ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 95

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016275	AGTT	3	889	900	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016275	AGA	5	1032	1045	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016275	GAAA	3	1707	1717	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016275	ATAG	3	1823	1833	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016275	TA	8	1971	1985	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016275	AGTAT	3	2473	2486	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016275	TA	6	3391	3401	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016275	CCG	4	4994	5005	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016275	AGA	4	5802	5813	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016275	TTCC	3	5949	5960	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016275	AAAG	3	6511	6521	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016275	TTCT	3	6533	6545	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016275	AAC	4	8842	8853	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016275	CCTTG	3	9106	9119	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016275	TC	6	9289	9299	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016275	GAG	4	9807	9817	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016275	CAA	4	10086	10097	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016275	AAT	4	10116	10126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016275	AAG	4	10588	10599	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016275	GAA	4	10602	10613	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016275	TTGG	3	10762	10773	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016275	GA	7	10950	10962	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016275	TGAA	3	11190	11200	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016275	AAGT	3	11518	11528	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016275	TCT	4	12426	12436	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016275	CCT	4	12506	12517	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016275	TGAA	3	13152	13162	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016275	GA	6	15256	15266	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016275	TC	6	16532	16542	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016275	TC	7	17577	17589	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016275	TC	7	17609	17621	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016275	CT	7	17677	17689	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016275	AGA	5	18226	18240	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016275	TGAA	3	18675	18685	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016275	GA	6	18757	18767	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016275	CTTT	4	19343	19358	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016275	AGA	4	19393	19404	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016275	GGA	4	19576	19587	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016275	AGA	4	19601	19612	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016275	ATAG	3	19853	19863	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016275	GAA	4	20512	20524	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016275	CTTTCT	3	21399	21416	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
43	NC_016275	TCTT	4	21501	21516	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016275	TCTT	3	21766	21778	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016275	CT	6	21921	21932	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016275	AGAGAA	3	22299	22315	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016275	TCT	4	22415	22426	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016275	TA	6	23131	23141	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016275	TA	6	23538	23548	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016275	CAA	4	24732	24744	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016275	CTA	4	25221	25231	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016275	TC	6	25435	25445	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016275	GTTAGA	3	25696	25713	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016275	GA	6	26066	26076	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016275	AAAGT	4	26110	26129	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016275	CA	6	26180	26190	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016275	GAAA	3	27026	27038	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016275	CCAT	3	27799	27810	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016275	TTCT	4	27930	27945	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016275	CTA	4	28140	28150	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016275	CCCT	3	29496	29507	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016275	CTCA	3	29688	29700	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016275	AGA	4	31309	31319	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016275	CTA	4	32055	32065	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016275	AGA	4	33321	33332	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016275	ATG	4	33735	33745	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016275	CTT	4	34017	34029	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016275	GA	6	34217	34227	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016275	TAA	4	34792	34802	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016275	CTTT	3	35137	35147	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016275	CT	7	35606	35618	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016275	TTCTCC	3	35703	35719	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
73	NC_016275	AAAG	3	37442	37452	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016275	CAGA	3	38038	38049	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016275	TC	6	38175	38185	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016275	ATTC	3	38531	38543	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016275	CT	6	38601	38611	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016275	CAAG	3	39533	39543	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016275	TA	6	40230	40240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016275	TAGA	3	40467	40479	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016275	TTAC	3	40493	40503	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016275	TTC	4	40505	40517	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016275	GAA	4	40957	40968	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016275	ACT	4	42015	42026	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016275	CTC	4	42403	42414	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016275	TGATG	3	42567	42580	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016275	TAAA	3	42767	42778	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016275	TAAG	3	43044	43055	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016275	TC	7	43676	43688	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016275	CCT	4	43733	43743	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016275	CCTC	3	44393	44403	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016275	GAA	4	44713	44724	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016275	AAAGAA	3	45203	45220	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_016275	ATTCT	3	45367	45381	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016275	ATA	4	45382	45392	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016275	ATTCT	3	45618	45632	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016275	AG	6	46956	46967	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016275	CTTT	3	47258	47269	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016275	GTG	4	47392	47403	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016275	GCAA	4	48565	48579	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016275	GA	6	48752	48762	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016275	CAAA	3	49365	49376	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016275	TC	6	51494	51505	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016275	AGG	4	52968	52979	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016275	TA	8	53960	53974	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016275	TGAAG	3	54017	54030	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016275	GAA	4	54189	54200	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016275	CTT	4	54460	54470	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016275	A	14	54725	54738	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016275	GAAA	3	55079	55089	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016275	AT	6	56060	56071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016275	TC	6	56777	56788	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016275	AG	10	57105	57123	19	50 %	0 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
114	NC_016275	AGA	5	60479	60494	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016275	TA	9	62157	62174	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016275	TTA	4	62554	62564	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016275	CTTG	3	62654	62664	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016275	ATG	4	63087	63098	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016275	TA	7	63155	63167	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016275	AGC	4	64432	64442	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016275	CT	6	66038	66049	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016275	GC	6	66345	66355	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding

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