ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 22

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016251	TA	7	580	592	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016251	CTA	4	897	907	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016251	CTT	4	1561	1573	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016251	GAG	4	2031	2042	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016251	TA	6	2070	2081	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016251	GAA	4	2760	2771	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016251	AAAAG	3	3036	3049	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016251	GCTA	3	4756	4766	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016251	GAGT	3	4788	4799	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016251	AAG	4	6237	6249	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016251	TCTT	3	7090	7100	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016251	TTTGC	3	7253	7266	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016251	TTC	4	7293	7304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016251	CTC	4	7765	7776	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016251	AGTA	3	8201	8212	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016251	TGAA	3	8438	8448	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016251	TTTC	3	9081	9093	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016251	CCTT	3	9294	9306	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016251	CTTT	3	9406	9417	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016251	CT	6	10699	10709	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016251	CTC	4	10830	10841	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016251	AGA	4	10948	10960	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016251	GAA	4	12543	12554	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016251	AT	6	13166	13177	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016251	ATA	4	13295	13305	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016251	GTAAA	3	13672	13685	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016251	CTT	4	14001	14014	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016251	AGAGGA	3	14509	14525	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016251	TGAA	3	14791	14801	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016251	GGTAT	3	15170	15184	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016251	TGAA	3	15601	15611	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016251	GA	7	15913	15925	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016251	TA	6	16102	16113	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016251	AGAA	3	17097	17108	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016251	AGAA	4	17177	17192	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016251	AGA	4	17302	17313	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016251	AGA	4	17401	17412	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016251	GAG	4	17807	17818	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016251	GA	6	18048	18058	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016251	CTTTTC	3	18346	18364	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
41	NC_016251	TGAA	3	19087	19097	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016251	AAAGG	3	19184	19198	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016251	CTT	4	19885	19897	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016251	CTTT	3	20219	20230	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016251	TTTTCT	3	20285	20302	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
46	NC_016251	TGAA	3	20497	20507	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016251	CTT	5	20896	20910	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016251	CTT	4	21059	21072	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016251	CTTT	3	21171	21182	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016251	TTAT	3	21771	21782	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016251	TA	6	22496	22507	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016251	AAGGAG	3	22834	22850	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_016251	GA	6	23068	23078	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016251	AAAG	3	23275	23286	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016251	ACAA	3	23402	23413	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016251	TAG	4	24228	24238	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016251	AGA	4	24626	24636	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016251	GAAA	3	24709	24719	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016251	CTA	4	26148	26158	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016251	CTTT	3	26323	26335	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016251	GTG	4	26679	26691	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016251	AG	6	26727	26737	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016251	AG	6	26979	26989	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016251	TCT	4	26995	27005	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016251	AAAG	3	27614	27626	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016251	TC	6	29674	29685	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016251	AT	7	29815	29827	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016251	CTT	4	30316	30327	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016251	GAA	4	31707	31719	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016251	ATTC	3	32328	32338	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016251	CTA	4	32579	32589	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016251	TCTT	3	33672	33683	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016251	CTT	4	33716	33728	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016251	AT	7	34728	34740	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016251	TAAG	3	34880	34891	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016251	ATCT	3	35022	35034	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016251	ACTC	3	35129	35139	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016251	TCT	4	35603	35614	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016251	CT	6	35931	35942	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016251	GAA	4	36372	36384	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016251	CGAA	3	36833	36845	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016251	CTT	4	38256	38268	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016251	TCT	4	38870	38881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016251	ATA	4	40081	40091	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016251	AAAG	3	41369	41379	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016251	TA	8	41449	41463	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016251	TA	6	42116	42127	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016251	CTTT	3	43535	43546	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016251	GAAA	3	43735	43745	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016251	CTTT	3	44082	44092	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016251	ACTT	3	44353	44364	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016251	GAAA	3	44495	44505	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016251	TTCG	3	44744	44754	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016251	TGA	4	46475	46486	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016251	GTCT	3	46710	46720	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016251	GCAT	3	50015	50025	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016251	TGA	4	50571	50581	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016251	AAGAA	3	52180	52194	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016251	CAT	4	52788	52799	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016251	TA	6	52994	53006	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016251	TTCTT	3	53623	53636	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016251	ATTG	3	54054	54066	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016251	ATA	4	55394	55404	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016251	GTG	4	55795	55806	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016251	TTC	4	55834	55846	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016251	AG	6	55918	55929	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016251	AG	6	56131	56141	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016251	TCT	4	56273	56284	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016251	CTT	4	56308	56318	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016251	TA	8	56813	56828	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016251	CTT	4	56952	56963	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016251	CTT	4	57313	57324	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016251	TTC	4	57374	57385	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016251	TA	6	57425	57436	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016251	CTT	5	60823	60836	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016251	GAA	4	61483	61494	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016251	TAGC	3	61533	61543	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016251	TC	6	61656	61666	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016251	TC	6	61716	61726	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016251	AAGA	3	61805	61816	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016251	AT	7	62433	62447	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016251	CTTT	3	62935	62945	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016251	TA	6	63086	63096	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016251	TTTC	3	63521	63531	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016251	TTA	4	63666	63676	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016251	TAGT	3	63697	63708	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016251	CTT	4	64311	64322	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016251	AAGG	3	65668	65679	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016251	AT	6	65854	65865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016251	CTC	4	66299	66310	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016251	TA	6	66316	66326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016251	TA	7	67022	67035	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016251	TA	6	67711	67722	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016251	TGGG	3	69276	69287	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016251	AAAG	3	70068	70078	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016251	TAT	4	70280	70290	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016251	CTTA	3	70976	70987	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016251	AGTA	3	71608	71619	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016251	AGGA	3	72812	72823	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016251	CTTT	3	73129	73139	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016251	AT	6	73835	73847	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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182	NC_016251	AAAG	3	94111	94122	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016251	AAAAG	3	94199	94212	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
184	NC_016251	CTCTCC	3	94969	94985	17	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
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191	NC_016251	TAAC	3	99584	99594	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
192	NC_016251	CTTA	3	100992	101003	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
193	NC_016251	TA	6	101585	101596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
194	NC_016251	ATAG	3	101995	102005	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
195	NC_016251	AGA	4	102697	102707	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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197	NC_016251	AAAG	3	105667	105678	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_016251	AAGGCT	3	106628	106646	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
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200	NC_016251	AAAG	3	107288	107299	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
201	NC_016251	AGC	4	108064	108075	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 22