ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 77

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016265	TA	6	1472	1483	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016265	AGA	4	2023	2034	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016265	CAT	4	2891	2902	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016265	AAG	5	3823	3837	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016265	GA	6	3852	3862	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016265	CTTT	3	4018	4030	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016265	TCT	5	4189	4203	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016265	AAGT	4	4301	4316	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016265	AT	6	4432	4443	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016265	GAA	4	4570	4581	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016265	GAAA	3	4764	4776	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016265	TGAA	3	5117	5127	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016265	AAAG	3	5853	5864	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016265	GGGC	3	5917	5928	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016265	TTCT	3	6302	6312	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016265	TA	8	7104	7118	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016265	CTT	4	7209	7219	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016265	GGTT	3	7743	7755	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016265	TCT	4	7967	7978	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016265	AAAG	3	9155	9166	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016265	AAAAG	3	9630	9645	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016265	CTC	4	9815	9826	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016265	TA	7	10679	10691	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016265	TCT	4	11923	11934	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016265	CCT	4	12673	12683	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016265	CATA	3	13445	13455	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016265	AGAA	3	13641	13651	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016265	GAA	4	14331	14343	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016265	GAAA	3	15606	15616	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016265	GGGA	3	15956	15967	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016265	TA	6	17275	17286	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016265	AG	7	18173	18185	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016265	AAG	4	19822	19834	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016265	CCAC	3	21373	21384	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016265	CG	6	21884	21895	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016265	CTT	4	22033	22045	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016265	CCTC	3	23777	23788	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016265	CTTG	3	24229	24239	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016265	TTTGT	3	25146	25161	16	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016265	CTT	4	26428	26438	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016265	TCT	5	26561	26574	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016265	CAG	4	27200	27211	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016265	CT	6	27974	27984	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016265	TAAGAA	3	28183	28200	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_016265	CCTCT	3	28315	28330	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016265	TA	6	28475	28486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016265	TC	7	29123	29135	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016265	TA	6	29330	29341	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016265	AGAA	3	30682	30692	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016265	AGA	4	31941	31952	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016265	AGA	4	32030	32041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016265	GA	7	32058	32070	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016265	AT	6	32100	32110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016265	ATAG	3	32380	32390	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016265	TCT	4	32473	32483	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016265	AAAG	3	32803	32814	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016265	CTT	4	33274	33285	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016265	CTT	4	33353	33364	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016265	TGCC	3	33498	33508	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016265	AT	6	34123	34134	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016265	TCTT	3	34344	34355	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016265	GTCT	3	34393	34404	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016265	CAAGG	3	34524	34537	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016265	TTTA	3	35085	35096	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016265	AG	7	36026	36038	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016265	TAG	4	37130	37140	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016265	TCTA	3	37341	37351	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016265	CTTA	3	38628	38639	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016265	TA	6	39286	39297	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016265	TTAA	3	40200	40211	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016265	TCTT	3	40783	40794	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016265	TCTT	3	42138	42149	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016265	TCC	4	42379	42390	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016265	TC	6	42559	42570	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016265	CTT	4	43226	43237	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016265	GCT	4	43912	43922	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016265	TTGC	3	44039	44049	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016265	TCT	4	44844	44855	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016265	AGGAA	3	46016	46029	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016265	TTCG	3	46533	46543	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016265	TCATT	3	47513	47526	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016265	AG	6	48573	48583	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016265	TCCT	3	49068	49078	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016265	TA	7	49264	49277	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016265	AGC	4	51586	51596	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016265	TCA	4	51916	51928	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016265	CTTT	3	51932	51943	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016265	TCT	4	52373	52384	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016265	ACGA	3	53353	53364	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016265	AT	6	53448	53459	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016265	AAGT	3	53851	53862	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016265	GAG	4	55076	55086	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016265	TA	6	55299	55310	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016265	CTT	4	56167	56177	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016265	AGGC	3	56875	56886	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016265	AGA	5	57094	57107	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016265	AGG	4	58148	58159	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016265	TCT	4	59164	59174	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016265	ATC	4	59674	59684	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016265	TTAT	3	60015	60027	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016265	CTCTT	3	60593	60606	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016265	TCT	4	61232	61243	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016265	CTT	4	62203	62215	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016265	GT	7	62891	62904	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016265	AGA	4	63275	63287	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016265	TC	6	63868	63880	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016265	CAAA	3	64138	64148	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016265	TA	6	66069	66080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016265	TA	6	66283	66294	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016265	TCA	4	68186	68197	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016265	CCTT	3	68335	68345	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016265	AGA	4	68410	68420	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016265	TA	6	69510	69520	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016265	GTTT	3	69643	69653	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016265	CT	6	69783	69793	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016265	GTAA	3	69855	69866	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016265	ACTTG	3	70511	70524	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016265	GCA	4	71888	71899	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016265	TTC	4	71952	71962	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016265	AGGA	3	72475	72485	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016265	AT	6	72505	72515	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016265	GGTT	3	72559	72570	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016265	GA	7	73030	73042	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016265	AAAG	3	73158	73168	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016265	TTGC	3	73351	73361	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016265	TCT	4	73758	73768	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016265	TG	6	74150	74161	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016265	TA	8	74753	74767	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016265	GGCT	3	75593	75603	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding

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