ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 15

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016273	CTTC	3	71	82	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016273	CTT	4	207	217	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016273	CT	6	291	302	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016273	CTTT	3	1153	1164	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016273	ATG	4	1165	1176	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016273	GAA	4	1424	1435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016273	CCTG	3	1809	1819	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016273	TA	6	2156	2166	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016273	ATCT	3	2689	2699	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016273	TCT	4	3812	3823	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016273	CTG	4	4114	4125	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016273	TCTG	3	4965	4976	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016273	TTGA	3	5713	5725	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016273	AGAAA	3	6582	6596	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016273	AGA	4	7955	7965	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016273	TAGT	3	8187	8198	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016273	TATT	3	8918	8928	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016273	TA	6	9025	9035	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016273	GAGC	3	9489	9499	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016273	AAGG	3	9826	9836	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016273	GTAAA	3	9843	9857	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016273	AGCT	3	11693	11703	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016273	GGCG	4	12817	12831	15	0 %	0 %	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016273	CAA	4	12913	12923	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016273	GAA	4	12924	12935	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016273	AT	11	13363	13383	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016273	AAG	4	13604	13616	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016273	GACG	3	14997	15008	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016273	ATGA	3	15251	15263	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016273	AAGC	3	15562	15572	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016273	CTGT	3	16166	16176	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016273	TGAT	3	16861	16871	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016273	GGCT	3	17177	17187	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016273	GAAA	3	17313	17323	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016273	AAGAG	3	17876	17889	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016273	TTC	4	18522	18533	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016273	TA	6	18865	18875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016273	CTTTA	3	18999	19013	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016273	TA	6	19465	19475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016273	CTA	4	21058	21068	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016273	TA	6	21147	21157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016273	CTTT	3	21184	21194	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016273	TTTC	3	21381	21391	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016273	GA	7	21939	21951	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016273	CGAG	3	22338	22350	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016273	AAAG	3	23018	23028	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016273	TAG	4	23722	23732	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016273	AAAGAA	3	24450	24467	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016273	CAGA	3	25601	25612	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016273	GGCA	3	25742	25753	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016273	CTTT	3	27089	27100	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016273	GCTA	3	27364	27375	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016273	CATAA	3	27397	27411	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016273	AGA	5	27435	27449	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016273	AT	6	27700	27711	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016273	CCTC	3	27918	27929	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016273	AAGA	3	28145	28156	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016273	TA	6	28416	28427	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016273	ACCC	3	29035	29047	13	25 %	0 %	0 %	75 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016273	TC	6	29125	29136	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016273	TCTT	3	30979	30991	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016273	CT	6	31134	31144	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016273	CCTTG	3	32270	32283	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016273	GAAAA	3	33474	33488	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016273	AGC	4	33972	33983	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016273	AAG	4	34168	34179	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016273	CT	6	34515	34525	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016273	CTTA	4	34714	34729	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016273	CTTTA	3	34745	34759	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016273	AT	6	34948	34959	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016273	TC	6	34993	35003	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016273	CT	6	35113	35123	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016273	ACTTGG	3	35901	35917	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016273	GAA	4	36775	36785	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016273	GAA	4	36855	36866	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016273	CATTC	3	37324	37337	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016273	TTTC	3	38132	38143	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016273	TTCA	3	39025	39035	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016273	CTTTT	3	39212	39226	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016273	TTAG	3	43969	43979	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016273	GAAA	3	44671	44681	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016273	ACTT	3	45112	45123	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016273	TTTC	3	45145	45156	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016273	AAG	4	45310	45322	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016273	AG	7	45386	45400	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016273	AG	6	46228	46238	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016273	CAGT	3	46470	46481	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016273	CTTTT	3	46753	46766	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016273	GAA	4	46888	46898	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016273	AG	6	47105	47115	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016273	AG	6	47338	47348	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016273	AGA	4	47962	47973	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016273	AAGAAA	3	48338	48356	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_016273	GA	7	48915	48927	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016273	CG	6	48949	48960	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016273	TC	6	49207	49218	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016273	TA	6	49261	49272	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016273	CAAGA	4	49348	49366	19	60 %	0 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
99	NC_016273	GAA	4	49539	49550	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016273	CTTA	3	49564	49576	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016273	CG	6	49673	49684	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016273	GAAA	3	50989	51000	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016273	TA	6	51463	51474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016273	TTGC	3	51549	51560	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016273	TA	6	51741	51752	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016273	GAAA	3	51827	51837	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016273	AAGA	3	53262	53272	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016273	AG	6	53750	53760	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016273	TACTC	3	54179	54194	16	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016273	CTTT	3	54553	54564	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016273	ACTT	3	55466	55477	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016273	TAAAG	3	55537	55550	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016273	TTG	4	56278	56289	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016273	TTCC	3	56300	56310	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016273	TA	6	56784	56795	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016273	TC	6	57087	57097	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016273	TC	6	57611	57621	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016273	CTC	4	59758	59768	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016273	TA	8	60232	60247	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016273	CTT	4	60851	60862	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016273	AAGACA	3	60940	60957	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016273	AT	6	60993	61004	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016273	CT	6	61562	61572	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016273	CCT	4	61644	61655	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016273	CT	6	61666	61677	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016273	TA	6	62890	62901	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016273	GAA	4	63046	63057	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016273	AAG	4	63512	63523	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016273	AT	6	63871	63882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016273	TC	6	65543	65554	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016273	TC	6	65836	65846	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016273	TAAC	3	66105	66115	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016273	GA	6	66427	66437	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016273	GA	7	67020	67032	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016273	AGGC	3	67161	67172	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016273	GAG	4	67245	67255	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016273	TCT	5	67318	67331	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016273	AAAG	3	67961	67972	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016273	CATTT	3	69027	69041	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016273	TC	6	69450	69460	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016273	TA	6	69493	69504	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016273	TTCG	3	71458	71468	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016273	TA	6	72297	72308	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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147	NC_016273	CTTT	3	76347	76358	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016273	AAGA	3	76562	76573	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016273	TA	6	77349	77359	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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152	NC_016273	TAC	4	78972	78982	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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159	NC_016273	CTT	4	82663	82675	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
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164	NC_016273	ATCT	3	84420	84432	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
165	NC_016273	AAAG	3	84895	84907	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
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171	NC_016273	AG	6	86984	86994	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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174	NC_016273	TA	6	87589	87600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
175	NC_016273	TGAA	3	87936	87946	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
176	NC_016273	TTTAC	3	88461	88474	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
177	NC_016273	TTTC	3	88512	88522	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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180	NC_016273	GCAAA	3	90446	90459	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
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184	NC_016273	AAAG	3	93249	93259	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
185	NC_016273	CTTT	3	94892	94902	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
186	NC_016273	AAAG	3	95290	95301	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
187	NC_016273	AGAA	3	95304	95314	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
188	NC_016273	TC	6	98180	98191	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
189	NC_016273	CT	6	98707	98718	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
190	NC_016273	AAAG	3	99475	99487	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
191	NC_016273	GACA	3	102763	102774	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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195	NC_016273	TCTTT	3	104585	104598	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
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199	NC_016273	CTGT	3	107039	107050	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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207	NC_016273	AGTT	3	116698	116708	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
208	NC_016273	CTC	4	117140	117151	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
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211	NC_016273	TCT	4	117589	117599	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
212	NC_016273	CTTT	3	118441	118452	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 15