ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 79

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016274	CTTT	3	149	159	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016274	TTTG	3	289	300	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016274	AAAG	3	1419	1430	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016274	AG	6	1704	1715	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016274	TAG	4	2039	2049	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016274	GAA	4	2295	2305	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016274	TCT	4	3156	3167	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016274	GAA	4	4145	4156	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016274	CTTT	4	4785	4801	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
10	NC_016274	CT	6	5056	5066	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016274	CAT	5	5162	5175	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016274	CTTT	3	5541	5551	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016274	AAAG	3	5629	5640	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016274	TCT	4	5690	5701	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016274	AG	6	5922	5933	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016274	CTTT	5	6060	6079	20	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016274	GAA	4	6523	6535	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016274	TA	6	6800	6813	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016274	GAA	4	6833	6844	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016274	AGC	4	7663	7673	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016274	AGA	4	7703	7713	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016274	TCT	4	9238	9249	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016274	TCT	5	9943	9957	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016274	CTT	4	9968	9978	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016274	AGA	4	11482	11494	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016274	AGT	4	11565	11576	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016274	GTTT	3	13460	13470	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016274	GACTA	3	14332	14345	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016274	TA	7	15293	15305	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016274	TAA	4	15763	15773	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016274	GAAAA	3	16900	16913	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016274	CTTT	3	17202	17212	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016274	AAAG	3	18179	18189	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016274	AT	6	19323	19334	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016274	GTACT	3	19635	19649	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016274	CTA	4	19865	19875	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016274	AT	8	20557	20572	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016274	GCT	4	20696	20706	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016274	ACT	4	22729	22740	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016274	CTA	4	24371	24381	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016274	AT	7	24798	24810	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016274	TAA	4	25162	25173	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016274	CGC	4	25195	25205	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016274	TTCT	3	25276	25286	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016274	TTTA	3	25388	25398	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016274	AAAG	3	25498	25508	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016274	TTCC	3	25902	25912	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016274	AGT	4	26249	26259	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016274	CTC	4	26326	26338	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016274	AAGAAA	3	26607	26623	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016274	ATTT	3	27178	27189	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016274	TC	6	27419	27429	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016274	CCT	4	28984	28994	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016274	GTA	4	29625	29636	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016274	CAGC	3	29708	29719	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016274	TC	8	29949	29963	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016274	CTA	4	30230	30241	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016274	TA	7	31670	31683	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016274	TCTT	4	32912	32928	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
60	NC_016274	TACG	3	34355	34366	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016274	CTATTA	3	34513	34529	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016274	CCAA	3	34604	34615	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016274	AGA	4	34753	34763	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016274	TAC	4	35698	35709	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016274	CTT	4	35972	35982	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016274	GGTT	3	36749	36759	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016274	ACT	4	37253	37264	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016274	CTTTT	3	37883	37896	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016274	GCT	4	38300	38311	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016274	TTCAA	3	38500	38513	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016274	ACTT	3	40105	40116	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016274	AGG	4	40524	40534	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016274	TC	7	41063	41075	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016274	CTT	4	41488	41500	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016274	CTTT	3	42178	42189	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016274	AAAAG	3	42402	42416	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016274	AT	6	43623	43633	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016274	AT	6	43722	43733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016274	CTCTT	3	44750	44764	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016274	TC	7	45358	45370	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016274	CTC	4	45451	45461	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016274	TCTCCT	3	45506	45523	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016274	CT	6	45656	45668	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016274	CG	7	45862	45875	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016274	TTGCT	3	46268	46281	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016274	AAG	4	46776	46787	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016274	TTTC	4	47030	47045	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016274	TC	6	47217	47227	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016274	CT	6	47316	47326	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016274	AT	6	47935	47946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016274	GAA	4	48172	48182	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016274	AGA	4	49164	49175	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016274	TC	6	50481	50491	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016274	CT	6	51616	51626	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016274	TTC	4	52233	52244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016274	AAAG	3	53029	53039	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016274	GGAA	3	53042	53053	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016274	AGA	4	53443	53453	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016274	AGCC	3	53597	53608	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016274	CTAG	3	53677	53688	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016274	TTC	5	53766	53779	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016274	TTCT	3	53872	53883	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016274	CTTT	3	53942	53953	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016274	AGTA	3	54297	54308	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016274	GAA	4	54745	54756	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016274	TA	6	54909	54919	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016274	TA	8	55667	55681	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016274	ACTT	3	55935	55945	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016274	AAAG	3	56068	56078	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016274	GAAG	3	56126	56137	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016274	TGAA	3	56178	56188	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016274	TA	6	56696	56707	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016274	AG	6	58433	58443	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016274	TC	6	58539	58549	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016274	AAG	4	60681	60692	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016274	TGA	4	60852	60863	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016274	TC	6	61430	61440	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016274	GA	7	61739	61751	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016274	CTTA	3	62429	62439	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016274	AGCT	3	63335	63346	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016274	TCT	4	63478	63490	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016274	ATCT	3	63897	63908	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016274	AAGG	3	64144	64154	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016274	TCTT	4	64246	64262	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016274	AGGG	3	64532	64542	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016274	TTC	4	64600	64610	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016274	AAAG	3	64933	64944	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016274	ACCT	3	65538	65548	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016274	TCAG	3	65792	65802	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016274	CTT	4	66964	66974	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016274	AAG	4	67408	67420	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016274	GA	6	67460	67470	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016274	G	12	69628	69639	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016274	AGA	6	70141	70157	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016274	AAAGA	3	70618	70631	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016274	GCT	4	71157	71168	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016274	GTTC	3	72762	72773	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016274	ACTC	3	72976	72987	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016274	AAAG	3	74716	74727	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016274	AACC	3	74755	74765	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016274	CTTT	3	75360	75371	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016274	CTATCT	3	75692	75708	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 79