ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 54

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016257	AT	6	14	25	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016257	AG	6	243	253	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016257	TCTTAT	3	414	431	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016257	CTCTT	3	822	836	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016257	GA	6	1300	1310	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016257	CTT	4	1706	1716	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016257	CTT	4	2215	2227	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016257	AGAA	3	2630	2640	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016257	CG	6	3130	3141	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016257	TCT	4	3328	3339	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016257	AG	6	3465	3475	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016257	CTT	4	3769	3779	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016257	GA	6	4611	4621	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016257	CTT	4	4775	4786	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016257	TA	7	4918	4931	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016257	CTT	4	5154	5164	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016257	TGC	4	5414	5425	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016257	CTT	4	6232	6242	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016257	AGA	4	6337	6347	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016257	TTC	4	7853	7864	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016257	CTTT	3	8362	8373	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016257	ATTCTT	3	8376	8392	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
23	NC_016257	AGGCA	3	8682	8696	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016257	AT	6	10068	10079	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016257	CGAA	3	10525	10536	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016257	CTT	4	10579	10590	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016257	AT	6	11630	11641	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016257	CCT	4	11992	12003	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016257	CTTT	3	12389	12400	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016257	GGA	4	12646	12657	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016257	GA	6	13100	13110	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016257	TTCT	3	13448	13458	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016257	AT	6	13747	13758	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016257	TCC	4	15168	15179	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016257	CT	6	15789	15799	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016257	GAA	4	16928	16939	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016257	TTCC	3	17239	17250	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016257	CCTTT	3	17914	17927	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016257	AAG	4	18750	18762	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016257	TCAAG	3	18819	18832	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016257	CTT	4	20349	20359	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016257	CTT	4	20598	20608	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016257	T	13	20634	20646	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016257	GA	6	20970	20980	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016257	CG	6	21238	21249	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016257	TCTCCT	3	21399	21415	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016257	TCTCCT	3	21450	21466	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016257	AAAAGA	3	21558	21575	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016257	CTTTG	3	23520	23535	16	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016257	TA	6	23607	23618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016257	CT	6	24347	24361	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016257	AAGA	3	25186	25197	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016257	CTT	4	25287	25299	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016257	CTTT	3	25516	25526	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016257	AGA	4	25668	25679	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016257	TTAG	3	26320	26330	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016257	CTA	4	26863	26873	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016257	GGAA	3	27048	27059	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016257	TTCA	3	28163	28173	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016257	GAA	4	28359	28370	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016257	CTA	4	28394	28404	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016257	AAAG	3	28965	28976	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016257	CTTT	3	29225	29236	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016257	TCAGA	3	29783	29796	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016257	AT	6	30713	30723	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016257	TAG	4	31062	31072	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016257	TA	6	31212	31223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016257	GA	7	31737	31750	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016257	GA	6	31866	31876	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016257	CTT	4	32195	32205	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016257	CCTC	3	32992	33002	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016257	GAA	4	33328	33340	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016257	GAAA	3	34143	34153	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016257	CTC	4	34481	34492	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016257	TA	6	35194	35204	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016257	CTC	4	35345	35355	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016257	CCT	4	35379	35389	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016257	TC	7	35401	35413	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016257	AAAG	3	36106	36117	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016257	AAG	4	36278	36288	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016257	CTTT	3	37270	37280	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016257	TA	6	37966	37976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016257	GTTA	3	39877	39887	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016257	CCTT	3	39962	39972	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016257	TC	6	40125	40135	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016257	TC	6	41039	41049	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016257	AAAG	3	41451	41462	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016257	TA	6	43115	43125	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016257	AAAG	3	43524	43535	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016257	TA	7	44024	44036	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016257	TAAA	3	44976	44988	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016257	TAG	4	45091	45102	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016257	ATA	4	46796	46806	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016257	AGCTA	3	46818	46832	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016257	GAC	4	48985	48996	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016257	TCC	4	49385	49395	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016257	CT	6	49562	49572	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016257	GTGG	3	49607	49618	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016257	AT	6	50243	50254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016257	GGT	4	51264	51275	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016257	TG	6	51280	51290	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016257	CT	6	51554	51565	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016257	ACGC	3	51570	51581	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016257	GAAA	3	51811	51821	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016257	TTC	4	52097	52108	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016257	CTT	4	53568	53579	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016257	TC	6	54171	54182	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016257	TA	6	54193	54203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016257	AACC	3	55825	55836	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016257	TAG	4	55882	55892	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016257	CTTA	5	56420	56439	20	25 %	50 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
112	NC_016257	AGC	4	57378	57389	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016257	AT	7	59159	59171	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016257	CT	6	59842	59855	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016257	ATAAG	3	60568	60583	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016257	AG	6	60764	60774	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016257	CTT	4	62760	62771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016257	AG	6	63062	63072	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016257	TATC	3	63077	63089	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016257	AACC	3	63169	63179	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016257	CAAA	3	63384	63394	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016257	GTT	4	63925	63936	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016257	TA	6	64360	64371	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016257	GT	6	65076	65086	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016257	AAAG	3	65273	65284	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016257	GGAA	3	65308	65318	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016257	TA	6	65964	65974	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016257	GA	6	66604	66614	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016257	CGC	4	67036	67047	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016257	TGAA	3	67596	67606	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016257	GA	7	68022	68034	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016257	CTT	4	68281	68292	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016257	CAAG	3	68477	68489	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016257	TCT	4	68534	68545	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016257	AGTC	3	68769	68780	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016257	GAA	4	68912	68922	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016257	GAA	4	69076	69088	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016257	GAA	4	69243	69255	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016257	GCTA	3	69616	69626	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016257	TCT	4	69649	69660	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016257	TGT	4	69775	69786	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016257	AG	7	70075	70087	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
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182	NC_016257	CTT	4	86455	86465	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
183	NC_016257	AAAG	4	87138	87153	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 54