ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 84

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016268	TA	6	870	880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016268	TAC	4	3394	3405	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016268	TCCC	3	5665	5677	13	0 %	25 %	0 %	75 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016268	AAGG	3	5977	5989	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016268	AC	6	6399	6410	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016268	AAT	4	8855	8866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016268	TCTTA	3	9171	9184	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016268	AT	6	9389	9399	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016268	CTT	4	9432	9443	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016268	CTTT	3	11167	11178	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016268	CTTT	3	11534	11544	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016268	CTT	4	11561	11572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016268	TTC	4	11700	11711	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016268	AT	7	12290	12302	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016268	TAAG	3	12367	12378	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016268	TAA	5	12570	12584	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016268	AAAG	3	13590	13601	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016268	TTC	4	13886	13897	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016268	CTT	4	15335	15345	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016268	AG	6	16170	16181	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016268	AAAAC	3	16251	16265	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016268	CT	6	16416	16427	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016268	CTAT	3	16677	16688	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016268	GTG	4	16720	16730	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016268	CT	6	17391	17401	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016268	CT	6	18124	18134	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016268	TC	6	18171	18181	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016268	GCTT	3	18757	18768	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016268	CAA	4	19159	19170	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016268	AAAG	3	19821	19831	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016268	TAC	4	20224	20234	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016268	AAAG	3	20390	20401	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016268	GAA	5	20516	20530	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016268	CTTT	3	20637	20648	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016268	AGCA	3	21108	21120	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016268	GCC	4	21181	21191	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016268	AGC	4	21655	21665	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016268	AT	7	21739	21752	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016268	TA	6	22292	22302	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016268	AGA	4	22538	22549	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016268	TCA	4	23736	23747	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016268	AT	6	23950	23961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016268	TAG	4	24505	24516	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016268	CTTT	4	25248	25263	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016268	GAA	4	25530	25541	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016268	AAGT	3	25704	25714	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016268	TCTT	3	25951	25962	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016268	TTTC	3	25989	26000	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016268	GA	7	27531	27543	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016268	TGG	4	27795	27805	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016268	CT	6	27879	27889	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016268	TC	6	28367	28377	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016268	ATCT	3	28530	28542	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016268	AT	6	28694	28705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016268	TA	6	28890	28900	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016268	AG	6	28976	28987	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016268	TC	7	30848	30860	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016268	GA	6	31601	31611	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016268	CTTT	4	31904	31919	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016268	TA	6	32071	32082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016268	AGAGG	3	32361	32374	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016268	CTTG	3	33730	33741	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016268	CAG	4	33781	33792	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016268	GAA	4	33958	33969	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016268	AGA	4	34014	34025	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016268	CTT	4	35277	35288	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016268	CTT	4	35395	35406	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016268	AGA	4	35948	35958	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016268	AGA	4	36036	36046	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016268	TC	6	36189	36199	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016268	GCG	4	37186	37197	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016268	CAA	4	37209	37220	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016268	AAG	4	38591	38602	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016268	ATAA	3	39432	39443	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016268	CTTT	3	39583	39594	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016268	CCTT	3	40481	40492	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016268	GAA	4	40971	40981	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016268	AAG	4	41064	41075	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016268	CTCCT	3	41448	41463	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016268	TTCT	3	41543	41553	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016268	TCT	5	41614	41628	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016268	GA	7	41919	41931	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016268	GAG	4	41940	41951	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016268	AGC	4	43177	43188	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016268	AGA	5	43395	43409	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016268	AAG	4	43580	43590	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016268	CTTT	3	43666	43676	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016268	TCT	4	44511	44523	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016268	AAAGA	3	44935	44949	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016268	TA	7	45029	45042	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016268	TC	6	45840	45850	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016268	TCCT	3	46007	46018	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016268	AGG	4	46450	46460	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016268	GA	6	48007	48017	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016268	CCAAGT	3	48160	48176	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016268	CTT	4	48286	48296	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016268	GAAA	3	48441	48451	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016268	GCAAA	3	48460	48473	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016268	TTCA	3	48513	48524	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016268	TTTTTC	3	48922	48939	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
101	NC_016268	GA	6	49291	49301	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016268	AG	6	50027	50037	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016268	TCTT	3	50240	50251	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016268	CCT	4	50513	50524	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016268	CCT	4	50666	50676	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016268	TCC	4	51116	51127	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016268	ACCT	3	51267	51278	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016268	TTCT	3	53185	53195	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016268	TCT	4	53415	53426	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016268	TTC	4	53990	54001	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016268	CAGT	3	54178	54189	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016268	TACT	4	54558	54572	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016268	CAAG	3	54958	54970	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016268	TC	7	56513	56525	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016268	CTGT	3	57204	57215	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016268	TTTG	3	57238	57249	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016268	ATT	4	57310	57320	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016268	TTA	4	58271	58281	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016268	CTG	4	58965	58976	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016268	TTCT	3	59813	59824	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016268	GAAA	3	59911	59923	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016268	CGGA	3	62402	62412	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016268	TTGA	3	62574	62586	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016268	AAAG	3	62682	62694	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016268	CTTT	3	63157	63168	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016268	TAC	4	63555	63565	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016268	TA	8	64441	64455	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016268	TAT	4	64704	64714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016268	TA	7	64873	64885	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016268	TA	6	65407	65417	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016268	GACTC	3	65426	65440	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016268	AAGG	3	65566	65577	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016268	TTTC	3	66570	66580	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016268	TCT	4	69786	69797	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016268	AGC	4	69874	69884	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016268	AACA	3	70238	70248	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016268	GCT	4	70482	70492	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016268	TA	6	71198	71208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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