ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 25

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016247	TATAT	3	467	480	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016247	ATTC	3	935	945	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016247	AGAA	3	1302	1312	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016247	AT	7	1358	1371	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016247	AAGA	3	1469	1481	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016247	AG	6	1616	1626	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016247	AGC	4	1989	1999	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016247	GCC	4	2964	2975	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016247	GCC	4	3061	3072	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016247	CTTT	4	3375	3390	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016247	TTTC	3	3915	3926	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016247	AG	6	3984	3995	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016247	CTT	4	3996	4006	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016247	CTA	4	4424	4436	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016247	CTT	4	5305	5316	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016247	TCAA	3	5748	5759	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016247	TC	6	6388	6398	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016247	CAAG	3	6887	6898	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016247	GGA	4	8259	8270	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016247	TAGT	3	8569	8580	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016247	CTT	4	8602	8613	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016247	TTC	4	9218	9229	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016247	GAC	4	9303	9313	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016247	CGTA	3	11434	11445	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016247	TCTT	3	12161	12172	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016247	CT	6	12360	12370	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016247	TTTA	3	12594	12606	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016247	TA	6	12683	12694	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016247	TTC	4	13086	13097	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016247	TCT	4	13165	13176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016247	GCT	4	15040	15052	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016247	AAAG	3	15369	15380	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016247	AG	6	16816	16826	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016247	TA	6	17986	17999	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016247	TCTT	3	19109	19120	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016247	CTTT	3	20138	20149	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016247	CT	6	20209	20219	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016247	TTC	4	20647	20659	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016247	AAGT	3	20861	20872	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016247	AGAC	3	21004	21014	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016247	TAG	5	21729	21744	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016247	CTT	4	22245	22256	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016247	CTTG	3	22391	22401	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016247	TGA	4	22759	22769	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016247	TTAC	3	22983	22995	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016247	TC	6	23583	23593	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016247	CCAA	3	24066	24076	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016247	AGA	4	24625	24636	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016247	CTTT	3	26734	26745	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016247	TTC	4	27239	27252	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016247	AAGG	3	27809	27819	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016247	TAT	4	28410	28420	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016247	CTT	4	28604	28615	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016247	TTAAGG	3	31470	31488	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
55	NC_016247	GA	6	31629	31639	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016247	TC	6	31821	31831	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016247	TA	6	31854	31865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016247	AGA	4	32282	32292	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016247	AGA	4	32442	32453	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016247	TC	6	32769	32779	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016247	GTAC	3	33159	33170	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016247	GT	7	33551	33563	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016247	TTC	4	34355	34366	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016247	CTC	5	34832	34845	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016247	CT	8	34928	34942	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016247	GA	6	35083	35093	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016247	TTCT	3	35531	35542	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016247	CTT	5	37372	37385	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016247	TCT	4	37832	37843	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016247	AGC	4	38564	38575	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016247	GAA	4	39897	39907	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016247	GCT	4	39992	40002	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016247	TCCA	3	40517	40529	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016247	TTGTC	4	40852	40870	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
75	NC_016247	CTA	4	41052	41063	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016247	TTTA	3	42478	42489	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016247	TTCA	3	42831	42841	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016247	GTA	4	43095	43105	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016247	GAGC	3	43127	43138	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016247	AT	6	43837	43848	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016247	ATATGA	3	44274	44290	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_016247	TA	6	45777	45787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016247	TCA	4	45987	45997	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016247	CTT	4	46802	46814	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016247	TA	6	47517	47528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016247	AGAA	4	48358	48373	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016247	TCT	4	50011	50021	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016247	TA	8	50022	50037	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016247	GTCTA	3	50418	50431	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016247	TAAG	3	50465	50475	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016247	TA	6	51093	51103	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016247	AT	8	52122	52136	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016247	AAAAG	3	52872	52885	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016247	GATG	3	52975	52985	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016247	TC	6	53014	53024	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016247	ATCTT	3	55855	55868	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016247	TA	6	56032	56042	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016247	ACCT	3	56419	56429	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016247	AGCT	3	56545	56556	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016247	CCTTT	3	59141	59154	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016247	AAGA	3	59688	59699	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016247	TA	10	60876	60894	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016247	GTTA	3	60915	60926	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016247	GTA	5	61157	61170	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016247	TTTC	3	61467	61477	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016247	CTTT	3	61588	61598	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016247	CTT	4	61782	61794	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016247	ACT	4	61948	61959	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016247	TAT	4	62186	62196	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016247	TTTC	3	62300	62311	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016247	AAGT	3	63154	63164	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016247	CTTT	3	64051	64063	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016247	TA	6	64869	64880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016247	GTTC	3	65607	65618	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016247	AAGA	3	66153	66164	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016247	TA	6	67705	67716	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016247	CT	6	68520	68530	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016247	TC	6	68606	68616	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016247	AGAA	3	68686	68696	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016247	AAAG	3	68781	68792	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016247	TAAG	3	69284	69294	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016247	AGA	4	70111	70121	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016247	TA	6	70347	70358	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016247	GTCA	3	70993	71005	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016247	AGA	4	71372	71382	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016247	TGAC	3	71413	71423	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016247	CT	6	72317	72327	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016247	GCTA	3	74575	74585	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016247	AACGT	3	75570	75583	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016247	AT	6	75676	75687	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016247	CGCC	3	75739	75750	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016247	TA	6	76117	76128	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016247	TAG	4	76416	76427	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016247	TC	6	76956	76966	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016247	CTT	4	77010	77020	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016247	GCA	4	77799	77810	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016247	CT	6	77921	77932	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016247	TACT	3	78081	78093	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016247	CTTA	3	78933	78943	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016247	AGG	4	80487	80499	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016247	TCT	4	80942	80953	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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177	NC_016247	AT	8	104909	104923	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
178	NC_016247	TGCT	3	105172	105183	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 25