ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 53

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016258	CT	6	441	452	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016258	ATAC	3	1723	1734	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016258	TAAC	3	1871	1881	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016258	AAGG	3	1916	1927	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016258	TGAA	3	2286	2296	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016258	AAAG	4	3098	3112	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016258	AT	6	3306	3316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016258	AT	8	3900	3915	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016258	TTTC	4	4719	4734	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016258	AGA	4	5298	5309	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016258	AG	6	5335	5347	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016258	GGAA	4	5666	5680	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016258	GAG	4	6338	6348	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016258	CA	7	6559	6571	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016258	AT	8	6691	6705	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016258	AAAG	3	7284	7295	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016258	AAGA	3	7694	7704	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016258	AGA	4	7837	7849	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016258	ATAA	3	9567	9578	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016258	AT	8	10132	10147	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016258	CGAA	3	10796	10808	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016258	CAA	4	11320	11330	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016258	GAAA	3	11445	11455	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016258	TC	7	11808	11820	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016258	AAT	4	11923	11934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016258	TCAGA	3	12095	12108	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016258	TC	7	12790	12802	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016258	AGA	4	13982	13993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016258	AAACC	3	14141	14155	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016258	TC	6	14246	14256	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016258	AT	6	14408	14419	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016258	CAAG	3	14613	14623	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016258	GTC	4	14870	14880	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016258	GA	6	16698	16709	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016258	ATT	4	17729	17740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016258	AACT	3	18678	18690	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016258	TA	6	18690	18701	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016258	AG	7	18795	18807	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016258	ATCT	3	19000	19012	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016258	AT	8	21327	21341	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016258	GAAA	3	21528	21538	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016258	GCC	4	21862	21872	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016258	CTGA	3	22011	22022	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016258	TTC	4	23091	23102	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016258	TTCT	3	24874	24884	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016258	AAGC	3	24926	24936	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016258	AGC	4	25043	25053	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016258	AGC	4	25450	25460	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016258	AAAG	3	25889	25900	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016258	CTA	4	26742	26752	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016258	GA	7	27420	27432	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016258	GAA	4	27439	27451	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016258	TTC	5	27605	27618	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016258	AG	6	27728	27738	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016258	TGAA	3	27891	27901	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016258	TATTCT	3	28949	28966	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
57	NC_016258	AT	6	29111	29122	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016258	CTT	4	30280	30291	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016258	ATGT	3	30760	30770	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016258	AAAAG	4	30979	30997	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_016258	AGTT	3	31490	31501	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016258	TCT	5	31509	31523	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016258	CT	9	31964	31980	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016258	TCTT	3	32119	32130	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016258	AAG	4	32266	32277	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016258	TCCT	3	33120	33130	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016258	ATA	4	34635	34645	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016258	TTC	4	34695	34705	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016258	AAAG	3	35311	35321	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016258	CAA	4	36749	36760	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016258	TTTC	4	37480	37494	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016258	TC	7	38114	38128	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016258	ATA	5	38336	38349	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016258	CTTG	3	38447	38457	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016258	GAGTA	3	38776	38790	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016258	TA	6	39587	39599	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016258	CAGA	3	39955	39965	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016258	TTC	4	41140	41152	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016258	TCT	5	41594	41608	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016258	TC	6	41719	41730	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016258	AAGAGT	3	42228	42246	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
82	NC_016258	CTTT	3	42320	42331	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016258	TC	6	42488	42498	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016258	TA	6	43439	43450	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016258	CTT	4	43600	43612	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016258	AT	6	43663	43673	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016258	CTA	4	44593	44604	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016258	CTACT	3	45742	45755	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016258	AG	6	46524	46535	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016258	GAA	4	47247	47259	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016258	TAAG	3	47627	47637	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016258	GAG	4	48730	48740	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016258	GAAA	3	49683	49694	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016258	CTT	4	51356	51366	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016258	AAAG	3	51413	51425	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016258	TCCT	3	51475	51486	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016258	AGGT	3	51687	51697	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016258	AT	6	52981	52991	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016258	AGG	4	53414	53424	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016258	AAG	7	54401	54420	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_016258	ACAG	3	55124	55134	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016258	AAAG	3	55306	55316	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016258	TA	6	55766	55776	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016258	CTTT	3	56975	56986	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016258	CTAG	3	57559	57569	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016258	CTTT	3	58886	58896	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016258	CT	6	59823	59833	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016258	AAC	4	60530	60541	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016258	AGAA	3	61422	61432	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016258	TTTCTT	3	61780	61798	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016258	TTCC	3	61949	61960	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016258	GA	6	62568	62578	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016258	AAGT	3	63191	63201	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016258	AAG	4	63495	63505	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016258	GA	6	64466	64476	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016258	GA	6	65545	65555	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016258	TAG	5	65638	65652	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016258	AAGG	3	66929	66941	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016258	ATGAGC	3	67074	67091	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
120	NC_016258	ATG	4	67098	67109	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016258	AAG	4	67104	67115	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016258	CTT	4	67490	67502	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016258	TGAA	3	67670	67680	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016258	GAAAA	3	69843	69857	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	35796724
125	NC_016258	AAAAG	3	70969	70982	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016258	TAC	4	71183	71193	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016258	AGC	4	72164	72175	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016258	TC	6	73210	73222	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016258	TC	6	74144	74154	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016258	CTTT	3	76203	76214	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016258	TTAC	3	77126	77136	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016258	AGA	4	78442	78452	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016258	ATGT	3	79107	79117	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016258	ACT	4	79749	79761	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016258	AT	7	80193	80205	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016258	TCT	4	80220	80231	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016258	AG	8	80478	80492	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016258	TTTCT	3	80653	80666	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016258	TA	7	80962	80974	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016258	TAGA	3	81365	81376	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016258	CCTT	3	82141	82151	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016258	CCAC	3	82345	82356	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016258	AT	6	82466	82477	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016258	ACCT	3	83065	83075	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016258	AAGAA	3	83323	83337	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
146	NC_016258	TCT	4	85252	85263	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016258	CAAAG	3	85637	85650	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
148	NC_016258	TA	7	86279	86291	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016258	CAAG	3	86526	86537	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016258	GAAA	3	87178	87188	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016258	CT	6	87386	87397	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 53