ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 83

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016277	CTT	4	2119	2129	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016277	AAG	4	4657	4669	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016277	GAA	4	8132	8142	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016277	CAG	4	8742	8753	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016277	GGA	4	9054	9065	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016277	TCT	4	10080	10091	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016277	AGA	4	12280	12292	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016277	GTA	4	15209	15220	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016277	TCT	4	17857	17868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016277	AGA	4	19333	19344	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016277	TTC	4	19392	19402	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016277	CTT	4	19787	19798	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016277	GTA	4	22595	22605	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016277	AGT	4	22618	22630	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016277	AGA	4	25008	25019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016277	AGA	4	25321	25331	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016277	CTC	4	25534	25544	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016277	AAG	5	25638	25652	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016277	CTT	4	26146	26156	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016277	TCT	4	26483	26493	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016277	GAA	4	28757	28768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016277	AGT	4	30437	30447	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016277	ACC	4	30978	30989	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016277	CTC	4	31016	31026	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016277	TAC	5	33613	33627	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016277	GAA	4	35500	35512	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016277	ACT	4	40453	40464	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016277	TTC	4	40851	40863	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016277	CTT	4	44292	44304	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016277	CTT	4	44430	44441	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016277	GAG	4	49661	49672	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016277	AGC	4	51661	51672	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016277	AAG	4	55222	55233	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016277	GCC	4	62688	62698	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016277	CGC	4	64479	64489	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016277	GCC	4	67885	67895	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016277	TCA	4	68351	68362	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016277	GAA	4	68740	68750	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016277	GCC	4	70637	70647	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016277	TAT	4	72624	72634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016277	CTT	4	73237	73248	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 83