ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 78

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016271	TTAA	3	750	761	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016271	CTT	4	889	900	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016271	TCT	4	2432	2443	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016271	TCT	4	3110	3122	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016271	AGAA	3	4688	4699	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016271	GT	6	5907	5918	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016271	CCAAA	3	7568	7582	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016271	CAAC	3	7916	7928	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016271	GGTA	3	8436	8446	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016271	CTA	4	8973	8984	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016271	TTCT	3	9013	9024	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016271	AAAG	4	9399	9414	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016271	TA	6	9480	9490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016271	AT	7	10028	10041	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016271	TC	7	10104	10116	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016271	TTA	5	10841	10854	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016271	TA	7	10848	10860	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016271	TGCA	3	10876	10886	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016271	AAGAG	3	10899	10912	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016271	TGCCT	3	10994	11007	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016271	GAA	5	11420	11434	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016271	T	12	12227	12238	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016271	ACT	4	12584	12594	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016271	CTA	4	13571	13582	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016271	AAG	4	14253	14264	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016271	CTTT	3	14602	14613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016271	TAGC	3	14771	14783	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016271	TAAG	3	14980	14991	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016271	TCTT	3	15049	15059	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016271	AGT	4	16631	16642	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016271	AAG	4	17679	17689	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016271	AT	6	18231	18242	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016271	TTGA	3	19640	19651	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016271	CTT	4	19677	19688	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016271	AT	6	19974	19985	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016271	AGA	4	20020	20031	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016271	TCT	4	20314	20325	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016271	AG	6	21218	21228	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016271	GGA	4	22827	22838	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016271	AGA	4	23422	23432	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016271	AACC	3	23689	23699	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016271	ACG	4	23816	23826	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016271	TCTT	3	24650	24661	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016271	TTAT	3	25466	25477	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016271	TA	7	26456	26468	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016271	TA	7	27878	27891	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016271	TA	6	28143	28153	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016271	AGA	6	29840	29857	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016271	GA	6	30031	30041	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016271	CTT	6	31270	31288	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
51	NC_016271	TCTCCT	3	31712	31728	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
52	NC_016271	CT	6	31775	31785	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016271	CT	6	32079	32089	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016271	AGT	4	33122	33134	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016271	ATGAGG	3	33257	33274	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016271	TTTA	3	33810	33821	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016271	ATCT	3	34855	34867	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016271	CT	7	35032	35044	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016271	CT	6	36188	36198	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016271	AT	6	38110	38120	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016271	TTTC	3	38955	38965	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016271	AAGA	4	39563	39577	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016271	CTT	4	39743	39755	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016271	GA	6	39863	39874	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016271	CTT	4	40078	40089	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016271	AAGA	3	40469	40480	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016271	AAAAG	3	40923	40937	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016271	GCAA	3	41185	41196	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016271	TCT	4	41283	41294	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016271	CTT	4	41503	41513	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016271	TTAT	3	42318	42329	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016271	GA	6	42678	42688	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016271	AG	8	42732	42746	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016271	TA	6	43124	43135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016271	TTC	4	43156	43167	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016271	CAAG	3	43283	43294	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016271	TCT	5	44973	44987	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016271	TTTCC	3	45172	45185	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016271	CTTT	3	45423	45433	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016271	CTCTTT	3	45564	45580	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016271	TCT	4	46651	46662	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016271	TTC	4	47024	47034	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016271	AGA	4	47565	47576	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016271	TCT	4	48333	48343	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016271	AGA	4	48933	48944	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016271	AAG	4	49191	49202	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016271	CTTT	3	49534	49545	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016271	TA	6	50054	50064	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016271	AAG	4	50807	50818	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016271	CAAGA	4	50834	50852	19	60 %	0 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
91	NC_016271	CTTT	4	51001	51015	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016271	CTT	4	52923	52933	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016271	CTT	4	54709	54720	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016271	AGAA	3	55272	55283	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016271	CTT	4	55577	55588	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016271	AG	6	55843	55853	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016271	AAG	4	56313	56324	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016271	C	13	56579	56591	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016271	TACA	3	56936	56947	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016271	CTTT	3	57185	57195	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016271	CGAGGG	3	57555	57573	19	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
102	NC_016271	GAGAGG	3	57711	57727	17	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016271	GAAAA	3	58360	58374	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016271	AAAG	5	58439	58459	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016271	TGAA	3	58676	58686	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016271	TA	7	59063	59076	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016271	AAAG	3	59346	59357	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016271	AACA	3	59775	59786	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016271	TA	6	59939	59950	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016271	GAAA	3	60258	60268	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016271	GAG	4	60440	60450	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016271	CTT	4	60745	60756	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016271	TGAA	3	61582	61592	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016271	GCT	4	62021	62032	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016271	CTT	4	62116	62126	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016271	CTT	4	62179	62189	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016271	TCT	4	62325	62336	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016271	AG	6	62685	62695	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016271	AG	6	63867	63878	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016271	TACT	3	65366	65376	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016271	TA	8	65590	65604	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016271	AAAG	3	66649	66660	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016271	CAG	4	67603	67615	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016271	CTTT	3	67852	67862	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016271	GT	6	68228	68238	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016271	GGA	4	68660	68670	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016271	GTC	4	69994	70004	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016271	TC	6	70540	70550	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016271	AG	6	71137	71148	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016271	GT	6	71556	71566	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016271	TCTT	3	71757	71768	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016271	GAA	4	71989	71999	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016271	TTGG	5	72468	72488	21	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016271	TTCT	3	73468	73479	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016271	CTTT	3	73847	73858	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016271	TC	6	74959	74970	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016271	CACC	3	75045	75055	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016271	TAAA	3	75654	75665	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016271	TA	8	75957	75971	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016271	TTAA	3	76264	76276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 78