ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 38

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016248	CCTT	3	841	852	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016248	CTT	4	980	992	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016248	CTT	4	1023	1033	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016248	TTC	4	2042	2053	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016248	AGA	4	2275	2286	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016248	GTTTT	3	2886	2900	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016248	AAG	4	3850	3861	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016248	TA	6	4532	4543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016248	AGA	4	4934	4945	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016248	AGA	4	5051	5062	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016248	TAAGAA	3	5203	5220	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016248	CCT	4	5928	5939	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016248	TA	7	6403	6415	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016248	CTT	4	6678	6688	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016248	CT	6	6781	6792	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016248	GA	6	7129	7139	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016248	GA	7	8497	8509	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016248	GCG	4	8571	8582	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016248	AG	6	8740	8750	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016248	GAGAG	3	9309	9324	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016248	CT	6	9681	9691	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016248	TTC	4	9975	9986	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016248	TTC	5	10729	10743	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016248	TCT	4	11117	11128	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016248	CGT	4	11196	11207	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016248	CTT	4	11355	11366	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016248	CTT	4	11409	11420	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016248	AGA	4	11773	11784	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016248	TCT	4	12314	12325	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016248	CTT	5	12756	12769	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016248	CTT	4	12774	12785	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016248	TTCT	3	12802	12813	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016248	AG	6	12886	12896	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016248	CTT	4	13352	13364	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016248	AG	6	13523	13533	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016248	AT	6	13742	13752	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016248	GA	6	13969	13980	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016248	CCTT	3	14264	14275	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016248	CTT	4	14334	14344	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016248	CTT	4	14894	14905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016248	TGAA	3	15077	15087	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016248	GA	6	15140	15150	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016248	TCT	4	15415	15426	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016248	GCT	4	15439	15450	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016248	CTT	4	15717	15728	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016248	TTG	4	16079	16090	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016248	GGA	4	16269	16279	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016248	TAGAG	3	17996	18009	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016248	TCT	5	18214	18227	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016248	TCTT	3	18384	18395	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016248	CTT	4	18450	18460	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016248	AAAG	3	19097	19107	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016248	TCTT	3	19497	19509	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016248	CAT	4	19591	19601	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016248	CTT	4	20622	20632	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016248	AAAG	3	20963	20975	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016248	AT	6	21150	21161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016248	AG	6	22288	22298	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016248	AT	7	23370	23385	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016248	GGA	4	23985	23995	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016248	TAAGT	3	24006	24019	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016248	CTT	4	24961	24971	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016248	CA	6	25162	25172	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016248	GAAA	3	26308	26318	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016248	AAAG	3	26840	26851	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016248	TCGA	3	29896	29907	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016248	GACT	3	30565	30575	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016248	ATG	4	31650	31661	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016248	CT	6	32273	32286	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016248	TGT	4	32701	32711	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016248	TCT	4	33398	33408	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016248	ATCC	3	33436	33446	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016248	TAGG	3	33827	33837	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016248	CAA	4	35437	35448	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016248	ATAAGA	3	35841	35857	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016248	TA	6	36001	36012	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016248	TA	6	37075	37085	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016248	CTT	4	38570	38581	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016248	TGT	4	39083	39094	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016248	TTTCT	3	39165	39178	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016248	CTA	4	39532	39542	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016248	CTT	4	39622	39633	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016248	AACT	3	39762	39772	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016248	TATAT	3	39880	39893	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016248	AAAG	4	40132	40147	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016248	GA	7	40414	40426	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016248	GCC	4	41211	41221	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016248	GAAA	3	41882	41893	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016248	TGAA	3	42188	42198	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016248	AG	6	42224	42234	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016248	CTA	4	45106	45117	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016248	TCT	4	45425	45437	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016248	TTTC	3	45694	45705	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016248	AACC	3	47015	47025	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016248	TTCT	3	47474	47485	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016248	ATA	4	47610	47620	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016248	TAG	4	49775	49786	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016248	AAG	4	53368	53378	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016248	TACT	3	54225	54236	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016248	AGT	4	54605	54617	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016248	CTCTTT	3	55765	55781	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
102	NC_016248	TCA	4	55882	55892	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016248	G	13	56275	56287	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016248	ATTC	3	56749	56761	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016248	CTTT	3	59018	59029	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016248	TTAT	3	59118	59129	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016248	AG	6	59491	59502	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016248	CTAA	3	60901	60912	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016248	GTTA	3	61061	61073	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016248	CCCT	3	62371	62381	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016248	CGAA	3	62661	62671	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016248	AATG	3	64275	64286	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016248	TA	6	64318	64328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016248	AATG	3	65283	65294	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016248	TAGA	3	66003	66014	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016248	TA	6	66324	66334	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016248	TA	6	66618	66628	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016248	AAAG	3	66654	66665	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016248	GAT	4	66872	66882	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016248	ACTC	3	67599	67614	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016248	GAC	4	67793	67804	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016248	GTA	4	67844	67854	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016248	GCAA	3	68180	68190	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016248	AAG	4	68259	68269	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016248	TTCC	3	69187	69197	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016248	TTTA	3	69211	69222	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016248	CT	7	70230	70242	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016248	TTA	4	70831	70841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016248	TTG	4	71486	71497	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016248	ATA	4	73330	73341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016248	TCTA	4	73394	73408	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016248	CTGA	3	73525	73536	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016248	TCTT	3	73602	73613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016248	TAAA	3	73882	73893	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016248	CGC	4	74142	74152	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016248	CTT	4	74766	74777	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016248	CGCT	3	75733	75743	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016248	TA	6	77078	77088	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016248	GAAA	3	77409	77420	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016248	TGTC	3	78819	78829	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016248	AT	6	79483	79494	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016248	GAAAG	3	80926	80940	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016248	TGAT	3	82863	82873	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016248	AT	6	82879	82889	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016248	CCTT	3	83388	83398	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016248	AAGGA	3	83604	83618	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
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164	NC_016248	AC	6	95349	95360	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
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167	NC_016248	CCT	4	97660	97670	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
168	NC_016248	GCAG	3	97984	97994	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 38