ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 21

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016270	GA	8	746	760	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016270	TCAA	3	1067	1077	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016270	GA	7	1718	1731	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016270	TCTT	3	2749	2759	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016270	TAGAAT	3	3265	3282	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_016270	AGCA	3	3646	3657	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016270	GAAG	3	3822	3833	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016270	TA	7	4439	4451	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016270	AAGG	3	4916	4926	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016270	AAGAG	3	5686	5700	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016270	TCT	4	5779	5789	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016270	TA	6	5795	5805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016270	CCT	4	7279	7290	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016270	ATA	4	7316	7326	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016270	GAA	4	7411	7421	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016270	TAGC	3	7864	7874	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016270	AGGC	3	8080	8090	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016270	AAAT	3	8311	8323	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016270	TTCGG	3	8782	8796	15	0 %	40 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016270	AGA	4	8880	8890	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016270	TA	7	9134	9147	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016270	ACT	4	9693	9704	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016270	TC	6	10626	10636	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016270	CTT	4	11327	11338	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016270	TCC	4	11874	11886	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016270	AGA	4	12128	12138	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016270	TAAG	3	14069	14079	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016270	TCT	4	14913	14924	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016270	GTAG	3	15164	15175	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016270	AG	6	17074	17084	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016270	AAG	4	17463	17475	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016270	TA	6	18459	18469	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016270	TCT	4	18630	18641	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016270	GGCA	3	18897	18908	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016270	TAC	4	19412	19423	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016270	CTT	4	20958	20969	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016270	CATA	3	21376	21386	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016270	ATCT	3	21503	21515	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016270	CCTT	3	21605	21616	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016270	TCT	4	22380	22391	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016270	ACTT	3	22432	22442	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016270	GGCT	3	22896	22906	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016270	TA	6	23505	23518	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016270	AACTT	3	23788	23802	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016270	TGA	4	24399	24409	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016270	GA	7	24807	24819	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016270	TCT	4	25571	25582	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016270	CTT	5	25677	25690	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016270	CTA	4	26194	26204	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016270	AAAG	3	26215	26226	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016270	CTAAA	3	26788	26801	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016270	TA	7	26980	26992	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016270	GGT	4	27226	27236	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016270	TTC	4	27358	27369	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016270	AGA	4	27617	27628	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016270	TA	8	27651	27667	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_016270	ACT	4	27980	27990	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016270	CT	7	28066	28078	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016270	CTC	4	28314	28324	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016270	CAAG	3	28810	28822	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016270	ATG	4	28883	28894	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016270	CTT	5	29678	29691	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016270	TAAA	4	30575	30590	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016270	CTTT	3	30598	30609	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016270	TA	6	31165	31176	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016270	AGAC	3	31621	31632	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016270	AG	6	31721	31732	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016270	CT	6	32231	32242	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016270	AAG	4	33667	33677	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016270	TA	6	33979	33989	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016270	GAGG	3	34839	34850	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016270	TA	6	35325	35335	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016270	GC	6	35508	35518	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016270	ACT	4	35905	35915	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016270	AGA	4	36061	36073	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016270	ACT	4	37205	37215	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016270	ATTT	3	37343	37354	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016270	TC	6	37704	37715	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016270	TA	6	38099	38109	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016270	AG	6	39612	39622	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016270	TAAG	3	40148	40160	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016270	GC	6	42231	42241	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016270	CGAA	3	42285	42296	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016270	TCA	4	42700	42710	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016270	GAA	4	43559	43571	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016270	AAG	4	44494	44506	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016270	ACA	4	45656	45667	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016270	ACAG	3	47526	47536	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016270	CTTT	3	48545	48556	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016270	TA	7	50021	50034	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016270	AAGTC	3	51525	51539	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016270	TC	6	51575	51585	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016270	CT	8	54277	54292	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016270	CT	6	54303	54314	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016270	CTTT	3	55117	55129	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016270	AAGC	3	55569	55580	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016270	TCT	4	55761	55771	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016270	AAAG	4	56136	56151	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016270	TA	7	56248	56260	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016270	AG	6	56687	56698	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016270	AGAA	3	56815	56825	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016270	CTTT	4	56931	56945	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016270	AAAC	3	57166	57176	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016270	CT	6	57951	57961	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016270	TA	7	58852	58864	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016270	ATCT	3	60452	60463	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016270	TGC	4	61668	61679	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016270	GTG	4	62915	62926	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016270	TA	6	63927	63938	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016270	AAGT	6	66760	66783	24	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016270	AAG	4	67184	67196	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016270	TA	6	67926	67937	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016270	AAG	4	68052	68062	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016270	CTT	4	68175	68186	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016270	CTCTT	3	69523	69537	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016270	ATAA	4	69889	69904	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016270	AC	6	70070	70081	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016270	AG	6	70174	70184	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016270	TAGA	3	70282	70292	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016270	CTG	4	70350	70360	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016270	CTTT	3	71140	71150	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016270	TAAC	3	71260	71271	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016270	TAT	4	72024	72034	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016270	AACC	3	72101	72111	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016270	TA	7	72260	72272	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016270	TA	6	73036	73046	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016270	TCTT	3	73252	73263	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016270	GAAA	3	73586	73597	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016270	CTTT	3	75326	75338	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016270	CAG	4	75345	75356	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016270	TTC	4	75807	75818	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016270	TA	6	76436	76447	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016270	TAG	4	77058	77068	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016270	TA	6	77207	77218	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016270	AGT	4	77467	77478	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016270	TA	6	77853	77864	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016270	TA	6	77893	77903	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016270	CTTTTT	3	78347	78363	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016270	TATC	3	78389	78399	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016270	C	12	78472	78483	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016270	AGA	4	78840	78851	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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196	NC_016270	AAAG	4	107750	107764	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
197	NC_016270	TC	7	107869	107881	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
198	NC_016270	CTAA	3	108367	108378	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
199	NC_016270	TG	6	108407	108418	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 21