Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 1

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016249TAC4597959901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_016249TCT467626772110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_016249AGA5690569191566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
4NC_016249TCT473907400110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_016249GCA410350103621333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
6NC_016249TTC41071310723110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
7NC_016249TCT41128811300130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
8NC_016249TCA416138161481133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
9NC_016249CTC42355623566110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
10NC_016249TAG427102271121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016249ATG428483284951333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
12NC_016249TAG428880288901133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_016249AGA429296293071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_016249AGA434809348201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016249AAG439833398431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
16NC_016249GAA440439404511366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016249TAC543417434301433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
18NC_016249TCT44377743787110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_016249CTT44616946181130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
20NC_016249TAC450264502751233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_016249TCT45153151542120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_016249TCT45170151712120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_016249CTT45199552006120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
24NC_016249AGA452382523931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016249GAA458369583801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016249CTT45936259373120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
27NC_016249TCT46509965109110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
28NC_016249TTC46584665857120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
29NC_016249TCT46646966479110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_016249AGA468417684271166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
31NC_016249CTT47106371074120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
32NC_016249AAG471185711961266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
33NC_016249GCA572258722721533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
34NC_016249AAG482057820671166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016249GTA482810828201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
36NC_016249TCT68639886414170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
37NC_016249ATC487369873791133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
38NC_016249AGA488930889421366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
39NC_016249AGA491081910921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016249TGG49183191841110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
41NC_016249CTT59377793792160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
42NC_016249TCT49381693826110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
43NC_016249TTC49557195582120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
44NC_016249TCT49573795747110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
45NC_016249CTT5100821100834140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
46NC_016249AGA41017871017981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016249TCT4104909104920120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
48NC_016249AGA41056501056601166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
49NC_016249AAG41060021060121166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
50NC_016249GAG41102691102801233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016249TTC4120342120353120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
52NC_016249CTT4120540120550110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
53NC_016249TCT4120792120803120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
54NC_016249GAA41220451220551166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016249CTT6123189123206180 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
56NC_016249CTT4123938123949120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
57NC_016249TAT41241841241951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016249CTT4124311124322120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
59NC_016249TCT4124520124531120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
60NC_016249TCT4124550124561120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
61NC_016249GCT4125513125524120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
62NC_016249GCT4125749125760120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
63NC_016249GAA41261501261611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016249AGA41284651284761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016249AAG41292911293011166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016249AAG41299531299641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
67NC_016249GAA41299951300071366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
68NC_016249AAG41312261312371266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016249AAG41313551313661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016249CTT4133790133801120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
71NC_016249CTT4134674134684110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
72NC_016249TCT4135064135075120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
73NC_016249ATA41358781358881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_016249TCT4137471137482120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
75NC_016249TGT4137485137496120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016249CAT41379641379741133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
77NC_016249TCT4138035138046120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
78NC_016249CTT4138124138135120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
79NC_016249GGA41391231391331133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016249GAG41391461391571233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
81NC_016249CTT4139419139429110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
82NC_016249TGT4139476139487120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
83NC_016249TCT4140146140157120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
84NC_016249CTT4140315140326120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
85NC_016249AAG41411291411401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
86NC_016249TTG4142625142636120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016249CTT4142844142854110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
88NC_016249CAT41436811436911133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
89NC_016249CTC4143727143738120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
90NC_016249CTT4144934144945120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
91NC_016249TAT41453541453651233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_016249TCT5145970145984150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
93NC_016249TCT4146918146929120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
94NC_016249CTT4147058147068110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
95NC_016249CTT4149482149493120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
96NC_016249GGA41498551498661233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
97NC_016249CAT41500771500871133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
98NC_016249AGA41509671509771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016249CTT4151103151114120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
100NC_016249CTT4151200151211120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
101NC_016249CTT4151847151857110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
102NC_016249GAA41529401529511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
103NC_016249CTT4153362153374130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
104NC_016249GAG41545291545401233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
105NC_016249CTT4155035155045110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
106NC_016249TTC4155120155131120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
107NC_016249CTT4155200155211120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
108NC_016249CTT4155221155231110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
109NC_016249GAA51582701582831466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
110NC_016249CTT4158857158868120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
111NC_016249GAG41594711594811133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
112NC_016249CTT4159867159878120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
113NC_016249GAG41601221601331233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
114NC_016249TCT4160324160335120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
115NC_016249TTC4162893162904120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding