ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 10

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016278	TCT	4	1430	1440	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016278	CAT	4	2745	2757	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016278	ATG	4	4340	4351	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016278	CTA	4	9704	9714	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016278	GAA	4	14323	14333	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016278	AGA	4	14937	14949	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016278	GCA	4	18609	18621	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016278	CTT	4	19860	19872	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016278	TTA	4	20608	20618	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016278	AGA	4	23156	23168	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016278	CTT	5	27913	27926	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016278	TCT	4	32168	32179	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016278	TCT	5	33020	33035	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016278	GAG	4	33773	33785	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016278	TCT	6	40402	40419	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
16	NC_016278	AGT	4	45247	45258	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016278	AGA	4	45643	45654	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016278	CAA	4	47176	47188	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016278	CTT	4	50988	51000	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016278	TCT	4	56029	56040	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016278	CTT	4	56077	56088	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016278	AGA	4	59817	59827	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016278	CTT	4	61856	61867	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016278	AGG	4	62525	62536	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016278	GGA	4	67343	67355	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016278	ATA	4	67665	67675	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016278	AGA	4	68194	68205	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016278	GAA	4	69467	69477	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016278	AAG	4	72942	72952	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016278	AGC	4	73971	73983	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016278	CTT	4	74379	74390	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016278	TTA	4	74789	74800	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016278	AAG	4	76450	76461	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016278	AAG	4	76968	76979	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016278	AGA	4	77356	77367	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016278	GAG	4	77413	77423	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016278	AAG	4	78184	78196	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016278	AGA	6	78856	78874	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_016278	TTA	4	85447	85457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016278	TCT	4	86415	86425	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016278	AGA	5	86696	86709	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016278	CTT	4	87761	87773	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016278	GAG	4	89511	89521	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016278	TTC	4	90709	90720	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016278	TCT	4	92919	92929	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016278	GAG	4	93527	93538	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016278	AGA	4	97266	97276	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016278	GAA	4	97483	97493	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016278	GAG	4	98686	98696	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016278	CCT	4	101806	101816	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016278	CCT	4	102304	102315	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016278	AAG	5	104048	104062	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016278	CTT	4	104869	104880	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016278	AAG	4	105772	105783	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016278	AGA	4	108947	108957	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016278	TCT	5	112354	112368	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016278	AGA	4	115012	115023	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016278	AGA	4	117759	117770	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016278	AGG	4	118883	118894	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016278	CCT	4	118967	118978	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016278	CCT	4	119139	119149	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016278	CCT	4	121114	121124	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016278	CTA	4	123395	123407	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016278	GCT	4	124832	124843	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 10