ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016252	AGA	4	511	522	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016252	AGA	4	722	733	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016252	TC	7	974	988	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016252	TC	6	1152	1162	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016252	CT	6	1282	1292	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016252	TTAC	3	1316	1327	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016252	TCT	4	1616	1627	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016252	TTC	4	1775	1785	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016252	AGA	4	2120	2131	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016252	GAA	4	2262	2273	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016252	AAG	4	2353	2364	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016252	TTGCTT	3	2631	2649	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
13	NC_016252	AGA	4	3414	3425	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016252	GAA	4	3708	3719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016252	ATA	4	4289	4300	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016252	AAG	4	4491	4502	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016252	TC	8	4642	4656	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016252	GA	6	5368	5378	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016252	AAGG	3	5631	5641	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016252	GAATG	4	6088	6106	19	40 %	20 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_016252	TCT	4	6160	6171	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016252	TCT	4	6298	6309	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016252	AG	6	6788	6798	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016252	AAAG	3	6876	6886	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016252	GAAAA	3	6897	6912	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016252	GAA	4	7100	7111	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016252	CTC	4	7253	7263	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016252	AAAG	3	7650	7660	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016252	CCTT	3	7776	7786	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016252	CTT	8	7895	7918	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016252	CTT	4	8399	8410	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016252	TA	7	8904	8917	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016252	CTT	5	9157	9170	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016252	CTT	4	9217	9228	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016252	CTCTT	3	10057	10072	16	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016252	CTTT	3	10442	10452	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016252	TC	6	10456	10466	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016252	TTTC	3	10920	10930	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016252	TTCT	3	11175	11186	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016252	CT	6	11774	11784	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016252	GGGT	3	13150	13162	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016252	ATT	4	14608	14619	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016252	TC	6	14714	14724	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016252	AG	6	15292	15303	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016252	ATTC	4	16254	16269	16	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016252	TAG	4	16627	16637	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016252	TA	6	16999	17009	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016252	CT	6	17898	17908	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016252	TGTT	3	18981	18992	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016252	TTC	4	19125	19135	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016252	CTTC	3	21909	21920	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016252	TC	6	22068	22079	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016252	TA	6	22368	22378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016252	GC	6	24640	24650	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016252	TGAA	3	28823	28833	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016252	GAG	4	29685	29696	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016252	GAGGGA	3	30006	30024	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_016252	AGAGG	3	30394	30408	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016252	TGAA	3	30826	30836	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016252	GA	6	30883	30893	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016252	CTT	4	31458	31470	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016252	AG	6	32070	32080	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016252	CTTT	4	32979	32994	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016252	CTT	4	33111	33121	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016252	CTT	4	33634	33645	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016252	TTC	4	33650	33661	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016252	CTT	4	33917	33929	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016252	AG	6	34328	34338	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016252	TTC	4	34526	34537	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016252	TTCT	3	35028	35039	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016252	CTT	4	35774	35785	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016252	CAAG	3	36050	36061	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016252	TC	6	36336	36346	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016252	AGTC	3	36459	36470	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016252	GA	7	38416	38428	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016252	AG	6	38451	38461	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016252	TTTC	3	38782	38793	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016252	GA	6	39437	39447	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016252	CGAGGA	3	40353	40369	17	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016252	CTC	4	40691	40702	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016252	AGA	4	40837	40847	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016252	AGA	4	40884	40897	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016252	AAAAGA	3	41487	41505	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
84	NC_016252	TAATCT	3	42710	42727	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016252	GA	8	43364	43378	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016252	AG	6	43744	43755	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016252	TC	6	43925	43935	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016252	AT	6	45497	45508	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016252	TC	7	46348	46360	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016252	AGTTT	3	47849	47862	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016252	TTGC	3	47931	47942	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016252	TA	6	48576	48587	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016252	CAA	5	48853	48866	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016252	AAG	4	48979	48990	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016252	TCCTTG	3	49003	49020	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016252	AAG	4	49893	49904	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016252	AGAA	3	51157	51168	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016252	CTTTT	3	51455	51469	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016252	CTT	4	51749	51760	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016252	GAATG	4	52236	52254	19	40 %	20 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_016252	TTC	4	52286	52297	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016252	CTT	4	52342	52353	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016252	CTT	4	52450	52460	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016252	CTC	4	52573	52584	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016252	TC	7	52777	52789	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016252	AAGC	3	53869	53879	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016252	GAA	4	54418	54428	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016252	CTT	4	54665	54675	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016252	GA	6	54807	54817	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016252	GA	7	54837	54849	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016252	AG	6	55031	55041	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016252	AGGA	3	55143	55153	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016252	CTT	4	55276	55287	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016252	CTT	5	56721	56734	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016252	CTT	4	57422	57433	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016252	GAGAG	4	57832	57850	19	40 %	0 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
117	NC_016252	GAG	4	57924	57935	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016252	GGA	4	57997	58008	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016252	CTT	4	60044	60055	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016252	CTT	4	60122	60133	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 112