ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016249	TA	6	1614	1626	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016249	CT	6	11142	11152	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016249	TC	6	21715	21726	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016249	CT	6	22056	22067	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016249	TA	6	24461	24471	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016249	TA	6	26156	26166	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016249	TA	6	26265	26275	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016249	TA	7	26748	26760	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016249	AG	6	29152	29162	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016249	GA	7	30308	30321	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016249	AT	6	35896	35909	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016249	AT	6	39018	39028	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016249	TA	6	41453	41464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016249	TA	6	42442	42453	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016249	TA	6	49912	49923	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016249	CT	6	50504	50514	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016249	GT	6	51479	51489	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016249	AG	6	51918	51930	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016249	AT	6	64694	64705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016249	CT	6	65005	65016	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016249	AT	7	78448	78461	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016249	AG	6	83182	83193	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016249	AG	6	87260	87270	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016249	GT	6	87490	87501	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016249	AT	6	87869	87880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016249	TC	6	92142	92152	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016249	TA	6	93256	93266	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016249	TA	7	94065	94079	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016249	AT	6	97411	97422	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016249	GA	8	98835	98849	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016249	AG	6	99601	99611	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016249	TC	6	99949	99959	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016249	TA	6	100288	100299	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016249	GA	6	101940	101951	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016249	CT	6	103048	103058	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016249	CT	6	105459	105470	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016249	CT	6	105921	105932	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016249	CG	6	106255	106266	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016249	CT	6	106596	106606	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016249	CT	7	108288	108300	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016249	TA	6	109616	109627	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016249	GA	7	111666	111678	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016249	CT	7	113162	113174	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016249	GA	7	114105	114117	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016249	AG	6	118558	118568	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016249	GA	6	119221	119231	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016249	AG	7	121210	121222	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016249	AG	6	121321	121332	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016249	AT	6	124913	124924	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016249	TA	6	128598	128609	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016249	CT	6	130898	130908	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016249	CT	6	132760	132770	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016249	AG	7	133652	133664	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016249	GA	7	140573	140585	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016249	GA	7	142594	142606	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016249	GA	6	144665	144675	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016249	TA	6	152316	152327	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016249	TA	6	155445	155456	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016249	TC	7	156564	156576	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016249	TC	6	156589	156601	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016249	AG	6	157331	157341	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016249	GA	6	159261	159271	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016249	AG	6	159354	159364	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016249	TA	6	162002	162012	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 1