ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 74

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016276	TC	6	147	157	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016276	TC	7	1192	1204	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016276	TC	7	1224	1236	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016276	CT	7	1292	1304	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016276	AGA	5	1841	1855	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016276	TGAA	3	2290	2300	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016276	GA	6	2372	2382	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016276	AAGGAG	3	2811	2827	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016276	AT	6	3435	3446	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016276	GA	6	3996	4006	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016276	CTTT	4	4158	4174	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016276	CG	6	4337	4348	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016276	TA	6	4354	4364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016276	TC	6	5300	5310	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016276	CCT	4	5344	5355	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016276	TCTCCT	3	5759	5775	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016276	AGC	5	6004	6017	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016276	CTTT	3	7055	7065	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016276	TATAA	3	7245	7259	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016276	AAAG	3	7271	7281	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016276	CTTC	3	7584	7595	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016276	AGAT	3	8887	8898	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016276	AT	7	10033	10046	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016276	TCAT	3	10749	10760	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016276	ATTTAA	3	10958	10976	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_016276	TA	6	11906	11917	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016276	ATC	4	12621	12631	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016276	GAAAA	3	12848	12861	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016276	AT	6	12937	12948	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016276	CTTT	3	13175	13185	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016276	GAG	4	13868	13878	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016276	TA	6	14653	14664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016276	AG	6	14759	14769	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016276	TA	6	15072	15082	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016276	CTT	4	16710	16722	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016276	CT	6	16888	16899	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016276	TACTA	3	17192	17205	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016276	CTTT	3	17364	17374	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016276	TA	6	17612	17622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016276	CTTA	3	18681	18693	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016276	GGAT	3	18920	18931	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016276	CTTT	4	18960	18975	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016276	AT	6	19451	19462	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016276	AAGA	3	20751	20762	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016276	AAGA	3	22020	22031	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016276	CTTT	3	22469	22480	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016276	CTTT	3	22943	22954	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016276	AG	6	23032	23042	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016276	CTT	4	23948	23960	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016276	CCT	4	24129	24140	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016276	CAAG	3	24808	24818	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016276	AGG	4	25901	25912	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016276	TA	7	26587	26600	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016276	AAG	5	26866	26881	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016276	AAG	5	27346	27359	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016276	CTTTT	3	29018	29031	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016276	GA	6	29646	29657	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016276	CTT	4	30045	30056	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016276	TTTGCT	3	30179	30197	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
60	NC_016276	GA	6	30224	30235	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016276	ATG	4	30919	30929	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016276	CCTT	3	31622	31632	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016276	TCT	5	31720	31733	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016276	AAGA	3	33627	33638	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016276	AT	6	33670	33681	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016276	CTTT	3	34007	34018	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016276	TAC	4	35122	35133	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016276	TAAG	3	35826	35837	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016276	CT	6	36492	36502	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016276	ACT	5	36595	36608	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016276	TGA	4	37050	37060	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016276	AG	6	37288	37298	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016276	CCAG	3	37885	37895	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016276	TAAG	3	38100	38112	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016276	GAA	4	38484	38495	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016276	TCTT	3	38963	38974	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016276	ATTTG	4	39631	39649	19	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_016276	TTGA	3	40027	40037	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016276	GCA	4	41176	41188	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016276	ACT	5	41550	41565	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016276	GAA	4	42643	42655	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016276	TTTC	3	43376	43387	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016276	CTTG	3	43948	43958	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016276	GAAC	3	45040	45050	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016276	ACTT	3	45708	45718	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016276	AGCT	3	46947	46958	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016276	ACT	4	48014	48024	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016276	TA	6	48081	48091	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016276	AT	7	48149	48161	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016276	GA	6	48195	48205	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016276	TCT	4	48931	48941	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016276	GA	6	49360	49370	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016276	CTA	4	49699	49709	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016276	CTA	4	51027	51037	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016276	AAAAG	3	51714	51727	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016276	CTT	4	52264	52275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016276	CCCT	3	52526	52537	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016276	CTTA	3	53948	53959	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016276	TA	6	53984	53995	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016276	TCTTG	3	55583	55596	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016276	AATA	3	55646	55656	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016276	TA	6	56472	56482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016276	ATGCA	4	56501	56519	19	40 %	20 %	20 %	20 %	5 %	Non-Coding
104	NC_016276	AG	6	57547	57557	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016276	AAAG	3	57741	57752	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016276	AG	6	57900	57910	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016276	AGA	4	58488	58499	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016276	CTT	4	58599	58609	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016276	CTTT	3	58850	58861	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016276	GAA	4	59007	59018	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016276	TACT	3	59850	59861	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016276	CTGT	3	61422	61432	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016276	AGA	4	61502	61513	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016276	GCT	4	62412	62423	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016276	GAAA	3	63493	63504	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016276	AT	6	63889	63899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016276	CCCA	3	63975	63986	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016276	GAAA	3	64121	64131	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016276	AACA	3	64739	64750	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016276	AT	6	65071	65082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016276	AAC	4	65096	65106	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016276	TCTA	3	66079	66089	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016276	AAG	4	67559	67571	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016276	TGAA	3	68008	68018	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016276	GCTT	3	68261	68271	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016276	CTT	4	68274	68284	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016276	TA	6	68332	68342	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016276	TA	8	68636	68651	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016276	TA	9	68781	68798	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
130	NC_016276	CTAA	4	68910	68924	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016276	AGTAT	3	69684	69698	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016276	CCTT	3	70507	70518	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016276	ATA	4	71512	71523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016276	TC	7	71734	71746	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016276	TCT	4	71919	71929	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016276	TCTT	3	72069	72080	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016276	CTT	4	72158	72168	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016276	AGA	5	72570	72583	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016276	CT	6	72637	72648	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016276	AAGGAG	3	73752	73770	19	50 %	0 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
141	NC_016276	GAA	4	73968	73979	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016276	TTC	4	74206	74217	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016276	TTA	4	74761	74772	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016276	TCTT	3	74798	74809	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016276	TGT	4	74971	74982	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016276	CTT	4	75401	75412	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016276	TCT	5	75535	75548	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
148	NC_016276	TGT	4	75558	75569	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016276	TCT	4	75725	75735	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016276	ATCTT	4	76205	76224	20	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
151	NC_016276	GA	6	76825	76835	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016276	GA	6	76888	76898	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016276	CAAG	3	76942	76954	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
154	NC_016276	AG	6	77446	77456	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016276	TTTTC	3	77509	77523	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
156	NC_016276	CT	7	77654	77666	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 74