ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 83

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016277	TA	6	144	154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016277	AT	6	1010	1021	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016277	AAAG	3	1128	1139	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016277	AAGA	3	1942	1952	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016277	TGAA	3	1970	1980	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016277	CTT	4	2119	2129	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016277	CTTCT	4	2406	2426	21	0 %	60 %	0 %	40 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016277	CAAG	3	2777	2787	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016277	AAG	4	4657	4669	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016277	ACTT	3	4680	4690	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016277	TAAA	3	5225	5237	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016277	AG	6	5461	5471	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016277	TACG	3	6386	6397	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016277	GAA	4	8132	8142	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016277	CAG	4	8742	8753	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016277	GGA	4	9054	9065	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016277	TCT	4	10080	10091	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016277	ACGT	3	10196	10206	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016277	TTCT	3	11099	11109	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016277	CGAA	3	11668	11678	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016277	TC	7	11913	11925	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016277	AGA	4	12280	12292	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016277	TC	6	12339	12349	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016277	AT	6	13236	13247	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016277	CTTG	3	13589	13601	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016277	GTA	4	15209	15220	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016277	CT	6	16132	16143	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016277	AAGT	3	16215	16225	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016277	ACTT	4	17092	17106	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016277	TCT	4	17857	17868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016277	TGAA	3	18019	18029	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016277	AGA	4	19333	19344	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016277	TTC	4	19392	19402	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016277	CTT	4	19787	19798	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016277	AAAG	3	21233	21243	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016277	TGGT	3	21436	21447	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016277	CT	6	21695	21705	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016277	CTTTT	3	21769	21783	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016277	GTA	4	22595	22605	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016277	AT	6	22607	22617	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016277	AGT	4	22618	22630	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016277	GAAA	3	22747	22757	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016277	AT	6	22945	22956	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016277	AGA	4	25008	25019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016277	AGA	4	25321	25331	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016277	CTC	4	25534	25544	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016277	AAG	5	25638	25652	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016277	GCTT	3	26033	26045	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016277	CTT	4	26146	26156	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016277	TCT	4	26483	26493	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016277	CTTA	3	27344	27355	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016277	CTTA	3	27358	27369	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016277	TTTTGC	3	27962	27978	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016277	AAAC	3	28098	28109	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016277	GAA	4	28757	28768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016277	AAAG	3	28996	29007	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016277	TG	6	29239	29249	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016277	TCGA	3	29807	29817	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016277	TTTC	3	30121	30131	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016277	AGT	4	30437	30447	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016277	AT	12	30687	30709	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016277	ACC	4	30978	30989	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016277	CTC	4	31016	31026	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016277	TTGC	3	31353	31364	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016277	CTTT	3	33523	33534	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016277	TAC	5	33613	33627	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016277	AG	6	34333	34344	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016277	CTTT	3	34465	34475	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016277	CTTT	4	35369	35384	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016277	GAA	4	35500	35512	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016277	CATAC	3	36761	36774	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016277	AG	6	37199	37209	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016277	CATA	3	37434	37444	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016277	CT	6	37713	37723	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016277	TA	6	38336	38346	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016277	TC	6	39416	39426	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016277	TTGG	3	39538	39548	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016277	TTTA	3	39695	39706	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016277	CTAT	3	40217	40227	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016277	ACT	4	40453	40464	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016277	TTC	4	40851	40863	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016277	GCTA	3	42078	42090	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016277	AACC	3	43718	43729	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016277	CTT	4	44292	44304	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016277	CTT	4	44430	44441	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016277	TA	6	44594	44605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016277	AG	6	44616	44626	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016277	CT	7	45154	45167	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016277	TAAG	4	45314	45329	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016277	GTGA	3	45335	45347	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016277	CTTT	3	45503	45513	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016277	TCTA	3	46154	46166	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016277	TTCGT	3	46419	46432	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016277	AG	6	47026	47037	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016277	AAGT	3	47147	47157	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016277	GA	6	47293	47303	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016277	TA	7	47457	47470	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016277	AAAG	3	48464	48475	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016277	GACT	3	48770	48781	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016277	CTTT	3	49105	49116	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016277	TGAA	3	49325	49335	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016277	GA	6	49523	49533	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016277	GAG	4	49661	49672	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016277	TCTG	3	51515	51525	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016277	AGC	4	51661	51672	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016277	TA	7	53504	53517	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016277	AAAT	3	54188	54199	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016277	AAG	4	55222	55233	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016277	ACTC	3	55444	55454	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016277	TAAAG	3	55902	55915	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016277	AACT	3	56014	56025	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016277	TATGA	3	57284	57297	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016277	TA	7	58214	58226	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016277	CTTT	3	58823	58834	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016277	AT	11	59584	59604	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016277	GACA	3	60578	60589	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016277	TC	7	62165	62177	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016277	CT	6	62194	62205	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016277	GCC	4	62688	62698	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016277	AAAG	3	63197	63208	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016277	AGAA	4	63348	63363	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016277	CGC	4	64479	64489	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016277	CTTG	3	64976	64987	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016277	TA	7	66399	66412	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016277	AAGG	3	66505	66515	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016277	GCC	4	67885	67895	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016277	TC	7	68201	68214	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016277	TCA	4	68351	68362	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016277	GAA	4	68740	68750	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016277	ACCC	3	68984	68994	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016277	GA	6	69345	69355	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016277	TA	6	69804	69815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016277	CAAA	3	69930	69940	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016277	TA	7	70044	70057	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016277	AC	6	70426	70436	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016277	GCC	4	70637	70647	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016277	CTTT	3	71443	71454	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016277	AATCT	3	72233	72246	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016277	TAAA	3	72582	72593	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016277	TAT	4	72624	72634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016277	TA	6	73136	73146	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016277	CTT	4	73237	73248	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016277	AG	6	73276	73286	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 83