ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 86

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016269	TATAT	3	421	435	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016269	ATTC	4	1122	1137	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016269	CCAT	3	1834	1844	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016269	AAAG	3	2906	2916	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35796725
5	NC_016269	TCAT	4	4768	4782	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016269	GA	7	4837	4849	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016269	AAGT	3	5581	5591	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016269	AAAG	3	6555	6566	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016269	GAAA	3	6588	6600	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016269	TAAA	3	7036	7046	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016269	CTT	4	7503	7515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016269	AAAG	4	8066	8080	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016269	TGAA	3	8558	8568	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016269	TTCT	3	8884	8894	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016269	AAAGAA	3	9076	9094	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_016269	GCA	4	9250	9261	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016269	GAGG	3	10451	10463	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016269	GAAAAA	3	11023	11040	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016269	TCT	4	11190	11200	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016269	AT	6	11275	11286	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016269	TA	6	11397	11408	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016269	AAAG	3	11587	11598	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016269	CTTT	4	12138	12153	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016269	TGC	4	12202	12212	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016269	GA	7	12415	12427	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016269	GA	7	12502	12514	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016269	GAA	4	13729	13739	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016269	TCT	4	13799	13811	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016269	AAG	4	13969	13980	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016269	TGA	4	14659	14671	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016269	TCT	4	14996	15009	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016269	TAG	4	15768	15778	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016269	CTTT	3	16234	16244	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016269	GCT	4	16410	16421	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016269	TCTT	3	16622	16633	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016269	GGTT	4	19181	19197	17	0 %	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016269	TA	6	19622	19633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016269	TA	11	20610	20630	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016269	TA	7	21344	21356	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016269	AGCG	3	22185	22195	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016269	TCT	4	22239	22250	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016269	AGA	4	23701	23712	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016269	CTAA	4	23862	23877	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016269	GTA	4	24487	24498	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016269	TA	6	25203	25213	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016269	CTGT	3	26055	26067	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016269	TAC	4	26131	26142	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016269	AAGA	3	28720	28731	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016269	GCT	4	28740	28750	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016269	AAG	4	29952	29962	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016269	TGTT	3	30370	30381	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016269	CTAA	3	30712	30722	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016269	AGGA	3	30826	30837	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016269	TA	7	31290	31303	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016269	AGA	4	31523	31533	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016269	GA	6	32477	32487	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016269	TTAC	3	33306	33317	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016269	TA	6	33936	33946	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016269	AAAGG	3	34103	34117	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016269	TCT	4	34902	34912	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016269	TCTA	3	35074	35085	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016269	AG	6	35539	35549	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016269	TA	7	35561	35574	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016269	CTTT	3	36335	36347	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016269	TA	6	37263	37274	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016269	CCAC	3	37998	38009	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016269	TTCC	3	38359	38370	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016269	AAAG	3	38783	38793	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016269	GGCCA	3	39248	39262	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016269	AAAG	3	39379	39390	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016269	TA	6	39481	39492	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016269	AAAG	3	39737	39747	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016269	CTT	4	39833	39844	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016269	GGA	4	40072	40082	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016269	AAAG	3	40357	40368	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016269	GGA	4	40518	40529	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016269	AAGA	3	40770	40781	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016269	GA	7	40784	40796	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016269	GC	6	40847	40857	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016269	CTT	4	41222	41233	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016269	TTC	4	41299	41310	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016269	ACTT	3	42296	42306	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016269	TCT	4	42986	42996	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016269	TTCA	3	43492	43502	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016269	GAAA	3	43680	43690	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016269	AGAA	3	43714	43725	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016269	TTCTTT	3	44536	44553	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
88	NC_016269	GAAA	3	44787	44797	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016269	ACT	4	45234	45245	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016269	AAG	4	45624	45635	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016269	TTCT	4	45706	45721	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016269	TC	7	47451	47463	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016269	AGA	5	47582	47596	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016269	ATG	4	47690	47700	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016269	TTAT	3	47773	47784	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016269	GA	7	48170	48182	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016269	TA	6	48427	48438	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016269	ACTT	3	48798	48809	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016269	AAG	4	50521	50532	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016269	GAA	4	51581	51592	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016269	AGA	4	51848	51859	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016269	GAA	4	51897	51908	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016269	AGA	4	53206	53216	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016269	TATAG	3	53616	53629	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016269	ATGC	3	54194	54204	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016269	TA	6	55104	55115	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016269	TA	6	55783	55793	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016269	CT	6	56516	56527	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016269	ATG	4	57609	57619	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016269	TA	7	58217	58230	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016269	AAAGG	3	58636	58650	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016269	TA	7	59186	59199	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016269	AAGG	3	59204	59214	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016269	TA	7	59480	59495	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016269	TAAC	3	59510	59522	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016269	TA	8	59638	59652	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016269	GGAA	3	60195	60206	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016269	TTTG	3	60311	60322	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016269	CTTAT	3	60357	60370	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016269	TCT	4	60618	60630	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016269	AAG	4	61164	61175	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016269	ATGC	3	61556	61566	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016269	ATTAG	3	62918	62932	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016269	CTT	4	63339	63349	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016269	G	13	64120	64132	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016269	GAT	4	64199	64209	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016269	AT	7	64371	64384	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016269	CTT	4	65095	65106	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016269	CCTT	3	65476	65487	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016269	CTT	5	66395	66409	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016269	CAA	4	66827	66838	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016269	TTAC	3	67021	67032	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016269	TA	6	67162	67172	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016269	GCACT	3	67294	67308	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016269	TA	6	67434	67444	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016269	TTCC	3	69757	69767	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016269	CTT	4	70664	70675	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016269	AG	6	72620	72630	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016269	CTT	4	72871	72882	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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