737	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016280	CTT	4	15674	15684	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016280	ATCT	3	16360	16371	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016280	TTCT	3	16494	16505	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016280	TCTT	4	17063	17078	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016280	AATC	3	17209	17220	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016280	CAAAA	3	18860	18873	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016280	TAAAG	3	19129	19143	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016280	AT	6	19520	19531	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016280	TCAT	3	19729	19739	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016280	GGACT	3	19805	19818	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016280	AAATC	3	20689	20702	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016280	ATAAG	3	20994	21008	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016280	CTTAG	3	22615	22628	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016280	GT	6	24930	24941	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016280	CTTT	3	25083	25095	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016280	ACTT	3	27635	27646	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016280	ATG	5	27917	27931	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016280	CTT	4	28299	28311	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016280	GA	7	28372	28385	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016280	AG	6	28595	28605	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016280	ACAT	3	30065	30076	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016280	TGT	4	30814	30825	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016280	TCT	4	32257	32267	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016280	CTC	4	32537	32547	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016280	GAAA	3	33424	33435	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016280	TAA	4	34317	34328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016280	TAGG	3	34495	34506	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016280	AGT	4	34755	34766	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016280	AG	6	34769	34779	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016280	CCT	4	35287	35298	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016280	TA	6	35298	35309	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016280	CCTT	3	35564	35574	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016280	TTAA	3	36154	36165	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016280	TAATG	3	36794	36808	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016280	TAC	4	37942	37952	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016280	AAG	4	38195	38206	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016280	TTCTT	3	38368	38381	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016280	AGG	4	38429	38440	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016280	TCA	5	38763	38776	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016280	TG	6	39959	39970	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016280	GA	7	40225	40237	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016280	TC	6	40476	40486	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016280	TAT	4	40818	40830	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016280	TA	6	41245	41255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016280	CTTG	3	41510	41521	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016280	AAAG	3	42028	42040	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016280	TAT	4	42108	42118	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016280	TA	6	42953	42963	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016280	TCT	4	44457	44468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016280	AAG	4	44653	44664	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016280	TCTG	3	45174	45185	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016280	TTGCT	3	47377	47390	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016280	TA	6	47411	47422	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016280	AT	6	48007	48018	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016280	TCC	4	48893	48904	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016280	TCTT	4	49898	49913	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016280	AT	6	50390	50401	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016280	CT	6	51293	51303	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016280	GAA	4	51451	51462	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016280	GAA	4	51966	51976	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016280	CTTT	3	52216	52227	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016280	CG	6	52308	52319	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016280	GAA	4	53098	53109	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016280	AGC	4	53616	53627	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016280	AAG	4	53659	53670	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016280	AAGA	3	54030	54042	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016280	TCC	4	55158	55168	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016280	AGC	4	55862	55873	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016280	GC	6	56458	56468	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016280	TA	7	56472	56484	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016280	GAAA	3	57109	57119	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016280	AAG	4	57764	57775	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016280	AT	6	57949	57960	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016280	AAG	4	58364	58375	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016280	CAAGA	4	58415	58433	19	60 %	0 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
96	NC_016280	AGA	4	59127	59138	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016280	AAGAAT	3	59183	59199	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016280	TC	6	59442	59452	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016280	TACT	3	59658	59668	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016280	AAAG	3	60558	60568	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016280	TA	6	60625	60636	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016280	TCACC	3	61859	61873	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016280	AT	6	63057	63068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016280	CTT	4	63548	63560	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016280	TA	7	63680	63693	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016280	AACA	3	65292	65303	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016280	AG	7	65373	65385	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016280	CTT	4	65566	65576	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

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