ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 50

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016253	CTT	4	48	58	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016253	TA	6	1781	1792	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016253	GAAA	3	3714	3724	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016253	TCAA	3	4356	4367	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016253	AGA	4	5844	5855	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016253	CTTT	5	7684	7704	21	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016253	CCTGA	3	9190	9204	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016253	AAG	4	10107	10118	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016253	TCT	4	10966	10976	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016253	TA	7	11549	11561	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016253	TTC	4	12028	12039	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016253	TA	6	12090	12102	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016253	AAG	4	12319	12330	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016253	GCTA	3	12524	12534	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016253	CT	6	14353	14363	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016253	GAGAC	3	14820	14833	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016253	AGA	4	15006	15016	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016253	AAG	4	15272	15282	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016253	TAAG	3	15376	15386	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016253	GAAA	3	15997	16007	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016253	TCC	4	16176	16186	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016253	AAG	4	16491	16502	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016253	TC	7	16972	16984	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016253	GAA	4	17401	17411	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016253	AAG	5	17437	17451	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016253	CT	6	17831	17841	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016253	CAA	4	18000	18011	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016253	GAA	4	18030	18041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016253	TC	6	18844	18856	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016253	CTTT	3	18980	18991	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016253	TC	6	19184	19194	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016253	TC	7	19958	19970	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016253	AAG	4	20630	20641	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016253	ACTTG	3	21437	21450	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016253	AAAG	3	22004	22014	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016253	CTT	4	22924	22935	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016253	TCT	4	23659	23670	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016253	AAAG	3	23791	23802	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016253	AGA	4	24216	24227	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016253	TTTC	4	24834	24848	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016253	ACT	4	25290	25300	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016253	TCT	4	25804	25814	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016253	CTG	4	26000	26011	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016253	TA	6	26537	26547	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016253	GA	6	27249	27259	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016253	GAA	4	27385	27395	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016253	AGGC	3	27984	27995	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016253	GCATCT	3	28061	28077	17	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016253	CGAG	3	28114	28125	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016253	TCAA	3	28834	28844	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016253	CTATA	3	30052	30067	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016253	AAG	4	30287	30298	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016253	ACT	4	33177	33187	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016253	CCTT	3	33379	33390	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016253	GCCT	3	34807	34818	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016253	AAGG	3	35422	35432	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016253	TCTT	4	35576	35591	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016253	CGT	4	35881	35891	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016253	CTT	4	36577	36589	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016253	AGC	4	37845	37855	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016253	ACCT	3	38330	38340	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016253	AAG	4	38841	38851	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016253	TCT	4	39740	39751	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016253	AAAG	3	40597	40608	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016253	GACTA	3	41152	41165	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016253	TA	7	41472	41484	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016253	CCT	4	42043	42054	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016253	AAAG	3	42165	42176	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016253	AGAA	3	42260	42271	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016253	AT	10	43829	43847	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
71	NC_016253	CTA	4	44068	44079	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016253	AAGG	3	44620	44631	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016253	TCT	4	45584	45594	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016253	CTA	5	45653	45668	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016253	GTCTT	3	47002	47015	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016253	GTA	4	47696	47706	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016253	GCAA	3	48119	48129	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016253	CTT	4	48283	48295	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016253	TA	13	48457	48480	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016253	TTG	4	48941	48953	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016253	GA	6	50307	50319	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016253	AGA	4	51282	51292	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016253	AGA	4	54130	54140	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016253	ACT	4	54656	54666	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016253	TC	6	54701	54711	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016253	AATGC	3	55040	55053	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016253	TC	6	55348	55358	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016253	TA	6	55780	55790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016253	AAG	4	56119	56129	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016253	AGT	4	56476	56486	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016253	TAG	5	56635	56649	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016253	AGA	4	58116	58127	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016253	CATTA	3	58398	58411	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016253	CAAG	3	58867	58877	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016253	AAGA	3	59132	59143	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016253	CCT	4	59589	59600	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016253	TTTC	3	60159	60171	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016253	CTCTT	3	61646	61660	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016253	AACTT	3	61840	61853	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016253	TC	6	61885	61895	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016253	AAGC	3	62088	62099	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016253	TAG	5	65276	65289	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016253	CTTA	4	65527	65542	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016253	ATTC	3	65785	65795	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016253	AGA	4	67578	67588	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016253	AGTA	3	67886	67897	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016253	AGG	4	68969	68979	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016253	GAAA	3	70457	70468	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016253	CT	7	71138	71150	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016253	AGG	4	71498	71508	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016253	TGAC	3	71514	71524	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016253	GAAG	3	71556	71567	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016253	TGAA	3	71734	71744	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016253	CTTA	3	72070	72080	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016253	TA	6	72528	72538	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016253	GCT	4	72591	72603	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016253	AAGC	3	73809	73819	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016253	AGAA	3	74215	74226	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016253	AGAA	3	75068	75078	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016253	AAGT	3	76595	76605	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016253	CTT	4	76783	76794	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016253	CTTT	4	77660	77674	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016253	TA	8	78203	78217	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016253	TTTGT	3	79766	79779	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016253	TAAA	3	80438	80450	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016253	TA	7	81599	81611	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016253	AAGA	3	81811	81821	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016253	TA	6	82260	82270	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016253	CTT	4	82345	82355	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016253	TAGA	3	82426	82437	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016253	TA	6	82974	82984	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016253	CTT	4	84050	84060	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016253	CTT	4	84146	84158	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016253	AAAT	3	84998	85010	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016253	TA	8	85206	85221	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016253	CTTATA	3	87670	87686	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
137	NC_016253	TCT	4	88038	88048	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016253	TAC	4	89264	89275	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016253	TGT	4	89987	89997	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016253	TTA	4	90104	90114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016253	AGAA	3	90280	90291	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016253	CTT	4	90503	90513	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016253	CTT	4	91577	91587	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 50