ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 41

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016261	TCGT	3	61	72	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016261	TA	7	254	266	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016261	TATT	3	1104	1115	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016261	GATTA	3	1978	1992	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016261	AGAA	3	2372	2382	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016261	CTT	4	3284	3295	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016261	TGC	4	3489	3501	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016261	AGAA	3	4754	4765	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016261	AAG	4	5238	5249	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016261	AAGG	3	5518	5528	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016261	CTTT	3	6808	6819	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016261	AG	6	7094	7104	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016261	CG	6	7723	7734	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016261	TTAG	3	7879	7889	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016261	GA	8	8114	8128	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016261	CCT	4	8957	8968	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016261	TC	7	9810	9822	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016261	AAAGAA	3	10164	10181	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016261	TTTC	3	10365	10376	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016261	GA	8	10943	10957	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016261	GA	7	10971	10983	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016261	CTTT	4	11063	11078	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016261	TCTT	4	11150	11165	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016261	TCC	4	11644	11655	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016261	CCT	5	12352	12365	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016261	TCTCCT	3	12571	12587	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
27	NC_016261	TTG	4	12757	12769	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016261	TTCTT	3	12773	12786	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016261	TCT	4	14381	14393	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016261	CTT	5	14412	14425	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35796724
31	NC_016261	CCT	4	15736	15746	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016261	CTTT	3	16766	16777	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35796724
33	NC_016261	AGA	4	17714	17725	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016261	CTCTCC	4	17978	18000	23	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	4 %	Non-Coding
35	NC_016261	CG	6	18083	18094	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016261	GACT	3	18996	19007	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016261	CTTG	3	19284	19295	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016261	GGAAA	3	19590	19603	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016261	TCTCCT	3	19801	19817	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016261	GAA	4	20136	20148	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016261	GCG	4	20160	20170	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016261	AT	8	21286	21301	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016261	TA	6	21722	21732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016261	AGA	5	22751	22766	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016261	CTAA	3	23253	23264	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016261	AGA	4	23450	23461	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016261	TCTT	3	23598	23609	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016261	TAAG	3	24735	24745	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016261	CTT	4	24945	24955	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016261	CT	6	25376	25386	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016261	TCGA	3	26604	26615	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016261	TAAAG	3	26652	26666	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016261	AGA	4	28469	28479	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016261	TGCA	3	28717	28727	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016261	GTCT	3	29276	29286	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016261	TA	6	29790	29800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016261	TA	6	32486	32498	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016261	TGC	4	32514	32526	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016261	AT	6	33338	33351	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016261	GAG	4	33352	33362	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016261	TA	6	34796	34807	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016261	ATAGG	3	35225	35238	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016261	TTAT	3	35837	35848	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016261	CT	8	36090	36104	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016261	GC	6	36402	36412	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016261	TA	6	36499	36511	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016261	CT	6	36918	36928	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016261	TA	7	37401	37413	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016261	GAAA	3	38233	38244	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016261	CAA	4	41868	41878	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016261	TTAG	3	41908	41918	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016261	TTC	4	42941	42952	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016261	TTA	4	43231	43242	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016261	GTA	4	43360	43370	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016261	TA	6	43477	43487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016261	AAAT	3	43853	43865	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016261	AGT	4	44679	44690	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016261	AG	6	44912	44922	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016261	GTC	4	46484	46494	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016261	CT	6	46598	46609	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016261	ATTC	3	47015	47025	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016261	GAT	4	48534	48544	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016261	CTTTT	3	48547	48561	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016261	CT	6	49890	49900	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016261	ACA	4	50101	50111	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016261	TA	8	50208	50223	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016261	AGA	4	51213	51225	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016261	AT	6	51381	51391	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016261	GAAA	3	53754	53765	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016261	TTGA	3	54988	54999	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016261	AAAG	3	55504	55514	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016261	GCA	4	59197	59209	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016261	CAG	4	61885	61896	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016261	AGA	4	61898	61909	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016261	AAAG	3	62695	62706	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016261	TTGTCT	3	62757	62775	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
97	NC_016261	CT	6	62880	62890	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016261	CT	6	62974	62984	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016261	TA	6	63229	63239	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016261	GAA	4	63870	63881	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016261	GGA	4	64345	64355	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016261	TAAG	3	65996	66007	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016261	TTCT	3	66102	66113	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016261	TTG	4	66572	66582	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016261	AGG	4	66861	66872	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016261	CTT	5	67087	67101	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016261	TGAA	3	67763	67773	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016261	GA	6	67801	67811	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016261	AG	6	67846	67856	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016261	CG	6	68495	68506	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016261	GT	6	70167	70178	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016261	TC	6	70580	70592	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016261	TTTCT	3	71732	71746	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016261	CTT	4	72243	72254	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016261	GAA	4	72602	72613	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016261	GA	6	72789	72800	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016261	GAAA	3	73187	73197	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016261	CT	6	74101	74111	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016261	AAGG	3	74585	74596	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016261	CTA	4	75259	75269	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016261	AGA	4	75506	75516	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016261	AGA	4	76113	76123	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016261	AAG	5	76217	76230	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016261	TA	6	76319	76329	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016261	CTT	4	76611	76621	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016261	TG	6	76718	76728	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016261	TA	7	77862	77874	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016261	ACGA	3	78171	78182	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016261	CCT	4	78355	78366	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016261	CTT	4	78441	78451	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016261	AGAA	3	79186	79196	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016261	TC	7	79362	79375	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016261	GAAA	4	80800	80815	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016261	CTAC	3	80952	80962	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016261	TCTT	3	81050	81061	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016261	TGGC	3	81180	81191	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016261	TC	6	81753	81763	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016261	AG	6	82285	82297	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016261	GAG	4	84211	84222	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016261	CTT	4	84409	84419	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016261	GAA	4	84714	84725	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016261	GA	8	85219	85233	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016261	AG	6	85411	85421	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016261	TA	6	86766	86776	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016261	CTAAG	3	86989	87002	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
146	NC_016261	AAAG	3	87232	87243	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016261	GCT	4	88248	88259	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016261	CGAG	3	89302	89314	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016261	AGTA	3	89506	89517	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016261	TA	6	90731	90742	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016261	TA	6	91820	91830	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016261	AGA	4	92518	92529	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016261	ACT	6	93309	93327	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
154	NC_016261	AAGC	3	93759	93769	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016261	GA	6	94503	94514	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_016261	AT	6	94655	94666	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
157	NC_016261	TTTC	3	94803	94814	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
158	NC_016261	AATA	3	95276	95287	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_016261	GAAC	3	95522	95534	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
160	NC_016261	AGA	4	96364	96376	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_016261	TA	7	96853	96865	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 41