ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 40

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016260	CTTT	3	3	13	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016260	TTTC	3	652	663	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016260	TC	6	899	910	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016260	TC	6	1260	1270	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016260	TCT	4	1378	1390	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016260	TTTC	3	1644	1655	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016260	AG	6	1944	1955	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016260	TGAA	3	2171	2181	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016260	GA	6	2278	2288	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016260	GAG	4	2950	2961	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016260	GAG	4	3026	3037	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016260	TGT	4	3405	3417	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016260	CTT	5	3547	3561	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016260	TTCTCC	3	3924	3940	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016260	CTTT	3	4333	4344	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016260	CTTT	3	4879	4890	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016260	TTTC	3	5216	5227	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016260	CTT	4	5574	5584	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016260	TTCT	3	5825	5836	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016260	AT	6	6080	6091	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016260	TTCT	3	6641	6651	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016260	CT	6	8290	8300	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016260	CCT	4	8511	8522	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016260	TCTT	3	8888	8899	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016260	GAA	4	9114	9125	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016260	AGA	4	9552	9562	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016260	TGT	4	9626	9636	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016260	TA	6	10232	10242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016260	TTTGA	3	10326	10339	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016260	TA	7	10641	10654	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016260	TA	9	12175	12191	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_016260	AAGA	3	12286	12297	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016260	TCT	4	12625	12635	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016260	CTT	4	13209	13221	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016260	GACT	3	13488	13499	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016260	CTTG	3	14175	14186	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016260	CTTTT	3	15032	15047	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016260	AAAG	3	15070	15081	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016260	AGC	4	15478	15489	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016260	CT	6	16012	16023	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016260	TGAC	3	16546	16556	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016260	TAT	4	16926	16937	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016260	AG	6	17726	17736	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016260	CTTT	3	19127	19137	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016260	TA	7	19908	19921	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016260	TC	6	20504	20515	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016260	AAG	4	20630	20641	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016260	TA	6	20951	20962	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016260	TA	8	21030	21044	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016260	AGAA	3	21477	21488	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016260	AGCA	3	21880	21890	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016260	TAG	5	21940	21953	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016260	GTA	4	23524	23534	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016260	GA	6	23606	23617	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016260	GA	6	23684	23694	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016260	CAAA	3	24221	24231	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016260	CTTT	3	24338	24349	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016260	TAGT	3	24718	24730	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016260	CTT	4	26351	26362	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016260	CTTT	3	27647	27658	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016260	GCTC	3	29092	29103	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016260	TTTC	3	29743	29753	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016260	TA	11	29918	29938	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016260	TAG	4	30012	30023	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016260	GAGG	3	30316	30327	12	25 %	0 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016260	TA	6	30500	30511	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016260	AGA	4	30748	30759	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016260	CT	6	32595	32606	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016260	CTTA	3	34322	34332	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016260	AAG	4	34749	34760	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016260	TTC	4	34832	34844	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016260	ACCT	4	35653	35667	15	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016260	CTT	4	35694	35704	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016260	CCTA	3	35994	36004	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016260	TA	6	36035	36045	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016260	CTT	4	36144	36155	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016260	AG	6	37159	37169	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016260	TACC	3	38097	38108	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016260	AGAA	3	38891	38903	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016260	AAGC	3	39686	39697	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016260	TTCT	3	39741	39752	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016260	AAGA	4	39976	39991	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016260	GAGG	3	40709	40720	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016260	ACAA	3	40762	40773	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016260	TA	8	41574	41588	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016260	CCTTA	3	41963	41976	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016260	AAGT	3	42053	42064	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016260	GTA	4	42348	42359	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016260	AGA	4	43774	43785	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016260	AAG	4	44061	44072	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016260	GA	6	44736	44746	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016260	AAG	4	45110	45121	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016260	TTC	4	45283	45295	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016260	TA	6	45297	45308	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016260	GAAA	3	47372	47384	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016260	TGAA	3	47720	47731	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016260	ACTT	3	48057	48068	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016260	CT	8	49074	49088	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016260	AAAG	3	49891	49902	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016260	AACG	3	50545	50556	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016260	CTTT	3	50811	50822	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016260	TCT	4	50986	50997	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016260	TTTA	3	51194	51205	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016260	A	14	51870	51883	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016260	ACTA	3	53095	53105	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016260	TA	6	53107	53117	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016260	AGCAA	4	53318	53338	21	60 %	0 %	20 %	20 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016260	TAC	4	54312	54322	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016260	TTAC	3	55019	55030	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016260	GAAA	3	55455	55466	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016260	CTTTA	3	56359	56373	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016260	TA	9	57205	57221	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_016260	GT	6	57752	57763	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016260	AAG	4	57993	58004	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016260	AGA	4	58306	58317	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016260	AGA	4	58618	58629	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016260	GTTG	3	58714	58725	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016260	ATGT	3	58837	58848	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016260	AT	6	60057	60068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016260	GTAT	4	61001	61015	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016260	CTTTA	3	61093	61108	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016260	TA	6	61558	61568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016260	GA	8	62433	62447	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016260	GAG	4	63094	63105	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016260	GAA	4	65371	65382	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016260	AG	6	66439	66452	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016260	GCCT	3	66555	66565	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016260	TAAT	3	66805	66816	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016260	TAC	4	66838	66849	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016260	TTGG	3	67007	67019	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016260	TAG	5	67032	67046	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016260	CTT	4	67665	67676	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016260	TA	9	68474	68490	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_016260	TA	6	69381	69392	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016260	CTG	4	70976	70987	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016260	ACGT	3	71093	71105	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016260	CTT	4	71233	71244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016260	AGG	4	72511	72521	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016260	AGCA	3	72946	72958	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016260	GCT	4	73594	73604	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016260	ATAGA	3	74646	74660	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016260	TAG	4	74989	74999	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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177	NC_016260	CTG	4	93672	93682	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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183	NC_016260	TA	6	96774	96785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
184	NC_016260	CTT	4	97374	97384	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 40