ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 82

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016267	GGTA	3	200	210	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016267	CTA	4	591	602	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016267	GGGA	3	1042	1052	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016267	TTTCT	3	1080	1093	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016267	AGA	4	1185	1196	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016267	TTCTA	3	1297	1311	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016267	ACTT	3	1393	1403	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016267	GAA	4	2275	2287	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016267	TC	6	2325	2336	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016267	A	15	2507	2521	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016267	TG	6	2772	2783	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016267	AAG	4	3540	3550	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016267	CTT	4	4206	4217	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016267	ACCT	3	4251	4261	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016267	TA	6	5158	5168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016267	TA	6	5726	5737	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016267	CT	7	6714	6727	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016267	ATA	4	7408	7419	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016267	TTCAA	3	7881	7896	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016267	CTTT	3	7922	7932	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016267	ATATT	4	7987	8005	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_016267	ATTG	3	8253	8264	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016267	AAGA	3	8453	8464	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016267	CTT	4	8857	8868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016267	AAGC	3	10072	10083	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016267	CCTT	3	10367	10377	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016267	TCT	4	13280	13291	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016267	AGTA	3	13296	13306	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016267	AAGA	3	13339	13350	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016267	TATT	3	13434	13445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016267	CTA	4	13597	13607	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016267	AAAAG	3	16499	16512	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016267	TC	7	16624	16636	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016267	CCT	4	17957	17967	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016267	AT	7	17991	18003	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016267	GAA	4	18965	18976	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016267	TA	6	18990	19001	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016267	AGC	4	19235	19246	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016267	AGA	4	19444	19456	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016267	TTTC	3	19743	19754	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016267	AAAG	3	20211	20221	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016267	AG	6	21656	21666	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016267	GCTT	3	22788	22798	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016267	TCT	4	23533	23544	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016267	TAAA	4	23544	23559	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016267	GTCTT	3	23560	23573	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016267	GTA	5	23755	23769	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016267	ATA	4	23881	23892	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016267	TCT	4	25054	25064	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016267	CT	6	26233	26244	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016267	TA	6	26433	26443	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016267	CTT	4	26799	26809	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016267	CACGG	3	27401	27414	14	20 %	0 %	40 %	40 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016267	CTA	4	27903	27913	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016267	TCT	4	29783	29795	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016267	AAG	4	31246	31257	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016267	TCTT	3	32678	32690	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016267	AT	6	32812	32823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016267	TC	6	32842	32853	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016267	TC	7	32972	32984	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016267	TTTC	3	33243	33254	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016267	GAA	4	33618	33629	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016267	AAAG	3	33633	33645	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016267	GAAA	4	33818	33833	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016267	AG	6	33839	33850	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016267	TGAA	3	34319	34329	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016267	AAAG	3	34469	34480	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016267	CTT	4	34949	34959	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016267	GAG	4	35025	35035	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016267	GAAA	3	35140	35150	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016267	TATG	3	36235	36246	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016267	TCT	4	36427	36438	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016267	GCT	4	36478	36489	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016267	ATTC	3	36537	36548	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016267	TTC	4	36749	36759	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016267	TTC	5	37105	37118	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016267	TTTC	3	37402	37414	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016267	TGAA	3	37519	37529	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016267	AGA	4	37602	37614	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016267	GAGAAG	3	37969	37985	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016267	AAAG	3	38591	38601	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016267	TG	7	39459	39472	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016267	CCTT	3	39704	39714	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016267	GAAA	3	40271	40281	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016267	CTTT	3	41169	41180	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016267	CGTC	3	41443	41454	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016267	CA	7	42016	42028	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016267	GAAAG	3	42098	42112	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016267	AAAG	3	42132	42142	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016267	TC	6	44049	44059	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016267	TA	7	45350	45363	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016267	CTT	4	45549	45560	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016267	TCT	4	46253	46263	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016267	CAT	4	46955	46965	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016267	AGA	4	47058	47069	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016267	TC	6	47535	47546	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016267	AGAA	3	47875	47885	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016267	TCT	5	49319	49333	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016267	TGT	4	49588	49599	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016267	TAA	4	49881	49893	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016267	AAGA	3	49956	49967	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016267	TCAG	3	50099	50110	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016267	CGT	4	50873	50884	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016267	ACCA	3	50898	50910	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016267	CTTTA	3	51350	51363	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016267	GAA	4	51526	51537	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016267	ACCCTT	3	51744	51761	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016267	GTA	5	52175	52188	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016267	AAAG	3	52854	52864	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016267	TCTTTC	3	53196	53212	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016267	AAG	4	54371	54382	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016267	CT	7	55151	55163	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016267	CAA	4	56136	56147	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016267	AAG	4	56957	56968	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016267	AGA	4	57070	57081	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016267	TC	7	57392	57404	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016267	CTTT	3	57430	57441	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016267	TTTC	3	57669	57680	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016267	TA	8	58866	58880	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016267	TCT	4	59032	59043	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016267	AAAAGA	3	59327	59344	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016267	AAG	4	59576	59587	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016267	CCT	4	60781	60792	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016267	GTTT	3	61319	61329	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016267	AGA	4	61346	61356	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016267	AAG	4	61395	61406	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016267	AAG	4	62250	62261	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016267	CAA	4	63093	63104	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016267	AAG	4	63174	63185	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016267	TC	6	63689	63700	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016267	TCT	4	63842	63854	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016267	CTCCTT	3	63952	63968	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
133	NC_016267	AATG	3	64885	64895	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016267	AAGA	3	65058	65070	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016267	CAA	4	65116	65127	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016267	TTTC	3	65203	65214	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016267	TTCG	3	65672	65682	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016267	AGCAGA	3	67002	67019	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016267	TA	6	67444	67454	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016267	TCT	4	68333	68345	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016267	TTATAT	3	69639	69655	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_016267	TTC	4	70092	70103	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016267	CCCT	3	70187	70198	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016267	ACTT	3	70860	70870	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016267	GAA	4	72463	72473	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016267	TA	6	72624	72635	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016267	GGTG	3	73391	73401	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016267	TGAA	3	73624	73635	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016267	TTC	4	74097	74108	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016267	TTTC	3	74503	74514	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 82