ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 80

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016266	TCT	4	96	106	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016266	CCAAA	3	315	329	15	60 %	0 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016266	TA	6	776	787	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016266	TAG	4	928	938	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016266	GGGC	3	1462	1473	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016266	AGAA	4	3171	3186	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016266	TAT	4	3457	3467	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016266	CTTT	3	3758	3770	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016266	TCTG	3	4335	4347	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016266	AGA	4	4474	4486	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016266	CCTTT	3	4688	4702	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016266	CGAA	3	4775	4785	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016266	A	14	4843	4856	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016266	TCT	4	5960	5971	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016266	TGA	4	6427	6439	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016266	TA	8	7502	7516	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016266	AT	8	8029	8044	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016266	AGA	4	8119	8131	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016266	CTTT	3	8418	8428	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016266	TA	6	10009	10019	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016266	AAAG	3	10042	10053	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016266	GA	6	10567	10577	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016266	TCTT	3	11194	11205	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016266	AATG	3	11827	11839	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016266	TCT	4	11921	11931	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016266	GTCA	3	12049	12060	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016266	CTT	4	12418	12429	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016266	CTT	4	12433	12443	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016266	CTT	4	12511	12521	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016266	TCT	4	12907	12918	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016266	AAGA	3	13204	13215	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016266	TGCTT	3	13828	13842	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016266	TTCT	3	14292	14302	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016266	GAAA	3	14624	14635	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016266	CCT	4	14821	14831	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016266	CTTA	3	15178	15190	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016266	ACCT	3	15220	15232	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016266	AG	6	15254	15264	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016266	TCTT	3	15529	15539	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016266	TTC	4	15728	15739	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016266	TTTTC	3	15941	15955	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016266	CTTT	3	17166	17177	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016266	GAAG	3	17924	17935	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016266	AAGC	3	18027	18038	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016266	AAG	4	18921	18931	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016266	TCT	4	19390	19400	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016266	GA	6	19762	19772	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016266	CCT	4	19867	19877	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016266	AAG	4	20043	20054	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016266	TC	6	20385	20395	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016266	TTTC	3	20396	20407	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016266	TC	7	20777	20789	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016266	AT	6	20937	20948	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016266	GAA	5	21834	21848	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016266	TA	6	22481	22492	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016266	TAA	4	23210	23220	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016266	AAGGAG	3	23344	23360	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016266	GA	6	24066	24076	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016266	GA	6	24584	24594	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016266	GAA	4	24625	24636	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016266	TC	6	25331	25341	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016266	CTAT	3	25357	25367	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016266	AT	6	25436	25447	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016266	AGA	5	25814	25827	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016266	ATCT	3	28245	28255	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016266	TA	6	28259	28269	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016266	GGCCT	3	29858	29872	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016266	CTG	4	29986	29997	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016266	TCCT	3	30079	30089	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016266	AT	6	30144	30154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016266	AGGG	3	30779	30790	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016266	CTT	4	31624	31634	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016266	GCTTGG	3	32666	32684	19	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
74	NC_016266	TTCTC	3	33679	33694	16	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016266	AT	6	33852	33863	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016266	CAGT	3	34246	34256	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016266	AAATG	3	35443	35457	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016266	AG	6	35689	35699	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016266	CCTT	3	35923	35934	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016266	CGAG	3	36822	36833	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016266	AGAA	3	37418	37430	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016266	TA	6	38365	38375	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016266	TCT	4	38986	38997	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016266	ACT	4	39897	39907	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016266	AAG	4	40689	40699	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016266	CAA	4	40778	40788	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016266	AAAG	3	41060	41071	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016266	AAG	4	41228	41239	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016266	AT	6	41607	41618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016266	CCTTG	3	42071	42084	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016266	TC	6	43590	43600	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016266	CCT	4	43619	43629	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016266	CT	7	44063	44075	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016266	AGAAA	3	44117	44130	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016266	TCT	4	44482	44493	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016266	CTTT	3	44622	44632	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016266	TCT	4	44669	44680	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016266	AGA	4	45016	45026	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016266	AAAG	3	45094	45106	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016266	TA	7	45140	45153	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016266	GAAA	4	45207	45222	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016266	CTT	4	45634	45644	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016266	AT	6	45855	45866	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016266	AGA	4	47462	47472	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016266	AT	6	47918	47929	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016266	CTTT	3	48325	48335	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016266	TTGA	3	48752	48763	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016266	CTA	4	49428	49438	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016266	TTCTT	3	49960	49974	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016266	TATGG	3	50275	50288	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016266	TTC	4	52559	52570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016266	CTA	4	53059	53069	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016266	GCC	4	53502	53512	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016266	AAAG	3	54178	54188	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016266	TA	6	54265	54276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016266	AG	6	54391	54401	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016266	CTT	4	54628	54639	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016266	GA	6	54640	54650	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016266	CTA	4	55440	55451	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016266	GAAA	3	55680	55690	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016266	TCTT	4	55867	55883	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016266	TTC	4	57410	57421	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016266	TTTA	3	58581	58592	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016266	AAG	4	58612	58624	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016266	AAGA	3	59130	59140	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016266	GTAAA	3	59955	59968	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016266	CT	6	61809	61819	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016266	TA	6	61880	61891	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016266	GAA	4	62916	62926	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016266	GAA	4	63611	63622	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016266	AGA	4	63662	63673	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016266	TA	6	64428	64439	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016266	CTTT	3	64693	64704	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016266	TTTG	3	65104	65114	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016266	GA	6	65581	65591	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016266	GCT	4	65893	65905	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016266	AGA	4	68030	68040	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016266	TCT	4	68933	68944	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016266	AAAG	4	69597	69611	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016266	TC	7	70653	70665	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016266	TCTT	3	70843	70854	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016266	AG	6	71089	71099	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016266	AAAAG	3	71111	71124	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016266	AAGTC	3	72548	72561	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016266	TCT	4	73354	73365	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016266	TCT	4	73618	73628	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016266	TCT	4	73978	73988	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016266	TTAAA	3	74525	74538	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 80