ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 34

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016250	AAGT	3	482	492	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016250	TTTTC	3	926	940	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016250	CTT	4	1732	1744	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016250	ATAA	3	2093	2104	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016250	AAGAG	3	2877	2891	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016250	GT	6	3991	4001	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016250	AAAG	3	4094	4104	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016250	GCC	4	4661	4671	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016250	TC	6	4699	4709	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016250	TACT	3	6953	6964	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016250	AAGA	4	7319	7333	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016250	TCT	4	8258	8270	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016250	CTTT	3	9314	9325	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016250	TC	6	9432	9442	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016250	TA	7	10110	10123	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016250	TTTG	3	10795	10805	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016250	AAG	4	11587	11599	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016250	TAA	4	12309	12320	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016250	TTA	4	12782	12792	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016250	TCT	4	13130	13140	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016250	GA	7	13366	13378	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016250	GAAAA	3	13401	13414	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016250	AGG	4	15277	15288	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016250	CAT	4	15853	15864	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016250	ATTC	3	15876	15886	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016250	CT	6	18766	18776	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016250	CTTTTT	3	19297	19315	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
28	NC_016250	TTAG	4	20314	20328	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016250	AG	6	21325	21336	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016250	GCAG	3	21368	21378	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016250	ACT	5	22143	22157	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016250	TA	6	22844	22854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016250	AAGT	3	23282	23293	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016250	ATT	4	23433	23444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016250	TTA	4	23517	23528	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016250	TTTG	3	23952	23963	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016250	CTA	4	24191	24202	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016250	CT	6	24311	24322	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016250	ACTA	4	24401	24415	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016250	TTGC	3	25081	25091	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016250	TCAT	3	25900	25911	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016250	TTC	4	25921	25932	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016250	AGA	4	26732	26744	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016250	AAGA	3	26964	26975	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016250	TAATG	3	27054	27067	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016250	ACGT	3	27258	27268	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016250	TTA	4	27378	27388	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016250	CTTT	3	27843	27855	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016250	TCT	4	28033	28045	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016250	ACTTTA	3	28598	28616	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
51	NC_016250	AAGA	3	29463	29474	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016250	AATT	3	31702	31713	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016250	GAG	4	31906	31918	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016250	GT	6	33298	33308	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016250	TTTCT	3	33973	33987	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016250	AG	7	34375	34387	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016250	GGGT	3	35694	35705	12	0 %	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016250	TTTC	3	37569	37579	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016250	TTCC	3	37957	37967	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016250	CAAA	3	38860	38871	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016250	AGTC	3	39978	39988	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016250	GC	6	41010	41020	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016250	AT	6	41127	41137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016250	AAGT	3	41341	41351	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016250	CCT	4	41424	41434	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016250	CT	7	41469	41481	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016250	CT	6	41492	41502	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016250	AAG	4	42319	42330	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016250	AAG	4	42350	42361	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016250	AG	6	42731	42741	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016250	ATGC	3	43480	43490	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016250	CTTTT	3	44657	44671	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016250	TTC	4	45983	45993	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016250	CTT	4	46125	46136	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016250	CTC	4	46582	46592	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016250	CTT	4	47717	47729	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016250	GCTT	3	48769	48781	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016250	TG	6	48816	48828	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016250	TCT	4	49056	49066	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016250	ACCT	3	50546	50557	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016250	TCT	4	50612	50622	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016250	AC	7	52946	52958	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016250	CTT	4	53181	53192	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016250	TA	6	53545	53556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016250	TTTCT	3	53863	53876	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016250	AGT	4	53886	53897	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016250	CTTT	3	54299	54309	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016250	TA	6	54892	54902	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016250	TCT	5	55512	55525	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016250	GTAGAA	3	56331	56349	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
91	NC_016250	GAA	4	56439	56450	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016250	TA	6	59475	59486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016250	CTA	4	60850	60862	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016250	TA	7	60861	60873	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016250	AAAG	3	61996	62008	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016250	TC	6	62851	62862	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016250	TCTT	4	63120	63136	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016250	C	12	63397	63408	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016250	AAAG	3	63622	63634	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016250	CT	6	63867	63878	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016250	AAAAGA	3	63916	63934	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_016250	AAGA	3	64045	64056	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016250	TC	7	65880	65892	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016250	TTCC	3	67105	67116	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016250	TTTA	3	67354	67365	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016250	CTTG	3	67594	67604	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016250	AAAG	3	68896	68907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016250	AAAG	3	69168	69178	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016250	TC	7	69447	69459	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016250	TC	6	69576	69586	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016250	TCCT	3	69658	69670	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016250	TC	6	69794	69804	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016250	CG	6	70720	70731	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016250	CAAG	3	70798	70809	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016250	AAAAAG	3	71380	71397	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016250	CAAA	3	71398	71410	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016250	CG	6	72824	72835	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016250	GAAA	3	72881	72892	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016250	CTT	4	73464	73474	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016250	CCTTCT	3	74097	74113	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
121	NC_016250	TC	6	74140	74150	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016250	TGAA	3	74452	74462	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016250	AAAG	3	74511	74522	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016250	GAAA	3	74714	74726	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016250	TAA	4	74989	75000	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016250	CTTT	4	75080	75095	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016250	AAAG	3	77253	77264	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016250	TA	6	77468	77479	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016250	CT	6	77642	77652	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016250	CTTT	3	77822	77833	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016250	AT	6	77863	77874	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016250	GAAG	3	78093	78105	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016250	CTT	5	79050	79064	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016250	AGA	4	80071	80081	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016250	TA	6	80249	80260	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016250	CTT	4	81247	81258	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016250	CTTAG	3	81634	81648	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016250	GGAA	3	82830	82841	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016250	GAAA	3	83395	83406	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016250	GTTA	3	84713	84725	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016250	CTT	4	84741	84752	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016250	TA	7	84901	84914	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016250	CTT	4	85055	85066	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016250	CTT	5	86549	86563	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016250	CCTT	3	86985	86996	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016250	TA	6	87184	87195	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016250	CTT	4	87847	87857	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016250	TC	7	89303	89315	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016250	GA	7	89519	89531	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_016250	AAAGC	3	90085	90098	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016250	GGA	4	90406	90417	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016250	AG	6	90491	90501	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016250	AAGG	3	90588	90598	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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161	NC_016250	CT	6	94215	94226	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
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165	NC_016250	AAAG	3	96060	96070	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_016250	TCT	4	96280	96292	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
167	NC_016250	CATTT	3	96946	96959	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
168	NC_016250	AAAGA	3	97320	97333	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
169	NC_016250	TAGT	3	98526	98536	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
170	NC_016250	TAAG	3	100443	100454	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
171	NC_016250	TA	7	100647	100659	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
172	NC_016250	GTAGA	3	101351	101364	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 34