ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 35

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016262	ACT	4	384	395	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016262	ATTA	3	3722	3733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016262	TA	6	3738	3748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016262	ATT	4	3805	3816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016262	CTTT	3	4208	4218	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016262	GTAT	3	4763	4773	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016262	ATAG	3	4936	4947	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016262	ACT	4	4970	4980	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016262	TTTA	3	5469	5480	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016262	AT	6	6158	6168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016262	AGCG	3	6188	6198	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016262	TCT	4	6868	6879	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016262	CTA	4	7099	7110	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016262	TC	7	7535	7547	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016262	AGT	4	8576	8587	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016262	TAG	5	8859	8872	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016262	AAG	4	9042	9052	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016262	TGTA	3	9084	9095	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016262	TC	6	9375	9385	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016262	CTAT	3	9420	9430	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016262	GTTT	4	9987	10002	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016262	GGAC	3	11236	11246	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016262	TCT	4	12459	12470	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016262	TCT	4	12825	12837	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016262	TAAC	3	12909	12919	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016262	TAG	4	13198	13208	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016262	TA	7	13280	13292	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016262	CTA	4	14120	14131	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016262	TCTT	3	14309	14319	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016262	TCT	4	15030	15042	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016262	CTA	4	15162	15172	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016262	TAT	4	15214	15227	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016262	CTA	4	15771	15781	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016262	TA	7	16078	16091	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016262	TTGC	3	16356	16366	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016262	TCTA	3	17182	17194	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016262	TAC	4	17239	17252	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016262	AAG	4	17893	17905	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016262	TCTT	3	17936	17947	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016262	TCCTT	3	18184	18197	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016262	CTTTG	3	18536	18549	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016262	TA	7	18712	18724	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016262	AG	6	18994	19004	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016262	AAAG	3	19121	19132	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016262	AGAA	3	19605	19615	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016262	CTGC	3	19888	19899	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016262	ATG	4	20343	20353	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016262	AG	6	20876	20886	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016262	AG	6	21298	21308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016262	TTTC	3	21400	21411	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016262	TCTT	7	21590	21617	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
52	NC_016262	AGCA	3	21679	21690	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016262	TTC	5	22238	22251	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016262	AT	6	22541	22552	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016262	TC	6	22761	22771	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016262	CTTT	3	23144	23154	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016262	AG	6	24133	24143	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016262	TCT	4	24179	24190	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016262	AAG	4	24312	24323	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016262	TCT	4	26296	26306	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016262	GGAG	3	26953	26963	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016262	TTTTC	3	27705	27719	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	35796724
63	NC_016262	CTGC	3	29339	29350	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016262	GAA	4	30059	30071	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016262	CTT	4	30447	30458	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016262	CAT	4	30453	30464	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016262	GCTCAT	3	30471	30488	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
68	NC_016262	CCTT	3	30621	30633	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016262	CTTT	3	30775	30787	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016262	GAAA	3	31414	31424	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016262	CTA	5	31910	31924	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016262	CT	6	32006	32016	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016262	TG	6	32274	32285	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016262	CT	6	33085	33095	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016262	ATAA	3	33515	33526	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016262	CTTT	3	33956	33967	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016262	TA	6	34234	34245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016262	CTT	4	35408	35419	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016262	CT	6	36784	36794	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016262	TA	6	37094	37105	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016262	AAAC	3	40621	40632	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016262	GCAA	4	40783	40798	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016262	AAGA	4	42304	42319	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016262	CTTT	4	43492	43507	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016262	CTT	4	43853	43864	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016262	TC	6	43973	43983	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016262	AAGT	4	44089	44103	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016262	TAGA	3	44222	44233	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016262	GAA	4	44345	44356	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016262	AGGT	3	44577	44588	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016262	GCTT	3	45590	45602	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016262	CTTT	3	45977	45988	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016262	GA	6	46294	46304	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016262	AGT	4	46601	46612	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016262	CTTA	3	47212	47222	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016262	GCTA	3	47283	47293	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016262	GAA	4	47829	47841	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016262	CTA	5	49153	49166	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016262	CCTTT	3	49541	49556	16	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016262	TA	7	50676	50688	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016262	AG	6	51221	51231	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016262	AGT	5	51526	51541	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016262	CGG	4	51542	51553	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016262	GATAA	3	51934	51947	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016262	TAA	4	52319	52330	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016262	ATTT	3	52572	52583	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016262	TTGC	3	53196	53206	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016262	CTTT	3	53915	53925	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016262	AAAG	3	54072	54083	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016262	CAT	4	55615	55626	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016262	CTAT	3	56702	56714	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016262	AATT	3	58055	58066	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016262	CTAT	3	58399	58410	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016262	CTAA	3	58756	58767	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016262	TA	6	58892	58902	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016262	GATA	4	59116	59131	16	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016262	CTT	5	60022	60036	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016262	GGAAA	3	60778	60792	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016262	ACT	4	60812	60823	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016262	TCCT	3	61120	61131	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016262	TTTTTC	3	61678	61695	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016262	CTAC	3	61893	61903	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016262	CTC	4	62032	62043	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016262	AGG	4	62404	62415	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016262	TAC	4	62786	62797	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016262	ATAA	3	63968	63979	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016262	CTT	4	64509	64520	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016262	CTT	4	64752	64763	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016262	AT	6	65449	65460	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016262	AGA	4	66026	66037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016262	TC	6	67293	67303	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016262	AAAG	3	67610	67620	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016262	CT	7	67862	67874	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016262	AT	6	68352	68363	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016262	CT	6	68523	68533	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016262	ATCT	3	70176	70186	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016262	GTT	4	70235	70246	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016262	AG	7	70400	70412	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016262	AT	6	70467	70478	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016262	TAAG	3	70648	70659	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016262	TA	6	71687	71698	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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173	NC_016262	TTCT	3	88724	88735	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
174	NC_016262	TCTT	3	88786	88797	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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183	NC_016262	CTTT	3	92731	92742	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016262	TAAG	3	92809	92820	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
185	NC_016262	AAG	4	92962	92973	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
186	NC_016262	GA	6	93347	93357	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
187	NC_016262	TGAA	3	93398	93408	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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193	NC_016262	AGAA	3	97141	97151	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
194	NC_016262	GA	6	97184	97194	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
195	NC_016262	GGTCA	3	98089	98103	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
196	NC_016262	TCT	4	98737	98747	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
197	NC_016262	AT	8	99827	99841	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 35