ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 8

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016272	CCT	4	23	34	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016272	AG	6	345	355	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016272	GGGC	3	2896	2908	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016272	GAT	4	3340	3351	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016272	AAG	4	4205	4215	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016272	TTCGT	3	4762	4776	15	0 %	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016272	GGAC	3	5282	5292	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016272	CAT	4	6296	6307	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016272	TCT	4	6870	6881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016272	GTA	4	6909	6919	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016272	TC	6	7537	7547	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016272	TG	7	7796	7809	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016272	CTT	4	7814	7824	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016272	CCTTT	3	8294	8309	16	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016272	TCT	5	10919	10933	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016272	CTTT	3	11222	11232	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016272	GAAA	3	11655	11667	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016272	GAA	4	12058	12068	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016272	GAACT	3	12103	12118	16	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016272	GA	7	12315	12327	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016272	TAG	4	13101	13111	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016272	TA	6	13969	13979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016272	CA	6	14357	14368	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016272	GGT	4	14901	14912	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016272	AGA	4	15836	15846	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016272	CTAC	3	15980	15990	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016272	ATC	4	16105	16116	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016272	CTAT	3	16257	16267	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016272	AAGA	4	18056	18070	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016272	TTAC	3	18173	18183	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016272	TCAC	3	18220	18231	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016272	TA	6	18958	18968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016272	AAAG	4	19249	19264	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016272	AT	6	19357	19368	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016272	CT	6	19678	19688	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016272	CTTTT	3	19982	19995	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016272	AAGA	4	20813	20828	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016272	AAG	4	21704	21715	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016272	AAAG	3	22430	22440	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016272	GCT	4	23154	23165	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016272	CAGA	3	23968	23978	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016272	TTA	4	24359	24369	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016272	CCCT	3	25025	25036	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016272	AGA	5	25144	25157	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016272	TC	6	25987	25997	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016272	AAGG	3	26130	26141	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016272	GCAC	3	27183	27194	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016272	TA	8	28512	28526	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016272	ACTT	3	29091	29102	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016272	CT	6	30013	30023	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016272	TA	6	30060	30071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016272	AAG	4	30253	30264	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016272	AT	6	31213	31223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016272	CACT	3	32457	32467	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016272	ACT	4	33423	33433	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016272	TCT	5	34149	34163	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016272	ATTTG	3	34164	34178	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016272	GAAA	3	34327	34338	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016272	CTA	4	34570	34581	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016272	CT	6	34660	34670	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016272	AAAG	3	34798	34809	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016272	AGA	5	35018	35032	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016272	AGCC	3	35292	35303	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016272	AGTAT	3	36368	36382	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016272	CTTT	4	36482	36496	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016272	TTTC	3	36863	36873	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016272	TAAAG	5	37502	37526	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016272	CTT	4	37559	37570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016272	ATCT	3	39186	39197	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016272	TTGC	3	39878	39888	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016272	ACA	4	41210	41221	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016272	TA	6	42020	42031	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016272	CTTT	3	42164	42174	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016272	TCT	4	42403	42414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016272	TAGA	3	42443	42454	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016272	AAAG	3	42942	42952	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016272	AT	6	43006	43016	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016272	AGA	4	43865	43875	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016272	AGAA	3	44105	44116	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016272	CAAA	3	44593	44603	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016272	CTT	4	45404	45415	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016272	TGT	4	45414	45425	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016272	GA	6	45561	45572	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016272	TCTT	3	46363	46374	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016272	TCCT	3	46904	46915	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016272	CTTT	3	47304	47315	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016272	AAAAG	3	47560	47574	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016272	AAGA	4	47593	47607	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016272	TC	6	49747	49757	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016272	AGA	4	49821	49831	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016272	CGAA	4	49845	49859	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016272	CTT	4	50880	50892	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016272	AAAGA	3	51288	51302	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016272	CTTT	3	51626	51637	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016272	AGA	4	51862	51872	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016272	AGAA	3	52024	52035	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016272	TACCTC	3	52181	52197	17	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016272	GAA	4	52754	52766	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016272	TCCT	3	53192	53204	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016272	TCTTT	3	53763	53776	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016272	TTCC	3	54213	54224	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016272	TAAG	3	54492	54503	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016272	GA	6	54678	54688	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016272	TTTCT	3	55108	55122	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016272	TA	6	55404	55414	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016272	TCCTT	3	55894	55907	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016272	CTT	4	56392	56402	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016272	TGAA	3	56770	56780	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016272	CTT	4	58269	58280	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016272	AT	6	59096	59107	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016272	AAG	4	59231	59242	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016272	GA	7	59365	59377	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016272	TGAA	3	59961	59971	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016272	AT	6	60259	60270	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016272	GAA	4	60632	60643	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016272	GA	8	60941	60955	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016272	GAG	4	61026	61037	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016272	CTT	4	61400	61410	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016272	AT	7	62325	62340	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016272	AAG	4	62561	62572	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016272	TCTTTC	3	64063	64080	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016272	GA	7	65352	65364	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016272	TTTC	3	67277	67288	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016272	TAACC	3	68092	68105	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016272	ACTAGG	3	68191	68209	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
126	NC_016272	TC	6	68421	68431	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016272	AAGAG	3	68873	68887	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016272	CCTT	3	70290	70301	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016272	CTA	6	71131	71148	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
130	NC_016272	AAGG	3	72508	72519	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016272	TCTT	4	72953	72968	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016272	CTT	5	73196	73211	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016272	TC	6	74615	74625	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016272	AAAG	3	74668	74678	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016272	AGGC	3	75833	75844	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016272	TCT	4	76054	76064	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016272	AT	8	76463	76478	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016272	TTTC	3	76698	76709	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016272	AGAA	3	78154	78164	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016272	GAA	4	78293	78304	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016272	GCT	4	78705	78716	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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145	NC_016272	GCAT	3	80191	80202	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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147	NC_016272	GAA	4	81514	81525	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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174	NC_016272	AGG	4	96316	96327	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
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176	NC_016272	CT	6	98094	98104	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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179	NC_016272	AG	6	99182	99192	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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221	NC_016272	AG	6	127047	127057	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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228	NC_016272	AG	6	130577	130587	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 8